成功案例（IF=7.3）| 转录组+蛋白质组+代谢组联合分析分析揭示胰腺癌中TAM2相关的糖酵解和丙酮酸代谢重构

研究背景

肿瘤的进展和发展需要癌细胞的代谢重编程，癌细胞能量代谢模式的改变可以满足快速增殖和适应肿瘤微环境的需要。肿瘤微环境（TME）中的代谢状态受到多种因素的影响，包括血管生成、与其他细胞的相互作用和系统代谢。代谢异质性可影响治疗效果，并可能预测临床结果。然而，很少有研究关注基于代谢异质性来区分亚型的方法。

胰腺癌（PAAD）是一种预后不良、死亡率高的恶性肿瘤。肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的大量浸润是PAAD的一个显著特征。TAMs可与胰腺癌细胞相互作用，调节代谢、炎症和免疫状态，形成免疫抑制TME，最终促进肿瘤的发生和发展。研究表明，巨噬细胞会影响胰腺癌细胞的生物学功能，如葡萄糖代谢。然而，目前仍缺乏一种结合TAM和代谢相关特征来识别PAAD新分子亚型的方法。代谢亚型为新一代癌症治疗的患者分类提供了一个独特的视角，因此，根据免疫代谢特性开发新的分子亚型对提高精准医疗至关重要。

本研究中，作者根据多组学方法将PAAD分为4个具有不同免疫代谢特征的代谢亚型，并探讨了检测到的代谢亚型在PAAD的临床特征、预后和治疗中的作用，旨在为PAAD的免疫治疗提供新的认识。

研究思路

研究结论

在本研究中，作者基于多组学分析策略，将PAAD样本分为具有不同代谢特征的分子亚型。收集20个PAAD组织和10个正常胰腺组织用于蛋白质组学和代谢组学分析。来自TCGA-PAAD队列的RNA测序数据用于转录组学分析。采用免疫组化方法评估PAAD组织中TAM2的浸润情况。转录组学和免疫组化结果显示，PAAD中TAM2浸润水平上调，并与患者预后不良相关。蛋白质组学和代谢组学结果表明，PAAD中多种代谢过程被异常调控，这种失调与TAM2浸润水平有关。WGCNA证实了丙酮酸和糖酵解/糖异生是TAM2在PAAD中共同表达的代谢途径。基于转录组数据，作者将PAAD样本分为4种与TAM2相关的代谢亚型。代谢亚型各具有临床预后、肿瘤微环境、免疫细胞浸润、化疗药物敏感性和功能机制等特征。该研究证实了PAAD中丙酮酸的代谢重构和糖酵解/糖异生与TAM2密切相关，且基于TAM2相关代谢通路的分子亚型为PAAD患者的预后预测和治疗提供了新的见解。