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DeepPurpose 生物化学深度学习库；蛋白靶点小分子药物对接亲和力预测虚拟筛选

news 2025/9/14 5:18:41

参考：
https://blog.csdn.net/c9Yv2cf9I06K2A9E/article/details/107649770
https://github.com/kexinhuang12345/DeepPurpose

##安装
pip install DeepPurpose rdkit

在这里插入图片描述

DeepPurpose包括：
数据：
关联TDC库下载，是同一作者开发的
https://blog.csdn.net/weixin_42357472/article/details/128081957

模型：
小分子表示方法
在这里插入图片描述

蛋白表示方法

蛋白靶点小分子药

DeepPurpose 生物化学深度学习库；蛋白靶点小分子药物对接亲和力预测虚拟筛选

参考： https://blog.csdn.net/c9Yv2cf9I06K2A9E/article/details/107649770 https://github.com/kexinhuang12345/DeepPurpose ##安装 pip install DeepPurpose rdkitDeepPurpose包括：数据：关联TDC库下载，是同一作者开发的 https://blog.csdn.net/weixin_42357472/artic…...

编程日记 2024/1/9 5:47:14

Java实现责任链模式

责任链模式是一种设计模式，用于处理请求的解耦。在责任链模式中，多个对象都有机会处理请求，从而避免了请求发送者和接收者之间的直接依赖关系。每个处理者都可以决定是否处理请求以及将请求传递给下一个处理者。简介责任链模式由一条链组…...

编程日记 2024/1/9 5:46:12

rabbitmq延时队列相关配置

确保 RabbitMQ 的延时消息插件已经安装和启用。你可以通过执行以下命令来安装该插件： rabbitmq-plugins enable rabbitmq_delayed_message_exchange 如果提示未安装，以下是安装流程： 查看mq版本： 查看自己使用的 MQ（…...

编程日记 2024/1/9 5:45:11

【工具】推荐一个好用的代码画图工具

PlantUML 官网地址：https://plantuml.com/zh/ 跳转支持各种结构化数据画图支持代码调用jar包生成图片提供在线画图能力 https://www.plantuml.com/plantuml/uml/SyfFKj2rKt3CoKnELR1Io4ZDoSa70000 有兴趣可以尝试下 over~~...

编程日记 2024/1/9 5:44:10

Leetcode14-判断句子是否为全字母句（1832）

1、题目全字母句指包含英语字母表中每个字母至少一次的句子。给你一个仅由小写英文字母组成的字符串 sentence ，请你判断 sentence 是否为全字母句。如果是，返回 true ；否则，返回 false 。示例 1： 输入&am…...

编程日记 2024/1/9 5:42:08

HTTP和TCP代理原理及实现，主要是理解

Web 代理是一种存在于网络中间的实体，提供各式各样的功能。现代网络系统中，Web 代理无处不在。我之前有关 HTTP 的博文中，多次提到了代理对 HTTP 请求及响应的影响。今天这篇文章，我打算谈谈 HTTP 代理本身的一些原理，…...

编程日记 2024/1/9 5:40:06

MySQL中的连接池

数据库的连接池 1 ）概述网站连接数据库，为庞大用户的每次请求创建一个连接是不合适的关闭并重新连接的成本是很大的处理方法：设置最大值, 最小值, 设置最多闲置连接，设置等待阻塞 2 ）示例演示 import threading i…...

编程日记 2024/1/9 5:35:02

css计时器 animation实现计时器延时器

css计时器 animation实现计时器延时器缺点当切页面导航会休眠不执行最初需求是一个列表每个项目都有各自的失效时间然后就想到计时器延时器轮询等方案这些方案每一个都要有自己的计时器感觉不是很好轮询也占资源然后突发奇想 css能不能实现开始想到的是transition测…...

编程日记 2024/1/9 5:29:56

【win11 绕过TPM CPU硬件限制安装】

Qt编程指南 VX：hao541022348 ■ 下载iso文件■ 右键文件点击装载出现如下问题■ 绕过TPM CPU硬件限制安装方法■ 虚拟机安装win11 ■ 下载iso文件选择Windows11 （multi-edition ISO）在选择中文 ■ 右键文件点击装载出现如下问题 ■ 绕过T…...

编程日记 2024/1/9 5:28:55

k8s的yaml文件中的kind类型都有哪些？（清单版本）

在操作kubernetes的过程中，我们接触到的yaml文件中的kind类型有很多。他们代表了kubernetes的不同类型的对象，了解了kind的类型，也就相当于了解了k8s都有哪些类型的对象。类型清单及概要说明序号类型简述1Pod一个Kubernetes中最基本的资源…...

编程日记 2024/1/9 5:25:51

Jetpack Room使用

Room使用回顾数据库有多张表，一张表只能记录一种Class，Class的具体属性是这个表的列；所有对表的操作都要通过Dao来访问注解说明： Enity 作用于Class上，表示创建一张表记录该Class，Class内部属性使用…...

编程日记 2024/1/9 5:24:50

HarmonyOS应用开发之ArkTS语言学习记录

1、ArkTS介绍 ArkTS是鸿蒙生态的应用开发语言。它在保持TypeScript（简称TS）基本语法风格的基础上，对TS的动态类型特性施加更严格的约束，引入静态类型。同时，提供了声明式UI、状态管理等相应的能力，让开发者…...

编程日记 2024/1/9 5:23:49

windows 下 mongodb6.0 导入导出json文件

1.运行cmd窗口，进入MongoDB安装路径下的bin文件下，输入以下命令导入数据文件 mongoimport --host 127.0.0.1 --port 27017 --db <数据库名称，根据自个情况> -c <集合名称，自定义> --file <导入文件的路径名> …...

编程日记 2024/1/9 5:22:48

如何给 unplugin-vue-components/vite 写一个简单的 resolver

大部分工作 unplugin-vue-components 都已经处理好了, 我们只需要接收组件名来判断是否是自己的组件, 然后处理对应的导入逻辑。一共 3 个字段 as 重命名类似 import { componentNameReName } from ‘xxxx’name 组件名 import { componentName } from ‘xxxx’from 导入路径…...

编程日记 2024/1/9 5:21:47

MYSQL篇--索引高频面试题

mysql索引 1什么是索引？ 索引说白了就是一种数据结构，可以协助快速查询数据，以及更新数据库表中的数据，更通俗的来说索引其实就是目录，通过对数据建立索引形成目录，便于去查询数据，而mysql索引…...

编程日记 2024/1/9 5:20:46

视频号小店怎么上架商品？实操分享，干货满满！

我是电商珠珠视频号小店从22年7月到现在也不过才发展了一年，它的风口才刚刚开始。平台为了吸引商家入驻，会将大量红利向商家倾斜，只要把握住风口，就会很快起飞。视频号小店对于很多人来说，都是新平台&#xff0c…...

编程日记 2024/1/9 5:18:45

Python 常用数据类型

Python 常用数据类型有以下这些： 数据类型中文解析例子int整数，表示整数值1、2float浮点数，表示带有小数点的数值3.14、2.718complex复数，表示实部和虚部组成的复数12j、3-4jstr字符串，表示文本数据，用引号…...

编程日记 2024/1/9 5:16:43

基于yolov2深度学习网络的车辆行人检测算法matlab仿真

目录 1.算法运行效果图预览 2.算法运行软件版本 3.部分核心程序 4.算法理论概述 5.算法完整程序工程 1.算法运行效果图预览 2.算法运行软件版本 MATLAB2022a 3.部分核心程序 .......................................................... load yolov2.mat% 加载训练好的…...

编程日记 2024/1/9 5:15:42

【QT】中英文切换

很高兴在雪易的CSDN遇见你前言本文分享QT中如何进行中英文切换，希望对各位小伙伴有所帮助！ 感谢各位小伙伴的点赞关注，小易会继续努力分享，一起进步！ 你的点赞就是我的动力(＾Ｕ&#xff3e…...

编程日记 2024/1/9 5:14:41

vue实现代码编辑器,无坑使用CodeMirror

vue实现代码编辑器,无坑使用CodeMirror vue实现代码编辑器,使用codemirror5 坑：本打算cv一下网上的，结果发现网上的博客教程都是错的，而且博客已经是几年前的了，我重新看了github上的，发现安装的命令都已经不一样了。我…...

编程日记 2024/1/9 5:11:39

Java 加密常用的各种算法及其选择

在数字化时代，数据安全至关重要，Java 作为广泛应用的编程语言，提供了丰富的加密算法来保障数据的保密性、完整性和真实性。了解这些常用加密算法及其适用场景，有助于开发者在不同的业务需求中做出正确的选择。一、对称加密算法…...

编程新知 2025/7/7 7:20:27

HBuilderX安装（uni-app和小程序开发）

下载HBuilderX 访问官方网站：https://www.dcloud.io/hbuilderx.html 根据您的操作系统选择合适版本： Windows版（推荐下载标准版） Windows系统安装步骤运行安装程序： 双击下载的.exe安装文件如果出现安全提示&…...

编程新知 2025/9/12 22:54:50

3-11单元格区域边界定位(End属性)学习笔记

返回一个Range 对象，只读。该对象代表包含源区域的区域上端下端左端右端的最后一个单元格。等同于按键 End 向上键(End(xlUp))、End向下键(End(xlDown))、End向左键(End(xlToLeft)End向右键(End(xlToRight)) 注意：它移动的位置必须是相连的有内容的单元格…...

编程新知 2025/9/7 8:51:17

使用 Streamlit 构建支持主流大模型与 Ollama 的轻量级统一平台

🎯 使用 Streamlit 构建支持主流大模型与 Ollama 的轻量级统一平台 📌 项目背景随着大语言模型（LLM）的广泛应用，开发者常面临多个挑战：各大模型（OpenAI、Claude、Gemini、Ollama）接口风格不统一；缺乏一个统一平台进行模型调用与测试；本地模型 Ollama 的集成与前…...

编程新知 2025/9/7 8:50:27

2025年渗透测试面试题总结-腾讯[实习]科恩实验室-安全工程师（题目+回答）

安全领域各种资源，学习文档，以及工具分享、前沿信息分享、POC、EXP分享。不定期分享各种好玩的项目及好用的工具，欢迎关注。目录腾讯[实习]科恩实验室-安全工程师一、网络与协议 1. TCP三次握手 2. SYN扫描原理 3. HTTPS证书机制二…...

编程新知 2025/9/3 6:48:19

Linux nano命令的基本使用

参考资料 GNU nanoを使いこなすnano基础目录一. 简介二. 文件打开2.1 普通方式打开文件2.2 只读方式打开文件三. 文件查看3.1 打开文件时，显示行号3.2 翻页查看四. 文件编辑4.1 Ctrl K 复制和 Ctrl U 粘贴4.2 Alt/Esc U 撤回五. 文件保存与退出5.1 Ctrl …...

编程新知 2025/9/3 14:21:06

go 里面的指针

指针在 Go 中，指针（pointer）是一个变量的内存地址，就像 C 语言那样： a : 10 p : &a // p 是一个指向 a 的指针 fmt.Println(*p) // 输出 10，通过指针解引用• &a 表示获取变量 a 的地址 p 表示…...

编程新知 2025/8/18 12:09:07

MySQL的pymysql操作

本章是MySQL的最后一章，MySQL到此完结，下一站Hadoop！！！ 这章很简单，完整代码在最后，详细讲解之前python课程里面也有，感兴趣的可以往前找一下一、查询操作我们需要打开pycharm …...

编程新知 2025/9/5 23:31:07

CppCon 2015 学习:Time Programming Fundamentals

Civil Time 公历时间特点： 共 6 个字段： Year（年）Month（月）Day（日）Hour（小时）Minute（分钟）Second（秒） 表示…...

编程新知 2025/8/31 6:14:21

怎么开发一个网络协议模块（C语言框架）之(六) ——通用对象池总结(核心)

+---------------------------+ | operEntryTbl[] | ← 操作对象池 (对象数组) +---------------------------+ | 0 | 1 | 2 | ... | N-1 | +---------------------------+↓ 初始化时全部加入 +------------------------+ +-------------------------+ | …...

编程新知 2025/8/28 4:17:05

蛋白靶点小分子药

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