Graphormer部署教程：/etc/supervisor/conf.d/graphormer.conf配置解析

Graphormer部署教程/etc/supervisor/conf.d/graphormer.conf配置解析1. 项目介绍Graphormer是一种基于纯Transformer架构的图神经网络模型专门为分子图原子-键结构的全局结构建模与属性预测而设计。该模型在OGB、PCQM4M等分子基准测试中表现出色大幅超越了传统GNN模型。1.1 核心功能分子属性预测根据分子结构预测化学性质药物发现帮助识别潜在药物分子材料科学预测材料分子特性图神经网络基于分子图结构进行预测2. 环境准备2.1 硬件要求GPU推荐NVIDIA RTX 4090 24GB显存至少4GB可用显存内存建议16GB以上2.2 软件依赖以下是Graphormer运行所需的主要依赖rdkit-pypi torch-geometric ogb Gradio PyTorch 2.8.03. Supervisor配置解析3.1 配置文件位置Graphormer的Supervisor配置文件位于/etc/supervisor/conf.d/graphormer.conf3.2 配置内容详解以下是完整的配置示例及详细解析[program:graphormer] command/root/miniconda3/envs/torch28/bin/python /root/graphormer/app.py directory/root/graphormer userroot autostarttrue autorestarttrue startretries3 stderr_logfile/root/logs/graphormer.err.log stdout_logfile/root/logs/graphormer.log environmentPYTHONPATH/root/graphormer,PATH/root/miniconda3/envs/torch28/bin:%(ENV_PATH)s关键参数说明command指定Python解释器和启动脚本路径directory设置工作目录autostart设为true实现开机自启autorestart服务崩溃时自动重启environment设置必要的环境变量3.3 配置生效步骤编辑配置文件后需要执行以下命令使配置生效supervisorctl reread supervisorctl update启动服务supervisorctl start graphormer4. 服务管理4.1 常用命令操作命令查看状态supervisorctl status graphormer启动服务supervisorctl start graphormer停止服务supervisorctl stop graphormer重启服务supervisorctl restart graphormer查看日志tail -f /root/logs/graphormer.log4.2 服务状态监控服务启动后可以通过以下方式监控状态查看实时日志tail -f /root/logs/graphormer.log检查服务状态supervisorctl status graphormer常见状态说明STARTING模型正在加载首次启动可能需要几分钟RUNNING服务正常运行FATAL服务启动失败检查日志获取详细信息5. 使用指南5.1 访问服务服务运行在端口7860访问地址http://服务器地址:78605.2 预测步骤在「分子SMILES」输入框中输入分子结构选择预测任务property-guided属性预测catalyst-adsorption催化剂吸附预测点击「预测」按钮获取结果5.3 SMILES示例分子SMILES乙醇CCO苯c1ccccc1乙酸CC(O)O甲烷C水O甲醛CO6. 常见问题解决6.1 服务启动问题问题服务显示STARTING但实际已运行解决方案这是正常现象模型首次加载需要时间。等待几分钟后状态会变为RUNNING。6.2 显存不足问题运行时报显存不足错误解决方案检查GPU显存使用情况确保没有其他占用显存的进程Graphormer模型较小3.7GBRTX 4090 24GB完全可以运行6.3 端口无法访问问题无法通过7860端口访问服务解决方案检查防火墙设置确认端口已映射/暴露验证服务是否正常运行netstat -tulnp | grep 78607. 总结本文详细介绍了Graphormer分子属性预测模型的Supervisor配置方法包括配置文件各参数的含义和设置服务管理的常用命令使用方法和常见问题解决系统监控和日志查看技巧通过正确的Supervisor配置可以确保Graphormer服务稳定运行并实现开机自启和自动恢复功能为分子属性预测研究提供可靠的计算支持。获取更多AI镜像想探索更多AI镜像和应用场景访问 CSDN星图镜像广场提供丰富的预置镜像覆盖大模型推理、图像生成、视频生成、模型微调等多个领域支持一键部署。