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DeepPurpose 生物化学深度学习库；蛋白靶点小分子药物对接亲和力预测虚拟筛选

news 2025/7/5 0:06:17

参考：
https://blog.csdn.net/c9Yv2cf9I06K2A9E/article/details/107649770
https://github.com/kexinhuang12345/DeepPurpose

##安装
pip install DeepPurpose rdkit

在这里插入图片描述

DeepPurpose包括：
数据：
关联TDC库下载，是同一作者开发的
https://blog.csdn.net/weixin_42357472/article/details/128081957

模型：
小分子表示方法
在这里插入图片描述

蛋白表示方法

蛋白靶点小分子药

DeepPurpose 生物化学深度学习库；蛋白靶点小分子药物对接亲和力预测虚拟筛选

参考： https://blog.csdn.net/c9Yv2cf9I06K2A9E/article/details/107649770 https://github.com/kexinhuang12345/DeepPurpose ##安装 pip install DeepPurpose rdkitDeepPurpose包括：数据：关联TDC库下载，是同一作者开发的 https://blog.csdn.net/weixin_42357472/artic…...

编程日记 2024/1/9 5:47:14

Java实现责任链模式

责任链模式是一种设计模式，用于处理请求的解耦。在责任链模式中，多个对象都有机会处理请求，从而避免了请求发送者和接收者之间的直接依赖关系。每个处理者都可以决定是否处理请求以及将请求传递给下一个处理者。简介责任链模式由一条链组…...

编程日记 2024/1/9 5:46:12

rabbitmq延时队列相关配置

确保 RabbitMQ 的延时消息插件已经安装和启用。你可以通过执行以下命令来安装该插件： rabbitmq-plugins enable rabbitmq_delayed_message_exchange 如果提示未安装，以下是安装流程： 查看mq版本： 查看自己使用的 MQ（…...

编程日记 2024/1/9 5:45:11

【工具】推荐一个好用的代码画图工具

PlantUML 官网地址：https://plantuml.com/zh/ 跳转支持各种结构化数据画图支持代码调用jar包生成图片提供在线画图能力 https://www.plantuml.com/plantuml/uml/SyfFKj2rKt3CoKnELR1Io4ZDoSa70000 有兴趣可以尝试下 over~~...

编程日记 2024/1/9 5:44:10

Leetcode14-判断句子是否为全字母句（1832）

1、题目全字母句指包含英语字母表中每个字母至少一次的句子。给你一个仅由小写英文字母组成的字符串 sentence ，请你判断 sentence 是否为全字母句。如果是，返回 true ；否则，返回 false 。示例 1： 输入&am…...

编程日记 2024/1/9 5:42:08

HTTP和TCP代理原理及实现，主要是理解

Web 代理是一种存在于网络中间的实体，提供各式各样的功能。现代网络系统中，Web 代理无处不在。我之前有关 HTTP 的博文中，多次提到了代理对 HTTP 请求及响应的影响。今天这篇文章，我打算谈谈 HTTP 代理本身的一些原理，…...

编程日记 2024/1/9 5:40:06

MySQL中的连接池

数据库的连接池 1 ）概述网站连接数据库，为庞大用户的每次请求创建一个连接是不合适的关闭并重新连接的成本是很大的处理方法：设置最大值, 最小值, 设置最多闲置连接，设置等待阻塞 2 ）示例演示 import threading i…...

编程日记 2024/1/9 5:35:02

css计时器 animation实现计时器延时器

css计时器 animation实现计时器延时器缺点当切页面导航会休眠不执行最初需求是一个列表每个项目都有各自的失效时间然后就想到计时器延时器轮询等方案这些方案每一个都要有自己的计时器感觉不是很好轮询也占资源然后突发奇想 css能不能实现开始想到的是transition测…...

编程日记 2024/1/9 5:29:56

【win11 绕过TPM CPU硬件限制安装】

Qt编程指南 VX：hao541022348 ■ 下载iso文件■ 右键文件点击装载出现如下问题■ 绕过TPM CPU硬件限制安装方法■ 虚拟机安装win11 ■ 下载iso文件选择Windows11 （multi-edition ISO）在选择中文 ■ 右键文件点击装载出现如下问题 ■ 绕过T…...

编程日记 2024/1/9 5:28:55

k8s的yaml文件中的kind类型都有哪些？（清单版本）

在操作kubernetes的过程中，我们接触到的yaml文件中的kind类型有很多。他们代表了kubernetes的不同类型的对象，了解了kind的类型，也就相当于了解了k8s都有哪些类型的对象。类型清单及概要说明序号类型简述1Pod一个Kubernetes中最基本的资源…...

编程日记 2024/1/9 5:25:51

Jetpack Room使用

Room使用回顾数据库有多张表，一张表只能记录一种Class，Class的具体属性是这个表的列；所有对表的操作都要通过Dao来访问注解说明： Enity 作用于Class上，表示创建一张表记录该Class，Class内部属性使用…...

编程日记 2024/1/9 5:24:50

HarmonyOS应用开发之ArkTS语言学习记录

1、ArkTS介绍 ArkTS是鸿蒙生态的应用开发语言。它在保持TypeScript（简称TS）基本语法风格的基础上，对TS的动态类型特性施加更严格的约束，引入静态类型。同时，提供了声明式UI、状态管理等相应的能力，让开发者…...

编程日记 2024/1/9 5:23:49

windows 下 mongodb6.0 导入导出json文件

1.运行cmd窗口，进入MongoDB安装路径下的bin文件下，输入以下命令导入数据文件 mongoimport --host 127.0.0.1 --port 27017 --db <数据库名称，根据自个情况> -c <集合名称，自定义> --file <导入文件的路径名> …...

编程日记 2024/1/9 5:22:48

如何给 unplugin-vue-components/vite 写一个简单的 resolver

大部分工作 unplugin-vue-components 都已经处理好了, 我们只需要接收组件名来判断是否是自己的组件, 然后处理对应的导入逻辑。一共 3 个字段 as 重命名类似 import { componentNameReName } from ‘xxxx’name 组件名 import { componentName } from ‘xxxx’from 导入路径…...

编程日记 2024/1/9 5:21:47

MYSQL篇--索引高频面试题

mysql索引 1什么是索引？ 索引说白了就是一种数据结构，可以协助快速查询数据，以及更新数据库表中的数据，更通俗的来说索引其实就是目录，通过对数据建立索引形成目录，便于去查询数据，而mysql索引…...

编程日记 2024/1/9 5:20:46

视频号小店怎么上架商品？实操分享，干货满满！

我是电商珠珠视频号小店从22年7月到现在也不过才发展了一年，它的风口才刚刚开始。平台为了吸引商家入驻，会将大量红利向商家倾斜，只要把握住风口，就会很快起飞。视频号小店对于很多人来说，都是新平台&#xff0c…...

编程日记 2024/1/9 5:18:45

Python 常用数据类型

Python 常用数据类型有以下这些： 数据类型中文解析例子int整数，表示整数值1、2float浮点数，表示带有小数点的数值3.14、2.718complex复数，表示实部和虚部组成的复数12j、3-4jstr字符串，表示文本数据，用引号…...

编程日记 2024/1/9 5:16:43

基于yolov2深度学习网络的车辆行人检测算法matlab仿真

目录 1.算法运行效果图预览 2.算法运行软件版本 3.部分核心程序 4.算法理论概述 5.算法完整程序工程 1.算法运行效果图预览 2.算法运行软件版本 MATLAB2022a 3.部分核心程序 .......................................................... load yolov2.mat% 加载训练好的…...

编程日记 2024/1/9 5:15:42

【QT】中英文切换

很高兴在雪易的CSDN遇见你前言本文分享QT中如何进行中英文切换，希望对各位小伙伴有所帮助！ 感谢各位小伙伴的点赞关注，小易会继续努力分享，一起进步！ 你的点赞就是我的动力(＾Ｕ&#xff3e…...

编程日记 2024/1/9 5:14:41

vue实现代码编辑器,无坑使用CodeMirror

vue实现代码编辑器,无坑使用CodeMirror vue实现代码编辑器,使用codemirror5 坑：本打算cv一下网上的，结果发现网上的博客教程都是错的，而且博客已经是几年前的了，我重新看了github上的，发现安装的命令都已经不一样了。我…...

编程日记 2024/1/9 5:11:39

挑战杯推荐项目

“人工智能”创意赛 - 智能艺术创作助手：借助大模型技术，开发能根据用户输入的主题、风格等要求，生成绘画、音乐、文学作品等多种形式艺术创作灵感或初稿的应用，帮助艺术家和创意爱好者激发创意、提高创作效率。 - 个性化梦境…...

编程新知 2025/6/17 7:15:49

云原生核心技术 (7/12): K8s 核心概念白话解读(上)：Pod 和 Deployment 究竟是什么？

大家好，欢迎来到《云原生核心技术》系列的第七篇！ 在上一篇，我们成功地使用 Minikube 或 kind 在自己的电脑上搭建起了一个迷你但功能完备的 Kubernetes 集群。现在，我们就像一个拥有了一块崭新数字土地的农场主，是时…...

编程新知 2025/7/4 6:48:09

超短脉冲激光自聚焦效应

前言与目录强激光引起自聚焦效应机理超短脉冲激光在脆性材料内部加工时引起的自聚焦效应，这是一种非线性光学现象，主要涉及光学克尔效应和材料的非线性光学特性。自聚焦效应可以产生局部的强光场，对材料产生非线性响应，可能…...

编程新知 2025/6/30 10:59:47

label-studio的使用教程(导入本地路径)

文章目录 1. 准备环境2. 脚本启动2.1 Windows2.2 Linux 3. 安装label-studio机器学习后端3.1 pip安装(推荐)3.2 GitHub仓库安装 4. 后端配置4.1 yolo环境4.2 引入后端模型4.3 修改脚本4.4 启动后端 5. 标注工程5.1 创建工程5.2 配置图片路径5.3 配置工程类型标签5.4 配置模型5.…...

编程新知 2025/7/4 2:16:32

rknn优化教程（二）

文章目录 1. 前述2. 三方库的封装2.1 xrepo中的库2.2 xrepo之外的库2.2.1 opencv2.2.2 rknnrt2.2.3 spdlog 3. rknn_engine库 1. 前述 OK，开始写第二篇的内容了。这篇博客主要能写一下： 如何给一些三方库按照xmake方式进行封装，供调用如何按…...

编程新知 2025/6/11 15:25:30

模型参数、模型存储精度、参数与显存

模型参数量衡量单位 M：百万（Million） B：十亿（Billion） 1 B 1000 M 1B 1000M 1B1000M 参数存储精度模型参数是固定的，但是一个参数所表示多少字节不一定，需要看这个参数以什么…...

编程新知 2025/6/18 8:29:05

云启出海，智联未来｜阿里云网络「企业出海」系列客户沙龙上海站圆满落地

借阿里云中企出海大会的东风，以**「云启出海，智联未来｜打造安全可靠的出海云网络引擎」为主题的阿里云企业出海客户沙龙云网络&安全专场于5.28日下午在上海顺利举办，现场吸引了来自携程、小红书、米哈游、哔哩哔哩、波克城市、…...

编程新知 2025/7/4 12:58:57

postgresql|数据库|只读用户的创建和删除（备忘）

CREATE USER read_only WITH PASSWORD 密码 -- 连接到xxx数据库 \c xxx -- 授予对xxx数据库的只读权限 GRANT CONNECT ON DATABASE xxx TO read_only; GRANT USAGE ON SCHEMA public TO read_only; GRANT SELECT ON ALL TABLES IN SCHEMA public TO read_only; GRANT EXECUTE O…...

编程新知 2025/6/21 18:39:26

JVM 内存结构详解

内存结构运行时数据区： Java虚拟机在运行Java程序过程中管理的内存区域。程序计数器： 线程私有，程序控制流的指示器，分支、循环、跳转、异常处理、线程恢复等基础功能都依赖这个计数器完成。每个线程都有一个程序计数…...

编程新知 2025/6/26 15:45:55

动态 Web 开发技术入门篇

一、HTTP 协议核心 1.1 HTTP 基础协议全称 ：HyperText Transfer Protocol（超文本传输协议） 默认端口 ：HTTP 使用 80 端口，HTTPS 使用 443 端口。请求方法 ： GET ：用于获取资源，…...

编程新知 2025/6/21 15:51:18

蛋白靶点小分子药

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