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基于fMRI数据计算脑脊液(CSF)与全脑BOLD信号的时间耦合分析

一、前言

  笔者之前的文章《基于Dpabi和spm12的脑脊液(csf)分割和提取笔记》,介绍了如何从普通的fMRI数据中提取CSF信号。首先是基础的预处理,包括时间层校正、头动校正,再加上0.01-0.1Hz的带通滤波。接着用SPM12分割出CSF区域,设置一个比较严格的0.9阈值,确保提取的真是CSF信号。最后在桥前池那个位置,也就是最后一个非零层面上把CSF信号提取出来。

  本笔记打算更进一步,研究CSF信号和全脑BOLD信号之间的关系。这种耦合关系其实挺有意思:它可能反映出大脑的代谢清除效率,也可能和神经胶质淋巴系统的功能有关。笔者会详细介绍如何计算这个耦合度,把整个分析流程和相关代码都分享出来。希望能和同样对这个方向感兴趣的同学一起交流。

二、数学原理-互相关(Cross-correlation)

一、耦合度定义

  互相关(Cross-correlation)是测量两个信号相似度的简单方法,用它来度量BOLD-CSF的耦合可以告诉我们:

  1. BOLDCSF信号有多相似
  2. CSF信号要延迟多少时间才能最匹配BOLD信号

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