多组学数据如何高效上传GSA？这份流程指南请收好

GSAGenome Sequence Archive基因组序列存档由中科院基因组所主办,是国内权威的组学数据存储与共享平台为全球科研人员提供基因组、转录组等高通量测序数据的提交、存储与开放获取服务支撑生命科学研究与数据共享。那么如何将多组学数据高效、合规地提交至GSA本文将结合实操经验为你梳理完整的上传流程与关键注意事项。1. 准备1.1 注册及登录账号建议使用实验室公共邮箱或PI导师的邮箱进行注册避免因学生毕业离职导致账号无法找回激活注册后需查收激活邮件。若未收到请检查垃圾邮件或将 big.ac.cn 加入白名单1.2 数据库选择1 普通数据动植物、微生物等选择 GSA数据库2人类遗传资源数据选择GSA-Human 子库需进行科技部备案或审批2.信息收集类型信息项目项目标题/涉及领域/项目说明/项目资金来源/项目数据类型/样本涉及范围样本数据类型/样本名称/样本描述/物种/组织类型/性别/年龄实验数据实验信息/材料来源/设计策略/测序平台/模式/数据格式/数据及MD5检验码3.上传流程GSA的数据结构是层级式的BioProject (项目) - BioSample (样本) - GSA (数据)需按顺序创建。步骤描述Step1创建BioProject对研究项目的总体描述一个BioProject可包含多个BioSampleStep2创建BioSample收集生物样本信息每一个独立的生物学样本都应该创建一个对应的BioSampleStep3创建 GSA 数据集实验信息、数据等元数据信息提交、修改和数据文件上传3.1创建BioProject(1) 进入BioProject提交入口- 新建 BioProject(2) 跳转新界面依次补充信息保存并进入下一步信息栏必填项01提交者信息姓名/邮箱/单位/国家/城市/街道/邮编02基本信息项目标题/涉及领域/项目说明/项目资金来源-项目批准号可无03项目类型项目数据类型可多选/样本范围根据提示选择04出版信息无05概览 提交确认信息点击提交(3) 提交后系统会分配一个 BioProject 编号请记录下来下一步要用。3.2创建BioSample(1) 在系统首页点击BioSample - 新建 BioSample(2) 跳转新界面依次补充信息保存并进入下一步。信息栏必填项01提交者信息姓名/邮箱/单位/国家/城市/街道/邮编02基本信息项目编号BioProject 编号03样本类型根据提示选择样本类型04样本属性下载Excel模板补充信息样本名称、描述、物种、性别、器官等信息后提交文件05概览 提交确认信息点击提交(3) 提交后系统会分配一个提交编号3.3创建 GSA 数据集(1)在系统首页点击 GSA/GSA-Human - 新建GSA(2) 跳转新界面依次补充信息保存并进入下一步信息栏必填项01提交者信息姓名/邮箱/单位/国家/城市/街道/邮编02基本信息数据标题/描述信息/项目编号BioProject 编号03元数据信息下载Excel模板补充信息Experiment Sheet实验信息、材料来源、测序平台、设计策略等信息Run Sheet: 测序数据的样本名称数据格式MD5检验码等信息04文件提交数据可选ftp格式根据提示上传数据05概览 提交确认信息点击提交(3) 提交后系统会分配一个 GSA 编号, 等待审核审核通过后你将获得一个CRA编号至此数据提交即告完成。多组学数据不仅是论文的支撑更关乎国家战略资源安全。GSA作为国内权威平台致力于为高质量数据提供安全、规范的存储环境。按本文流程完成提交你收获的不仅是一个编号更是一份对科研诚信与数据主权的承诺。愿每一份数据资产都能在合规轨道上释放长久的科学价值。