当前位置: 首页 > news >正文

生信技能63 - 构建gnomAD变异位点的SQLite查询数据库

将数据量巨大的gnomAD数据库,通过SQLite数据库寻找gnomAD中存在的各种变异注释信息(如等位基因计数,深度,次要等位基因频率等),查询300.000个变量的查询需要大约40秒,通过染色体编号+位置+REF+ALT即可进行快速查询。

1. gnomAD变异注释VCF文件字段

gnomAD VCF各版本包含的大约23个变体注释列如下所示:

base_columns:- CHROM- POS- REF- ALT- FILTER
v2:- AC # Alternate allele count for 

相关文章:

生信技能63 - 构建gnomAD变异位点的SQLite查询数据库

将数据量巨大的gnomAD数据库,通过SQLite数据库寻找gnomAD中存在的各种变异注释信息(如等位基因计数,深度,次要等位基因频率等),查询300.000个变量的查询需要大约40秒,通过染色体编号+位置+REF+ALT即可进行快速查询。 1. gnomAD变异注释VCF文件字段 gnomAD VCF各版本包…...

0x0118消息 WM_SYSTIMER

0x0118消息就是WM_SYSTIMER 编辑框出现输入光标时,产生的消息. 0x0118 would be the undocumented WM_SYSTIMER, which appears to be used for caret blinks. 0x0118是一个undocument 消息, 微软没有记录。 但在一些库的源码中可以看到,比如ATL的库文…...

【机器学习】机器学习的基本分类-无监督学习(Unsupervised Learning)

无监督学习(Unsupervised Learning) 无监督学习是一种机器学习方法,主要用于没有标签的数据集。其目标是从数据中挖掘出潜在的结构和模式。常见的无监督学习任务包括 聚类、降维、密度估计 和 异常检测。 1. 无监督学习的核心目标 1.1 聚类…...

[代码随想录09]字符串2的总结

前言 处理字符串主要是有思路,同时总结方法。 题目链接 151. 反转字符串中的单词 - 力扣(LeetCode) 55. 右旋字符串(第八期模拟笔试) 一、翻转字符串里的单词 这个题目的主要思路,代码采用从后往前遍历字…...

java注解(一):什么是注解?什么是元注解?如何自定义注解?注解的原理是什么?

目录 1、什么是注解? 2、什么是元注解 1、Target() 2、Retention() 3、Documented 4、Inherited 3、如何自定义注解以解使用 4、注解的原理 本篇文章主要是介绍注解的概念、原理,以及通过代码演示4种元注解、如何自定义注解。通过反编译的形式进…...

AD20 原理图库更新到原理图

一 点击工具,从库更新。快捷键TL 二 点击完成 三 执行变更,最后点击关闭...

.NET用C#导入Excel数据到数据库

将Excel文件中的数据导入到数据库中不仅能够提升数据处理的效率和准确性,还能极大地促进数据分析和决策制定的过程。尤其在企业级应用中,Excel作为数据输入和初步整理的工具非常普遍,但其功能对于复杂查询、大规模数据管理和跨部门的数据共享…...

小身躯大能量-供热系统通过EtherCAT转Profinet网关进行升级

在现代工业自动化领域,通信技术的进步对于提高系统效率、稳定性和可靠性起着至关重要的作用。EtherCAT(Ethernet for Control Automation Technology)作为一种实时以太网解决方案,因其高性能及成本效益高等特点,在众多…...

Android11.0系统关闭App所有通知

通过广播接收方式&#xff0c;根据包名关闭App所有通知。 packages/apps/Settings$ git diff diff --git a/AndroidManifest.xml b/AndroidManifest.xml index d4c54c6ed8..1ce7d4136f 100644 --- a/AndroidManifest.xmlb/AndroidManifest.xml-106,6 106,7 <uses-permissio…...

# issue 8 TCP内部原理和UDP编程

TCP 通信三大步骤&#xff1a; 1 三次握手建立连接; 2 开始通信&#xff0c;进行数据交换; 3 四次挥手断开连接&#xff1b; 一、TCP内部原理--三次握手 【第一次握手】套接字A∶"你好&#xff0c;套接字B。我这儿有数据要传给你&#xff0c;建立连接吧。" 【第二次…...

力扣100题--移动零

给定一个数组 nums&#xff0c;编写一个函数将所有 0 移动到数组的末尾&#xff0c;同时保持非零元素的相对顺序。 请注意 &#xff0c;必须在不复制数组的情况下原地对数组进行操作。 示例 1: 输入: nums [0,1,0,3,12] 输出: [1,3,12,0,0]示例 2: 输入: nums [0] 输出: […...

Spring 邮件发送

Spring 邮件发送 1. 主要内容&#xff08;了解&#xff09; 2. JavaMail 概述&#xff08;了解&#xff09; JavaMail&#xff0c;顾名思义&#xff0c;提供给开发者处理电⼦邮件相关的编程接⼝。JavaMail 是由 Sun 定义的⼀套收发电⼦邮件的 API&#xff0c;它可以⽅便地执⾏⼀…...

利用 360 安全卫士极速版关闭电脑开机自启动软件教程

在使用电脑的过程中&#xff0c;过多的开机自启动软件会严重拖慢电脑的开机速度&#xff0c;影响我们的使用体验。本教程中简鹿办公将详细介绍如何使用 360 安全卫士极速版关闭电脑开机自启动软件&#xff0c;让您的电脑开机更加迅速流畅。 一、打开 360 安全卫士极速版 在电…...

楼房销售系统

文末获取源码和万字论文&#xff0c;制作不易&#xff0c;感谢点赞支持。 毕 业 设 计&#xff08;论 文&#xff09; 题目&#xff1a;楼房销售系统设计与实现 摘 要 现代经济快节奏发展以及不断完善升级的信息化技术&#xff0c;让传统数据信息的管理升级为软件存储&#xf…...

UML箭线图的理解和实践

在软件开发的世界里&#xff0c;UML&#xff08;统一建模语言&#xff09;作为一种标准化的建模语言&#xff0c;扮演着举足轻重的角色。UML类图更是软件开发设计和架构过程中的核心工具&#xff0c;它不仅能帮助开发者明确系统中的类及其关系&#xff0c;还能为后续的代码实现…...

Qt入门8——Qt文件

1. Qt文件概述 文件操作是应用程序必不可少的部分。Qt作为⼀个通用开发库&#xff0c;提供了跨平台的文件操作能力。Qt 提供了很多关于文件的类&#xff0c;通过这些类能够对文件系统进行操作&#xff0c;如文件读写、文件信息获取、文件复制或重命名等。 2. 输入输出设备类 在…...

鸿翼受邀出席2024海峡两岸档案暨缩微学术交流会

近日&#xff0c;由中国档案学会、中国文献影像技术协会共同主办&#xff0c;中华档案暨资讯微缩管理学会参加的2024年海峡两岸档案暨缩微学术交流会在乌鲁木齐召开。鸿翼联合创始人兼CTO罗永秀受邀出席本次交流会并作主题分享。 自1992年以来&#xff0c;该学术交流会已连续举…...

支持win7系统的onnxruntime

在win7 X86系统上&#xff0c;使用了onnxruntime.dll库做AI识别&#xff0c;但是在win7上运行报0xc0000005的错误 经查&#xff0c;ONNX Runtime从v1.15.0版本开始不再支持Windows 7及其之前的操作系统&#xff0c;即便尝试重新编译源代码亦无法在这些老系统上运行&#xff0c;…...

如何利用内链策略提升网站的整体权重?

内链是谷歌SEO中常常被低估的部分&#xff0c;实际上&#xff0c;合理的内链策略不仅能帮助提升页面间的关联性&#xff0c;还可以增强网站的整体权重。通过正确的内链布局&#xff0c;用户可以更流畅地浏览你的网站&#xff0c;谷歌爬虫也能更快地抓取到更多页面&#xff0c;有…...

鸿蒙分享(二):引入zrouter路由跳转+封装

码仓库&#xff1a;https://gitee.com/linguanzhong/share_harmonyos 鸿蒙api:12 鸿蒙第三方库地址&#xff1a;OpenHarmony三方库中心仓 zrouter地址&#xff1a;OpenHarmony三方库中心仓 1.引入zrouter 1.打开终端界面&#xff1a;输入 ohpm install hzw/zrouter 2.在项目…...

IDEA运行Tomcat出现乱码问题解决汇总

最近正值期末周&#xff0c;有很多同学在写期末Java web作业时&#xff0c;运行tomcat出现乱码问题&#xff0c;经过多次解决与研究&#xff0c;我做了如下整理&#xff1a; 原因&#xff1a; IDEA本身编码与tomcat的编码与Windows编码不同导致&#xff0c;Windows 系统控制台…...

docker详细操作--未完待续

docker介绍 docker官网: Docker&#xff1a;加速容器应用程序开发 harbor官网&#xff1a;Harbor - Harbor 中文 使用docker加速器: Docker镜像极速下载服务 - 毫秒镜像 是什么 Docker 是一种开源的容器化平台&#xff0c;用于将应用程序及其依赖项&#xff08;如库、运行时环…...

树莓派超全系列教程文档--(61)树莓派摄像头高级使用方法

树莓派摄像头高级使用方法 配置通过调谐文件来调整相机行为 使用多个摄像头安装 libcam 和 rpicam-apps依赖关系开发包 文章来源&#xff1a; http://raspberry.dns8844.cn/documentation 原文网址 配置 大多数用例自动工作&#xff0c;无需更改相机配置。但是&#xff0c;一…...

OkHttp 中实现断点续传 demo

在 OkHttp 中实现断点续传主要通过以下步骤完成&#xff0c;核心是利用 HTTP 协议的 Range 请求头指定下载范围&#xff1a; 实现原理 Range 请求头&#xff1a;向服务器请求文件的特定字节范围&#xff08;如 Range: bytes1024-&#xff09; 本地文件记录&#xff1a;保存已…...

Qt Http Server模块功能及架构

Qt Http Server 是 Qt 6.0 中引入的一个新模块&#xff0c;它提供了一个轻量级的 HTTP 服务器实现&#xff0c;主要用于构建基于 HTTP 的应用程序和服务。 功能介绍&#xff1a; 主要功能 HTTP服务器功能&#xff1a; 支持 HTTP/1.1 协议 简单的请求/响应处理模型 支持 GET…...

Mac软件卸载指南,简单易懂!

刚和Adobe分手&#xff0c;它却总在Library里给你写"回忆录"&#xff1f;卸载的Final Cut Pro像电子幽灵般阴魂不散&#xff1f;总是会有残留文件&#xff0c;别慌&#xff01;这份Mac软件卸载指南&#xff0c;将用最硬核的方式教你"数字分手术"&#xff0…...

全面解析各类VPN技术:GRE、IPsec、L2TP、SSL与MPLS VPN对比

目录 引言 VPN技术概述 GRE VPN 3.1 GRE封装结构 3.2 GRE的应用场景 GRE over IPsec 4.1 GRE over IPsec封装结构 4.2 为什么使用GRE over IPsec&#xff1f; IPsec VPN 5.1 IPsec传输模式&#xff08;Transport Mode&#xff09; 5.2 IPsec隧道模式&#xff08;Tunne…...

ip子接口配置及删除

配置永久生效的子接口&#xff0c;2个IP 都可以登录你这一台服务器。重启不失效。 永久的 [应用] vi /etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-eth0修改文件内内容 TYPE"Ethernet" BOOTPROTO"none" NAME"eth0" DEVICE"eth0" ONBOOT&q…...

短视频矩阵系统文案创作功能开发实践,定制化开发

在短视频行业迅猛发展的当下&#xff0c;企业和个人创作者为了扩大影响力、提升传播效果&#xff0c;纷纷采用短视频矩阵运营策略&#xff0c;同时管理多个平台、多个账号的内容发布。然而&#xff0c;频繁的文案创作需求让运营者疲于应对&#xff0c;如何高效产出高质量文案成…...

iOS性能调优实战:借助克魔(KeyMob)与常用工具深度洞察App瓶颈

在日常iOS开发过程中&#xff0c;性能问题往往是最令人头疼的一类Bug。尤其是在App上线前的压测阶段或是处理用户反馈的高发期&#xff0c;开发者往往需要面对卡顿、崩溃、能耗异常、日志混乱等一系列问题。这些问题表面上看似偶发&#xff0c;但背后往往隐藏着系统资源调度不当…...