当前位置： 首页 > news >正文

深度学习在蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）领域的研究进展（2022-2025）

news 2026/2/8 21:28:56
一、蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）的定义与生物学意义

蛋白质-蛋白质相互作用（Protein-Protein Interaction, PPI）是指两个或多个蛋白质通过物理结合形成复合物，进而调控细胞信号传导、代谢、免疫应答等生命活动的过程。PPI是生物体内复杂功能网络的核心，例如酶与底物的结合、抗体与抗原的识别、受体与配体的信号传递等均依赖于此。据估计，人类蛋白质组中约80%的功能通过PPI实现，其异常可能导致癌症、神经退行性疾病等。

PPI的结构基础
PPI界面通常由互补的疏水区、氢键网络和静电相互作用构成。传统研究通过实验方法（如X射线晶体学、冷冻电镜）解析复合物结构，但存在成本高、耗时长等局限性。近年来，计算生物学和深度学习技术的结合为PPI研究提供了新范式。

二、PPI研究的主要科学问题
  1. PPI界面预测与表征
    如何从蛋白质序列或结构数据中识别相互作用界面，并量化结合亲和力。
  2. PPI调节剂设计
    开发小分子或生物制剂（如多肽、抗体）以增强或抑制特定PPI，用于疾病治疗。
  3. 动态构象分析
    研究复合物在不同状态下的构象变化，揭示结合机制与功能动态性。</

相关文章：

深度学习在蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）领域的研究进展（2022-2025）

一、蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）的定义与生物学意义 蛋白质-蛋白质相互作用（Protein-Protein Interaction, PPI）是指两个或多个蛋白质通过物理结合形成复合物，进而调控细胞信号传导、代谢、免疫应答等生命活动的过程。PPI是生物体内复杂功能网络的核心，例如酶与底物的结…...

编程日记 2025/2/20 0:43:37

网络安全学习架构 网络安全架构内容

网上买的《信息安全原理及应用》的书还没到&#xff0c;就找了一本《密码编码学与网络安全》的电子书&#xff0c;写的也不错&#xff0c;计划今天和明天把第一章绪论和第二章的数论给看完 1. 计算机网络安全概念 计算机安全的三个核心是&#xff1a;完整性&#xff08;只要特…...

编程日记 2025/2/20 0:42:35

硕成C语言24

不管风吹浪打&#xff0c;胜似闲庭信步&#xff01; 1.选择排序&#xff1a; 不管风吹浪打&#xff0c;胜似闲庭信步&#xff01;1.选择排序&#xff1a; // 这个宏定义用于忽略 Visual Studio 中一些安全相关的警告&#xff0c;使得可以使用像 scanf 这样的函数而不产生警告…...

编程日记 2025/2/20 0:40:32

《Stable Diffusion绘画完全指南：从入门到精通的Prompt设计艺术》-配套代码示例

第一章&#xff1a;模型加载与基础生成 1.1 基础模型加载 from diffusers import StableDiffusionPipeline import torch# 加载SD 1.5基础模型&#xff08;FP32精度&#xff09; pipe StableDiffusionPipeline.from_pretrained("runwayml/stable-diffusion-v1-5",…...

编程日记 2025/2/20 0:39:31

Linux下为Intel核显安装OpenCL

实验环境 CPU&#xff1a;N5105运行内存&#xff1a;32G系统&#xff1a;almalinux 8 &#xff08;类似CentOS系统&#xff09; 安装过程 检查i915驱动 输入命令dmesg | grep i915查看驱动的加载信息。 我这里没接显示器&#xff0c;输出正确的驱动加载信息如下图所示&…...

编程日记 2025/2/20 0:34:24

用deepseek学大模型04-机器学习建模过程

https://metaso.cn/s/7tEmBHr 目前已经学完深度学习的数学基础&#xff0c;给出机器学习建模的基本过程 好的&#xff0c;我现在需要回答用户的问题&#xff1a;已经学完深度学习的数学基础&#xff0c;现在要给出机器学习建模的基本过程。我需要结合我搜索到的资料来构建一个详…...

编程日记 2025/2/20 0:27:17

【ClickHouse】Ubuntu下离线安装ClickHouse数据库并使用DBeaver连接

目录 0. 安装前准备1 安装ClickHouse1.1 下载安装包1.2 离线安装1.3 配置密码1.4 启动ClickHouse服务 2 DBeaver连接配置2.1 下载ClickHouse驱动2.2 DBeaver配置2.2.1 配置主要参数2.2.2 配置驱动 2.3 常见问题处理2.3.1 修改远程登录配置2.3.2 更新驱动配置 0. 安装前准备 有…...

编程日记 2025/2/20 0:25:14

Unity3D实现接入DeepSeek对话

系列文章目录 unity知识点 文章目录 系列文章目录👉前言👉一、使用第一步👉1-1、登录注册DeepSeek👉1-2、创建API-key👉二、使用第二步👉三、使用第三步👉壁纸分享👉总结👉前言 随着人工智能和机器学习技术的不断进步，DeepSeek的未来发展趋势充满了无限可能…...

编程日记 2025/2/20 0:21:10

【ISO 14229-1:2023 UDS诊断（会话控制0x10服务）测试用例CAPL代码全解析②】

ISO 14229-1:2023 UDS诊断【会话控制0x10服务】_TestCase02 作者&#xff1a;车端域控测试工程师 更新日期&#xff1a;2025年02月15日 关键词&#xff1a;UDS诊断、0x10服务、诊断会话控制、ECU测试、ISO 14229-1:2023 TC10-002测试用例 用例ID测试场景验证要点参考条款预期…...

编程日记 2025/2/20 0:19:07

前端新手必看：10 大 UI 组件库全面解析，快速搭建高质量 Web 应用」 「从零开始：Vue 和 React 最受欢迎的 UI 组件库入门指南」 「超实用！PC 端和移动端 UI 组件库推荐与实战

前端新手必看&#xff1a;10 大 UI 组件库全面解析&#xff0c;快速搭建高质量 Web 应用 目录 什么是 UI 组件库&#xff1f;为什么需要 UI 组件库&#xff1f;PC 端 UI 组件库推荐 Ant DesignElement UIVuetifyBootstrapVueiView (View UI)Quasar FrameworkMaterial-UI (MUI…...

编程日记 2025/2/20 0:13:01

【MySQL高级】17 - MySQL中常用工具

1. mysql 该mysql不是指mysql服务&#xff0c;而是指mysql的客户端工具。语法&#xff1a; mysql [options] [database]1.1 连接选项 参数 &#xff1a; -u, --username 指定用户名-p, --password[name] 指定密码-h, --hostname 指定服务器IP或域名-P, --por…...

编程日记 2025/2/20 0:09:58

【Linux】Linux 文件系统——有关 inode 不足的案例

ℹ️大家好&#xff0c;我是练小杰&#xff0c;今天周二了&#xff0c;明天星期三&#xff0c;还有三天就是星期五了&#xff0c;坚持住啊各位&#xff01;&#xff01;&#xff01;&#x1f606; 本文是对之前Linux文件权限中的inode号进行实例讨论&#xff0c;看到博客有错误…...

编程日记 2025/2/20 0:08:57

计算机视觉：卷积神经网络(CNN)基本概念(二)

第一章&#xff1a;计算机视觉中图像的基础认知 第二章&#xff1a;计算机视觉&#xff1a;卷积神经网络(CNN)基本概念(一) 第三章&#xff1a;计算机视觉&#xff1a;卷积神经网络(CNN)基本概念(二) 第四章&#xff1a;搭建一个经典的LeNet5神经网络(附代码) 第五章&#xff1…...

编程日记 2025/2/20 0:06:54

【第7章：注意力机制与Transformer模型—7.4 NLP领域的BERT、GPT系列模型】

当你在2017年第一次听说Transformer时，可能不会想到这个模型会在短短三年内彻底改变NLP领域。想象一下，原本需要数周训练的翻译模型，现在用Transformer架构几天就能达到更好的效果；那些让程序员们头疼的梯度消失问题，突然变得不再重要。这一切的魔法钥匙，都藏在一个叫做&…...

编程日记 2025/2/20 0:04:51

[代码调试]安装Text2Image(stable diffusion)模型环境的踩坑记录

文章目录 一、xFormers版本问题1、先确认下自己torch版本所对应的cuda版本2.安装对应版本(1) 到对应官网下载包本地安装(2)代码安装 二、attn_mask尺寸错误三、diffusers四、Huggingface 配置基于stable diffusion预训练模型的环境&#xff0c;记录踩坑记录 一、xFormers版本问…...

编程日记 2025/2/20 0:02:48

大数据SQL调优专题——Flink执行原理

引入 上一篇我们了解了Spark&#xff0c;相比起MapReduce来说&#xff0c;它确实已经快了超级多了&#xff0c;但是人类的欲望是没有止境的&#xff0c;这也是推动人类进步的动力。 Flink就是为了满足实时响应的场景需求诞生的。 其实在Flink之前&#xff0c;实时处理其实已…...

编程日记 2025/2/19 23:58:42

Oracle 12c中在同一组列上创建多个索引

在数据库管理与优化领域&#xff0c;索引是提高查询性能的关键工具之一。然而&#xff0c;在某些情况下&#xff0c;单一类型的索引可能不足以满足所有查询的需求。Oracle 12c引入了一个强大的新特性&#xff1a;允许在同一组列上创建多个索引&#xff0c;但仅一个可见&#xf…...

编程日记 2025/2/19 23:54:37

线程安全的集合类

文章目录 多线程环境使⽤`ArrayList`线程不安全线程安全可以使用 `ReentrantLock` 或 `synchronized`来保护 `ArrayList` 的访问。使用同步包装器使用 `CopyOnWriteArrayList`**“写时复制”机制**多线程环境使⽤队列多线程环境使⽤哈希表HashtableConcurrentHashMapHashMap、H…...

编程日记 2025/2/19 23:50:32

【如何实现 JavaScript 的防抖和节流？】

如何实现 JavaScript 的防抖和节流&#xff1f; 前言 防抖&#xff08;Debounce&#xff09;和节流&#xff08;Throttle&#xff09;是 JavaScript 中优化高频事件处理的两种常用技术。它们可以有效减少事件处理函数的调用次数&#xff0c;提升性能并改善用户体验。本文将详…...

编程日记 2025/2/19 23:46:26

C#中File类的Copy()方法或FileInfo类的CopyTo()方法的参数overwrite取false和true的区别

当调用 System.IO.File.Copy 方法时&#xff0c;第三个参数 overwrite 控制着如果目标位置已经存在同名文件的情况下如何处理。 1、当 overwrite 设置为 true 在这种情况下&#xff0c;即使目标路径下已经有相同名称的文件&#xff0c;该方法也会无条件地覆盖现有的文件。这不…...

编程日记 2025/2/19 23:45:23

云启出海，智联未来｜阿里云网络「企业出海」系列客户沙龙上海站圆满落地

借阿里云中企出海大会的东风&#xff0c;以**「云启出海&#xff0c;智联未来&#xff5c;打造安全可靠的出海云网络引擎」为主题的阿里云企业出海客户沙龙云网络&安全专场于5.28日下午在上海顺利举办&#xff0c;现场吸引了来自携程、小红书、米哈游、哔哩哔哩、波克城市、…...

编程新知 2026/1/30 0:00:28

工程地质软件市场：发展现状、趋势与策略建议

一、引言 在工程建设领域&#xff0c;准确把握地质条件是确保项目顺利推进和安全运营的关键。工程地质软件作为处理、分析、模拟和展示工程地质数据的重要工具&#xff0c;正发挥着日益重要的作用。它凭借强大的数据处理能力、三维建模功能、空间分析工具和可视化展示手段&…...

编程新知 2025/10/6 6:10:29

如何在看板中有效管理突发紧急任务

在看板中有效管理突发紧急任务需要&#xff1a;设立专门的紧急任务通道、重新调整任务优先级、保持适度的WIP&#xff08;Work-in-Progress&#xff09;弹性、优化任务处理流程、提高团队应对突发情况的敏捷性。其中&#xff0c;设立专门的紧急任务通道尤为重要&#xff0c;这能…...

编程新知 2026/2/3 22:50:06

CocosCreator 之 JavaScript/TypeScript和Java的相互交互

引擎版本&#xff1a; 3.8.1 语言&#xff1a; JavaScript/TypeScript、C、Java 环境&#xff1a;Window 参考&#xff1a;Java原生反射机制 您好&#xff0c;我是鹤九日&#xff01; 回顾 在上篇文章中&#xff1a;CocosCreator Android项目接入UnityAds 广告SDK。 我们简单讲…...

编程新知 2026/1/30 12:10:19

2025盘古石杯决赛【手机取证】

前言 第三届盘古石杯国际电子数据取证大赛决赛 最后一题没有解出来&#xff0c;实在找不到&#xff0c;希望有大佬教一下我。 还有就会议时间&#xff0c;我感觉不是图片时间&#xff0c;因为在电脑看到是其他时间用老会议系统开的会。 手机取证 1、分析鸿蒙手机检材&#x…...

编程新知 2026/1/29 17:12:17

vue3+vite项目中使用.env文件环境变量方法

vue3vite项目中使用.env文件环境变量方法 .env文件作用命名规则常用的配置项示例使用方法注意事项在vite.config.js文件中读取环境变量方法 .env文件作用 .env 文件用于定义环境变量&#xff0c;这些变量可以在项目中通过 import.meta.env 进行访问。Vite 会自动加载这些环境变…...

编程新知 2026/1/26 19:12:01

CMake控制VS2022项目文件分组

我们可以通过 CMake 控制源文件的组织结构，使它们在 VS 解决方案资源管理器中以“组”（Filter）的形式进行分类展示。 🎯 目标 通过 CMake 脚本将 .cpp、.h 等源文件分组显示在 Visual Studio 2022 的解决方案资源管理器中。 ✅ 支持的方法汇总（共4种） 方法描述是否推荐…...

编程新知 2025/12/4 15:47:17

基于Java Swing的电子通讯录设计与实现：附系统托盘功能代码详解

JAVASQL电子通讯录带系统托盘 一、系统概述 本电子通讯录系统采用Java Swing开发桌面应用&#xff0c;结合SQLite数据库实现联系人管理功能&#xff0c;并集成系统托盘功能提升用户体验。系统支持联系人的增删改查、分组管理、搜索过滤等功能&#xff0c;同时可以最小化到系统…...

编程新知 2025/10/4 20:58:43

QT3D学习笔记——圆台、圆锥

类名作用Qt3DWindow3D渲染窗口容器QEntity场景中的实体&#xff08;对象或容器&#xff09;QCamera控制观察视角QPointLight点光源QConeMesh圆锥几何网格QTransform控制实体的位置/旋转/缩放QPhongMaterialPhong光照材质&#xff08;定义颜色、反光等&#xff09;QFirstPersonC…...

编程新知 2026/1/29 5:26:37

【Redis】笔记｜第8节｜大厂高并发缓存架构实战与优化

缓存架构 代码结构 代码详情 功能点&#xff1a; 多级缓存&#xff0c;先查本地缓存&#xff0c;再查Redis&#xff0c;最后才查数据库热点数据重建逻辑使用分布式锁&#xff0c;二次查询更新缓存采用读写锁提升性能采用Redis的发布订阅机制通知所有实例更新本地缓存适用读多…...

编程新知 2026/1/26 3:45:28