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R语言装环境Gcc报错以及scater包的安装

news 2026/4/11 17:53:39

error: ‘timespec_get’ has not been declared in ‘::’ 80 | using ::timespec_get;
在conda 的虚拟环境中升级gcc的版本

conda install -c conda-forge gcc=11 gxx=11

终极方法，在R的最新版本和环境下装啥都能成功！！
比如beyondcell的方法的Beyondcell Score Normalization中 scater包的安装
在R的环境下比如R4.3.3 Seurat以及Seuratobj版本都是5.0，不知道为啥在4.0版本死活装不上，
安装步骤如下：

install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("BiocStyle")
devtools::install_github("alanocallaghan/scater")
# 完美安装成功

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