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DeepPurpose 生物化学深度学习库；蛋白靶点小分子药物对接亲和力预测虚拟筛选

news 2025/12/17 14:41:29

参考：
https://blog.csdn.net/c9Yv2cf9I06K2A9E/article/details/107649770
https://github.com/kexinhuang12345/DeepPurpose

##安装
pip install DeepPurpose rdkit

在这里插入图片描述

DeepPurpose包括：
数据：
关联TDC库下载，是同一作者开发的
https://blog.csdn.net/weixin_42357472/article/details/128081957

模型：
小分子表示方法
在这里插入图片描述

蛋白表示方法

蛋白靶点小分子药

DeepPurpose 生物化学深度学习库；蛋白靶点小分子药物对接亲和力预测虚拟筛选

参考： https://blog.csdn.net/c9Yv2cf9I06K2A9E/article/details/107649770 https://github.com/kexinhuang12345/DeepPurpose ##安装 pip install DeepPurpose rdkitDeepPurpose包括：数据：关联TDC库下载，是同一作者开发的 https://blog.csdn.net/weixin_42357472/artic…...

编程日记 2024/1/9 5:47:14

Java实现责任链模式

责任链模式是一种设计模式，用于处理请求的解耦。在责任链模式中，多个对象都有机会处理请求，从而避免了请求发送者和接收者之间的直接依赖关系。每个处理者都可以决定是否处理请求以及将请求传递给下一个处理者。简介责任链模式由一条链组…...

编程日记 2024/1/9 5:46:12

rabbitmq延时队列相关配置

确保 RabbitMQ 的延时消息插件已经安装和启用。你可以通过执行以下命令来安装该插件： rabbitmq-plugins enable rabbitmq_delayed_message_exchange 如果提示未安装，以下是安装流程： 查看mq版本： 查看自己使用的 MQ（…...

编程日记 2024/1/9 5:45:11

【工具】推荐一个好用的代码画图工具

PlantUML 官网地址：https://plantuml.com/zh/ 跳转支持各种结构化数据画图支持代码调用jar包生成图片提供在线画图能力 https://www.plantuml.com/plantuml/uml/SyfFKj2rKt3CoKnELR1Io4ZDoSa70000 有兴趣可以尝试下 over~~...

编程日记 2024/1/9 5:44:10

Leetcode14-判断句子是否为全字母句（1832）

1、题目全字母句指包含英语字母表中每个字母至少一次的句子。给你一个仅由小写英文字母组成的字符串 sentence ，请你判断 sentence 是否为全字母句。如果是，返回 true ；否则，返回 false 。示例 1： 输入&am…...

编程日记 2024/1/9 5:42:08

HTTP和TCP代理原理及实现，主要是理解

Web 代理是一种存在于网络中间的实体，提供各式各样的功能。现代网络系统中，Web 代理无处不在。我之前有关 HTTP 的博文中，多次提到了代理对 HTTP 请求及响应的影响。今天这篇文章，我打算谈谈 HTTP 代理本身的一些原理，…...

编程日记 2024/1/9 5:40:06

MySQL中的连接池

数据库的连接池 1 ）概述网站连接数据库，为庞大用户的每次请求创建一个连接是不合适的关闭并重新连接的成本是很大的处理方法：设置最大值, 最小值, 设置最多闲置连接，设置等待阻塞 2 ）示例演示 import threading i…...

编程日记 2024/1/9 5:35:02

css计时器 animation实现计时器延时器

css计时器 animation实现计时器延时器缺点当切页面导航会休眠不执行最初需求是一个列表每个项目都有各自的失效时间然后就想到计时器延时器轮询等方案这些方案每一个都要有自己的计时器感觉不是很好轮询也占资源然后突发奇想 css能不能实现开始想到的是transition测…...

编程日记 2024/1/9 5:29:56

【win11 绕过TPM CPU硬件限制安装】

Qt编程指南 VX：hao541022348 ■ 下载iso文件■ 右键文件点击装载出现如下问题■ 绕过TPM CPU硬件限制安装方法■ 虚拟机安装win11 ■ 下载iso文件选择Windows11 （multi-edition ISO）在选择中文 ■ 右键文件点击装载出现如下问题 ■ 绕过T…...

编程日记 2024/1/9 5:28:55

k8s的yaml文件中的kind类型都有哪些？（清单版本）

在操作kubernetes的过程中，我们接触到的yaml文件中的kind类型有很多。他们代表了kubernetes的不同类型的对象，了解了kind的类型，也就相当于了解了k8s都有哪些类型的对象。类型清单及概要说明序号类型简述1Pod一个Kubernetes中最基本的资源…...

编程日记 2024/1/9 5:25:51

Jetpack Room使用

Room使用回顾数据库有多张表，一张表只能记录一种Class，Class的具体属性是这个表的列；所有对表的操作都要通过Dao来访问注解说明： Enity 作用于Class上，表示创建一张表记录该Class，Class内部属性使用…...

编程日记 2024/1/9 5:24:50

HarmonyOS应用开发之ArkTS语言学习记录

1、ArkTS介绍 ArkTS是鸿蒙生态的应用开发语言。它在保持TypeScript（简称TS）基本语法风格的基础上，对TS的动态类型特性施加更严格的约束，引入静态类型。同时，提供了声明式UI、状态管理等相应的能力，让开发者…...

编程日记 2024/1/9 5:23:49

windows 下 mongodb6.0 导入导出json文件

1.运行cmd窗口，进入MongoDB安装路径下的bin文件下，输入以下命令导入数据文件 mongoimport --host 127.0.0.1 --port 27017 --db <数据库名称，根据自个情况> -c <集合名称，自定义> --file <导入文件的路径名> …...

编程日记 2024/1/9 5:22:48

如何给 unplugin-vue-components/vite 写一个简单的 resolver

大部分工作 unplugin-vue-components 都已经处理好了, 我们只需要接收组件名来判断是否是自己的组件, 然后处理对应的导入逻辑。一共 3 个字段 as 重命名类似 import { componentNameReName } from ‘xxxx’name 组件名 import { componentName } from ‘xxxx’from 导入路径…...

编程日记 2024/1/9 5:21:47

MYSQL篇--索引高频面试题

mysql索引 1什么是索引？ 索引说白了就是一种数据结构，可以协助快速查询数据，以及更新数据库表中的数据，更通俗的来说索引其实就是目录，通过对数据建立索引形成目录，便于去查询数据，而mysql索引…...

编程日记 2024/1/9 5:20:46

视频号小店怎么上架商品？实操分享，干货满满！

我是电商珠珠视频号小店从22年7月到现在也不过才发展了一年，它的风口才刚刚开始。平台为了吸引商家入驻，会将大量红利向商家倾斜，只要把握住风口，就会很快起飞。视频号小店对于很多人来说，都是新平台&#xff0c…...

编程日记 2024/1/9 5:18:45

Python 常用数据类型

Python 常用数据类型有以下这些： 数据类型中文解析例子int整数，表示整数值1、2float浮点数，表示带有小数点的数值3.14、2.718complex复数，表示实部和虚部组成的复数12j、3-4jstr字符串，表示文本数据，用引号…...

编程日记 2024/1/9 5:16:43

基于yolov2深度学习网络的车辆行人检测算法matlab仿真

目录 1.算法运行效果图预览 2.算法运行软件版本 3.部分核心程序 4.算法理论概述 5.算法完整程序工程 1.算法运行效果图预览 2.算法运行软件版本 MATLAB2022a 3.部分核心程序 .......................................................... load yolov2.mat% 加载训练好的…...

编程日记 2024/1/9 5:15:42

【QT】中英文切换

很高兴在雪易的CSDN遇见你前言本文分享QT中如何进行中英文切换，希望对各位小伙伴有所帮助！ 感谢各位小伙伴的点赞关注，小易会继续努力分享，一起进步！ 你的点赞就是我的动力(＾Ｕ&#xff3e…...

编程日记 2024/1/9 5:14:41

vue实现代码编辑器,无坑使用CodeMirror

vue实现代码编辑器,无坑使用CodeMirror vue实现代码编辑器,使用codemirror5 坑：本打算cv一下网上的，结果发现网上的博客教程都是错的，而且博客已经是几年前的了，我重新看了github上的，发现安装的命令都已经不一样了。我…...

编程日记 2024/1/9 5:11:39

浅谈 React Hooks

React Hooks 是 React 16.8 引入的一组 API，用于在函数组件中使用 state 和其他 React 特性（例如生命周期方法、context 等）。Hooks 通过简洁的函数接口，解决了状态与 UI 的高度解耦，通过函数式编程范式实现更灵活 Rea…...

编程新知 2025/9/23 15:13:40

Cursor实现用excel数据填充word模版的方法

cursor主页：https://www.cursor.com/ 任务目标：把excel格式的数据里的单元格，按照某一个固定模版填充到word中文章目录注意事项逐步生成程序1. 确定格式2. 调试程序注意事项直接给一个excel文件和最终呈现的word文件的示例，…...

编程新知 2025/8/23 5:46:26

SciencePlots——绘制论文中的图片

文章目录安装一、风格二、1 资源安装 # 安装最新版 pip install githttps://github.com/garrettj403/SciencePlots.git# 安装稳定版 pip install SciencePlots一、风格简单好用的深度学习论文绘图专用工具包–Science Plot 二、 1 资源论文绘图神器来了：一行…...

编程新知 2025/9/8 13:50:07

vscode（仍待补充）

写于2025 6.9 主包将加入vscode这个更权威的圈子 vscode的基本使用侧边栏 vscode还能连接ssh？ debug时使用的launch文件 1.task.json {"tasks": [{"type": "cppbuild","label": "C/C: gcc.exe 生成活动文件"…...

编程新知 2025/12/17 13:07:40

服务器硬防的应用场景都有哪些？

服务器硬防是指一种通过硬件设备层面的安全措施来防御服务器系统受到网络攻击的方式，避免服务器受到各种恶意攻击和网络威胁，那么，服务器硬防通常都会应用在哪些场景当中呢？ 硬防服务器中一般会配备入侵检测系统和预防系统&#x…...

编程新知 2025/11/9 19:17:07

质量体系的重要

质量体系是为确保产品、服务或过程质量满足规定要求，由相互关联的要素构成的有机整体。其核心内容可归纳为以下五个方面： 🏛️ 一、组织架构与职责质量体系明确组织内各部门、岗位的职责与权限，形成层级清晰的管理网络&#xf…...

编程新知 2025/10/24 9:13:44

Python实现prophet 理论及参数优化

文章目录 Prophet理论及模型参数介绍Python代码完整实现prophet 添加外部数据进行模型优化之前初步学习prophet的时候，写过一篇简单实现，后期随着对该模型的深入研究，本次记录涉及到prophet 的公式以及参数调优，从公式可以更直观…...

编程新知 2025/12/15 20:41:46

Matlab | matlab常用命令总结

常用命令一、基础操作与环境二、矩阵与数组操作（核心）三、绘图与可视化四、编程与控制流五、符号计算 (Symbolic Math Toolbox)六、文件与数据 I/O七、常用函数类别重要提示这是一份 MATLAB 常用命令和功能的总结，涵盖了基础操作、矩阵运算、绘图、编程和文件处理等…...

编程新知 2025/8/11 1:05:59

ardupilot 开发环境eclipse 中import 缺少C++

目录文章目录目录摘要1.修复过程摘要本节主要解决ardupilot 开发环境eclipse 中import 缺少C++，无法导入ardupilot代码，会引起查看不方便的问题。如下图所示 1.修复过程 0.安装ubuntu 软件中自带的eclipse 1.打开eclipse—Help—install new software 2.在 Work with中…...

编程新知 2025/12/10 20:47:41

根据万维钢·精英日课6的内容，使用AI（2025）可以参考以下方法：

根据万维钢精英日课6的内容，使用AI（2025）可以参考以下方法： 四个洞见模型已经比人聪明：以ChatGPT o3为代表的AI非常强大，能运用高级理论解释道理、引用最新学术论文，生成对顶尖科学家都有用的…...

编程新知 2025/10/15 12:45:18

蛋白靶点小分子药

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