UMLS初探

什么是UMLS

UMLS（Unified Medical Language System，统一医学语言系统），简单来说就是将不同的医学标准统一到一套体系的系统，主要为了医疗系统的统一而构建出的。

UMLS的主要组成部分

• Metathesaurus：一个包含多个医学术语系统的元数据库，旨在统一和映射不同来源的医学概念。
• Semantic Network：一个包含语义分类和关系的网络。它可以帮助用户识别概念之间的语义关系。
• SPECIALIST Lexicon and Lexical Tools：专业词库与词汇工具。

UMLS Metathesaurus元数据库

Metathesaurus 的主要作用是将来自 不同医疗术语系统（如 SNOMED CT、MeSH、ICD-10、LOINC 等）的术语进行标准化和关联，以便实现医学信息的互操作性。

web页面：UMLS Metathesaurus Browser

每个 医学概念 在 Metathesaurus 中都被分配一个 CUI（Concept Unique Identifier）。不同术语系统中的同义术语会被映射到相同的 CUI。此外Metathesaurus里还记录了一些关系类型。

表名	作用
MRCONSO	术语表，包含所有概念的不同名称和来源
MRSTY	语义类型表，给出每个 CUI 的语义分类
MRREL	关系表，表示 CUI 之间的关系（如同义、上下位等）
MRDEF	概念定义表，包含医学概念的定义
MRSAT	属性表，提供额外的概念属性信息

UMLS Semantic Network语义网络

主要记录了不同语义类型及语义关系。web页面：UMLS Metathesaurus Browser

语义类型（semantic type）

用于对 UMLS 概念进行分类。例如：

• Disease or Syndrome（疾病或综合征）
• Pharmacologic Substance（药理物质）
• Body Part, Organ, or Organ Component（身体部位、器官或器官组成部分）
• Diagnostic Procedure（诊断程序）
• ...

每个 UMLS 概念（Concept Unique Identifier, CUI）至少属于一个语义类型。

语义关系（Semantic Relations）

• 语义网络定义了一组有限的 语义关系，用于描述语义类型之间的关系。例如：
  • isa（是）：表示一种层次关系，如“心脏（Heart） isa 身体部位（Body Part）”。
  • part_of（属于）：表示部分-整体关系，如“心脏（Heart） part_of 心血管系统（Cardiovascular System）”。
  • treats（治疗）：如“阿司匹林（Aspirin） treats 心脏病（Heart Disease）”。
  • causes（导致）：如“病毒（Virus） causes 感染（Infection）”。
  • ...

REFERENCE

Unified Medical Language System (UMLS)