当前位置： 首页 > news >正文

科研绘图系列：R语言circos图（circos plot）

news 2025/11/1 14:24:31

介绍

Circos图是一种数据可视化工具，它以圆形布局展示数据，通常用于显示数据之间的关系和模式。这种图表特别适合于展示分层数据或网络关系。Circos图的一些关键特点包括：

  1. 圆形布局：数据被组织在一个或多个同心圆中，每个圆可以代表不同的数据维度或层次。
  2. 扇区：每个圆被划分为若干扇区，每个扇区可以代表一个数据项或类别。扇区的大小、颜色或标签可以表示数据的不同属性。
  3. 链接：数据项之间的连接可以用线条或曲线表示，显示它们之间的关系或相互作用。
  4. 交互性：虽然传统的Circos图可能不具备交互性，但现代的实现（如使用R语言的Circos包）可以增加交互功能，允许用户通过鼠标悬停或点击来获取更多信息。

加载R包

knitr::opts_chunk$set(warning = F, message = F)
library(tidyverse)
library(grid)
library(circlize)
library(ComplexHeatmap)grp <- c("HTN", "Normal")
color_group <- c("#EE2B2B", "#2D6BB4")
color_sample <- c('#8DD3C7', '#FFFFB3

相关文章：

科研绘图系列：R语言circos图（circos plot）

介绍 Circos图是一种数据可视化工具，它以圆形布局展示数据，通常用于显示数据之间的关系和模式。这种图表特别适合于展示分层数据或网络关系。Circos图的一些关键特点包括： 圆形布局：数据被组织在一个或多个同心圆中，每个圆可以代表不同的数据维度或层次。扇区：每个圆被划…...

编程日记 2024/7/20 6:22:52

追踪Conda包的踪迹：深入探索依赖关系与管理

追踪Conda包的踪迹&#xff1a;深入探索依赖关系与管理 Conda作为Python和其他科学计算语言的包管理器&#xff0c;不仅提供了安装、更新和卸载包的功能&#xff0c;还有一个强大的包跟踪功能&#xff0c;帮助用户理解包之间的依赖关系和管理环境。本文将详细解释如何在Conda中…...

编程日记 2024/7/20 6:21:51

苹果电脑pdf合并软件 苹果电脑合并pdf 苹果电脑pdf怎么合并

在数字化办公日益普及的今天&#xff0c;pdf文件因其跨平台兼容性强、格式稳定等特点&#xff0c;已经成为工作、学习和生活中不可或缺的文件格式。然而&#xff0c;我们常常面临一个问题&#xff1a;如何将多个pdf文件合并为一个&#xff1f;这不仅有助于文件的整理和管理&…...

编程日记 2024/7/20 6:20:50

axios(ajax请求库)

json-server(搭建http服务) json-server用来快速搭建模拟的REST API的工具包 使用json-server 下载&#xff1a;npm install -g json-server创建数据库json文件&#xff1a;db.json开启服务&#xff1a;json-srver --watch db.json axios的基本使用 <!doctype html>…...

编程日记 2024/7/20 6:16:46

Ideal窗口中左右侧栏消失了

不知道大家在工作过程中有没有遇到过此类问题&#xff0c;不论是Maven项目还是Gradle项目&#xff0c;突然发现Ideal窗口右侧图标丢失了&#xff0c;同事今天突然说大象图标不见了&#xff0c;不知道怎样刷新gradle。 不要慌张&#xff0c;下面提供一些解决思路&#xff1a; 1…...

编程日记 2024/7/20 6:15:46

麦芒30全新绽放，中国电信勾勒出AI手机的新方向

高通总裁兼CEO克里斯蒂亚诺阿蒙曾在媒体采访时表示&#xff1a;2024年将成为全球AI手机元年&#xff0c;生成式AI正在“非常快”的进入手机。 把大模型装进手机&#xff0c;由此成了智能终端演进的新方向。三星、华为、OPPO、小米等品牌动作频频&#xff0c;纷纷抢滩AI手机市场…...

编程日记 2024/7/20 6:14:45

​数据结构之初始二叉树（3）

找往期文章包括但不限于本期文章中不懂的知识点&#xff1a; 个人主页&#xff1a;我要学编程(ಥ_ಥ)-CSDN博客 所属专栏&#xff1a;数据结构&#xff08;Java版&#xff09; 二叉树的基本操作 通过上篇文章的学习&#xff0c;我们简单的了解了二叉树的相关操作。接下来就是有…...

编程日记 2024/7/20 6:13:43

egret 白鹭的编译太慢了 自己写了一个

用的swc 他会检测git的改变 const simpleGit require(simple-git); const fs require(fs); const path require(path); // 初始化 simple-git const swc require(swc/core); const baseDir D:\\project; const gameDir game\\module\\abcdefg; const gitDir D:\\projec…...

编程日记 2024/7/20 6:12:43

＜数据集＞pcb板缺陷检测数据集＜目标检测＞

数据集格式&#xff1a;VOCYOLO格式 图片数量&#xff1a;693张 标注数量(xml文件个数)&#xff1a;693 标注数量(txt文件个数)&#xff1a;693 标注类别数&#xff1a;6 标注类别名称&#xff1a;[missing_hole, mouse_bite, open_circuit, short, spurious_copper, spur…...

编程日记 2024/7/20 6:10:40

实验四：图像的锐化处理

目录 一、实验目的 二、实验原理 1. 拉普拉斯算子 2. Sobel算子 3. 模板大小对滤波的影响 三、实验内容 四、源程序和结果 (1) 主程序（matlab） (2) 函数GrayscaleFilter (3) 函数MatrixAbs 五、结果分析 1. 拉普拉斯滤波 2. Sobel滤波 3. 不同大小模板的滤波…...

编程日记 2024/7/20 6:09:38

【Linux】权限的管理和Linux上的一些工具

文章目录 权限管理chgrpchownumaskfile指令sudo指令 目录权限粘滞位Linux中的工具1.软件包管理器yum2.rzsz Linux开发工具vim 总结 权限管理 chgrp 功能&#xff1a;修改文件或目录的所属组 格式&#xff1a;chgrp [参数] 用户组名 文件名 常用选项&#xff1a;-R 递归修改文…...

编程日记 2024/7/20 6:08:37

ES6 字符串的新增方法（二十）

1. String.prototype.startsWith(searchString, position) 特性&#xff1a;判断字符串是否以指定的子字符串开始。 用法&#xff1a;检查字符串的开始部分。 const str "Hello World"; console.log(str.startsWith("Hello")); // 输出&#xff1a;true…...

编程日记 2024/7/20 6:07:35

如何将MP3或WAV文件解码成PCM文件

文章目录 概要整体架构流程技术细节 概要 本文介绍使用 FFmpeg&#xff0c;将MP3或WAV文件解码成PCM文件的方法。 整体架构流程 首先&#xff0c;使用的 FFmpeg 库要支持 MP3/WAV 解码功能&#xff0c;即编译的时候要加上&#xff08;编译 FFmpeg 库可以参考&#xff1a;Win…...

编程日记 2024/7/20 6:06:34

OpenAI 推出 GPT-4o mini，一种更小、更便宜的人工智能模型

OpenAI 最近推出了新型人工智能模型 GPT-4o mini&#xff0c;以其较小体积和低成本受到关注。这款模型在文本和视觉推理任务上性能优越&#xff0c;且比现有小型模型更快、更经济。GPT-4o mini 已向开发者和消费者发布&#xff0c;企业用户将在下周获得访问权限。 喜好儿网 在…...

编程日记 2024/7/20 6:05:33

Nacos 服务发现（订阅）源码分析（服务端）

前言&#xff1a; 前文我们分析了 Nacos 服务发现&#xff08;订阅&#xff09;的流程&#xff0c;从 Nacos Client 端的源码分析了服务发现的过程&#xff0c;服务发现最终还是要调用 Nacos Server 端来获取服务信息&#xff0c;缓存到客户端本地&#xff0c;并且会定时向 Na…...

编程日记 2024/7/20 6:04:33

DICOM CT\MR片子免费在线查看工具；python pydicom包加载查看；mayavi 3d查看

DICOM CT\MR片子免费在线查看工具 参考&#xff1a; https://zhuanlan.zhihu.com/p/668804209 dicom格式&#xff1a; DICOM&#xff08;Digital Imaging and Communications in Medicine&#xff09;是医学数字成像和通信的标准。它定义了医学图像&#xff08;如CT、MRI、X…...

编程日记 2024/7/20 6:02:30

VSCode远程连接Ubuntu/Linux

文章目录 前言SSH&#xff08;Secure Shell&#xff09;简介主要功能工作原理常见的 SSH 客户端和服务器 Ubuntu安装sshvscode远程插件安装远程插件开始远程连接 打开文件夹新建终端 总结 前言 在现代开发环境中&#xff0c;远程工作和跨平台开发变得越来越普遍。Visual Studi…...

编程日记 2024/7/20 6:00:29

【Nginx80端口被占用】80端口被System占用如何解决【已解决】

【Nginx80端口被占用】80端口被System占用如何解决【已解决】 01 问题背景 Nginx 版本 1.19及以上80端口被System占用&#xff0c;无法kill tcp6 0 0 :::111 :::* LISTEN 1/systemd tcp6 0 0 :::80 :::* LISTEN 1/systemd 执行以下代码无效&…...

编程日记 2024/7/20 5:59:25

云计算的发展历程与边缘计算

云计算的发展历程 初期发展&#xff08;1960s-1990s&#xff09; 概念萌芽&#xff1a;云计算的概念可以追溯到1960年代&#xff0c;当时约翰麦卡锡&#xff08;John McCarthy&#xff09;提出了“计算将来可能成为一种公共设施”的想法。这个概念类似于现代的云计算&#xf…...

编程日记 2024/7/20 5:58:24

199.二叉树的右视图（DFS）

给定一个二叉树的根节点 root&#xff0c;想象自己站在它的右侧&#xff0c;按照从顶部到底部的顺序&#xff0c;返回从右侧所能看到的节点值。 示例 1: 输入: [1,2,3,null,5,null,4] 输出: [1,3,4] 示例 2: 输入: [1,null,3] 输出: [1,3] 示例 3: 输入: [] 输出: [] 解题…...

编程日记 2024/7/20 5:57:23

深入剖析AI大模型：大模型时代的 Prompt 工程全解析

今天聊的内容&#xff0c;我认为是AI开发里面非常重要的内容。它在AI开发里无处不在&#xff0c;当你对 AI 助手说 "用李白的风格写一首关于人工智能的诗"&#xff0c;或者让翻译模型 "将这段合同翻译成商务日语" 时&#xff0c;输入的这句话就是 Prompt。…...

编程新知 2025/10/30 20:34:49

进程地址空间（比特课总结）

一、进程地址空间 1. 环境变量 1 &#xff09;⽤户级环境变量与系统级环境变量 全局属性&#xff1a;环境变量具有全局属性&#xff0c;会被⼦进程继承。例如当bash启动⼦进程时&#xff0c;环 境变量会⾃动传递给⼦进程。 本地变量限制&#xff1a;本地变量只在当前进程(ba…...

编程新知 2025/7/9 17:20:48

uni-app学习笔记二十二---使用vite.config.js全局导入常用依赖

在前面的练习中&#xff0c;每个页面需要使用ref&#xff0c;onShow等生命周期钩子函数时都需要像下面这样导入 import {onMounted, ref} from "vue" 如果不想每个页面都导入&#xff0c;需要使用node.js命令npm安装unplugin-auto-import npm install unplugin-au…...

编程新知 2025/9/14 18:41:15

Leetcode 3577. Count the Number of Computer Unlocking Permutations

Leetcode 3577. Count the Number of Computer Unlocking Permutations 1. 解题思路2. 代码实现 题目链接&#xff1a;3577. Count the Number of Computer Unlocking Permutations 1. 解题思路 这一题其实就是一个脑筋急转弯&#xff0c;要想要能够将所有的电脑解锁&#x…...

编程新知 2025/10/19 0:02:23

Python实现prophet 理论及参数优化

文章目录 Prophet理论及模型参数介绍Python代码完整实现prophet 添加外部数据进行模型优化 之前初步学习prophet的时候&#xff0c;写过一篇简单实现&#xff0c;后期随着对该模型的深入研究&#xff0c;本次记录涉及到prophet 的公式以及参数调优&#xff0c;从公式可以更直观…...

编程新知 2025/10/28 5:42:30

【单片机期末】单片机系统设计

主要内容&#xff1a;系统状态机&#xff0c;系统时基&#xff0c;系统需求分析&#xff0c;系统构建&#xff0c;系统状态流图 一、题目要求 二、绘制系统状态流图 题目&#xff1a;根据上述描述绘制系统状态流图&#xff0c;注明状态转移条件及方向。 三、利用定时器产生时…...

编程新知 2025/10/28 19:03:33

【Oracle】分区表

个人主页&#xff1a;Guiat 归属专栏&#xff1a;Oracle 文章目录 1. 分区表基础概述1.1 分区表的概念与优势1.2 分区类型概览1.3 分区表的工作原理 2. 范围分区 (RANGE Partitioning)2.1 基础范围分区2.1.1 按日期范围分区2.1.2 按数值范围分区 2.2 间隔分区 (INTERVAL Partit…...

编程新知 2025/10/28 16:17:02

Vite中定义@软链接

在webpack中可以直接通过符号表示src路径&#xff0c;但是vite中默认不可以。 如何实现&#xff1a; vite中提供了resolve.alias&#xff1a;通过别名在指向一个具体的路径 在vite.config.js中 import { join } from pathexport default defineConfig({plugins: [vue()],//…...

编程新知 2025/10/17 2:32:49

从面试角度回答Android中ContentProvider启动原理

Android中ContentProvider原理的面试角度解析&#xff0c;分为​​已启动​​和​​未启动​​两种场景&#xff1a; 一、ContentProvider已启动的情况 1. ​​核心流程​​ ​​触发条件​​&#xff1a;当其他组件&#xff08;如Activity、Service&#xff09;通过ContentR…...

编程新知 2025/10/2 19:46:59

离线语音识别方案分析

随着人工智能技术的不断发展&#xff0c;语音识别技术也得到了广泛的应用&#xff0c;从智能家居到车载系统&#xff0c;语音识别正在改变我们与设备的交互方式。尤其是离线语音识别&#xff0c;由于其在没有网络连接的情况下仍然能提供稳定、准确的语音处理能力&#xff0c;广…...

编程新知 2025/9/22 13:00:25