数据分析 之 怎么看懂图 一
韦恩图怎么看
①颜色:不同颜色代表不同的集合
②)颜色重叠部分:表示相交集合共有的元素
③颜色不重叠的部分:表示改集合独有的元素
④数字:表示集合独有或共有的元素数量
⑤百分比:表示该区域元素数占整体的比例
PCA图怎么看

① 第一主成分坐标轴及主成分贡献率主成分贡献率,即每个主成分的方差在这一组变量中的总方差中所占的比例
② 纵坐标为第二主成分坐标及主成分贡献率
③分组,图中分为TNBC组和非TNBC组,探究两者之间的关系
④通常为百分之95置信区间,不同的圆圈代表不同分组。样本组之间的分离程度,距离越远,分离越显著。圆圈越紧凑表示数据点在这个主成分上的分布比较集中,反之则越分散
⑤ 表示样本的点,不同的颜色或形状表示不同的分组情况。样本点之间连线距离短,则样本之间差异性小;反之,样本之间差异大;若圆点在圆圈外,则为离散样本,无统计学意义
ROC曲线图怎么看

①:纵坐标表示真阳性率
②:横坐标表示假阳性率
③:代表无效曲线
④:AUC值,示ROC曲线下的面积,用于量化指标/模型的性能可用于两个指标/模型的性能比较,通常使用Z检验。AUC取值介于0.5与1之间,越接近1,说明指标/模型的诊断性能越好
基因表达热图怎么看

①横坐标,每一列代表一个样本
②纵坐标,每一行代表一个基因
③基因表达水平对标色阶,红色代表高表达,蓝色代表低表达
④代表不同的分组
⑤左边是基因表达模式的聚类分析的树形图,显示了基因之间的相似性,树枝越短说明基因在不同样本中的表达越相似⑥不同分组的颜色说明
GSEA图怎么看

①富集分数
②指标排名得分
③红色区域表示在上调的基因,蓝色区域表示表达下调的基因,反映了基因在条件下的表达变化趋势。
④黑色线条展示基因集中每个基因出现在基因排序列表中的位置,每一根线条代表基因集中的一个分子,可以看出那些基因再富集评分中贡献最大
⑤富集曲线表示ES评分的过程,绿色曲线的峰值表示基因集的最大富集程度。峰值为正表示富集通路上调,峰值为负表示富集通路下调⑥每个基因的排名指标得分,表示基因与表型的相关程度。零交叉点是从正变为负的位置,帮助区分正/负相关的基因。
小提琴图怎么看

①分组
②)箱体上沿为第三四分位数,表示75%的数据小于这个值
③中位数,表示数据的中间值
④箱体下沿为第一四分位数,表示25%的数据小于这个值
⑤竖线为95%置信区间,竖线上端为数据最大值,竖线下端为数据最小值
⑥表示数据中超出95%置信区间的异常值⑦小提琴的宽度表示数据分布密度
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