一文说透Native-PAGE

非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(Native-PAGE)或称为活性电泳是在不加入SDS和巯基乙醇等变性剂的条件下对保持活性的蛋白质进行聚丙烯酰胺凝胶电泳常用于酶的鉴定、同工酶分析和提纯。与非变性凝胶电泳最大的区别就在于蛋白在电泳过程中和电泳后都不会变性保证了蛋白质功能。为什么SDS-PAGE需要对蛋白进行变性处理在天然状态下蛋白以折叠的形式存在且在同一分子内同时具有正电荷和负电荷电荷和折叠方式的不同使具有相同分子量的不同蛋白质在凝胶上以不同的速度迁移这让聚丙烯酰胺凝胶中蛋白质的分离变得困难变形处理可以保证蛋白质的迁移率仅取决于蛋白质的分子质量的大小。SDS和DTT作为WB常用的试剂有何作用SDS是一种去污剂它能断裂分子内和分子间的氢键破坏蛋白分子的二、三级结构使折叠的蛋白质变性成线性分子。此外SDS以使负电荷均匀地附着蛋白质。蛋白质和SDS之间的相互作用DTT二硫苏糖醇使半胱氨酸残基间的二硫键断裂阻止蛋白质中的半胱氨酸之间形成二硫键。但无法还原包埋于蛋白质结构内部的二硫键这类二硫键的还原常常需要先通过加热或者变性剂等使蛋白质结构打开。是否添加DTT对电泳的影响Native-PAGE实验方法电泳在操作上基本和SDS-PAGE上是相同的只是非变性聚丙烯酰胺凝胶的配制和电泳缓冲液中不能含有变性剂如SDS等。一般蛋白进行非变性凝胶电泳要先分清是碱性还是酸性蛋白酸性蛋白通常采用的pH是8.8的缓冲系统蛋白会带负电荷蛋白会向阳极移动而碱性蛋白通常电泳是在微酸性环境下进行蛋白带正电荷这时候需要将阴极和阳极倒置。1、样品准备细胞超声即可超声后离心取上清将样品与样品缓冲液混合注意不要加热样品以避免蛋白质变性。上样缓冲液中不能含有SDS等变性剂。2、电泳在非变性条件下蛋白的迁移与蛋白的电荷、蛋白形状以及蛋白分子量都有关。蛋白分子量的确定应该是在不同凝胶浓度下确定出蛋白的Rf值绘制出凝胶浓度对Rf的曲线从而判定蛋白的分子量。电泳的过程中电压过高可能引起发热而导致蛋白质变性所以最好在电泳槽外面放置冰块降低温度如果蛋白质的分子量较大电泳时间可以延长使目的蛋白质有足够的迁移率和其它的蛋白质分开。3、染色与分析电泳完成后将凝胶剥下采用考马斯亮蓝染色或银染的方法观察蛋白质条带。银染操作步骤需自备乙醇、乙酸和去离子水1取适量样本开展SDS-PAGE凝胶电泳2固定将电泳后的凝胶从玻璃板上剥离下来清水冲洗⼲净放⼊⼲净的直径12cm玻璃皿中加⼊去离⼦水没过胶盖上盖⼦在脱色摇床上室温摇晃5min弃掉去离⼦水加⼊固定液没过胶盖上盖⼦在脱色摇床上室温摇晃30min。固定液配制依次加⼊17.5mL⼄醇、3.5mL⼄酸和14mL去离⼦水混匀后即成35mL固定液。3致敏弃掉固定液加⼊去离⼦水没过胶盖上盖⼦在脱色摇床上室温摇晃5min重复水洗⼀次共2次加⼊致敏液没过胶盖上盖⼦在脱色摇床上室温摇晃30min。致敏液配制31.5mL去离⼦水中加⼊3.5mL致敏液I 、70μL致敏液II 、100μL致敏液III混匀后使⽤现⽤现配。4染色弃掉致敏液加⼊去离⼦水没过胶盖上盖⼦在脱色摇床上室温摇晃2min重复水洗⼀次共2次加⼊染色液没过胶盖上盖⼦在脱色摇床上室温摇晃20min。染色液35mL纯水⼊加0.35mL银溶液30μL显色液Ⅱ混匀现⽤现配。5显色弃掉染色液加⼊去离⼦水没过胶盖上盖⼦在脱色摇床上室温摇晃1min重复水洗⼀次共2次加⼊显色液没过胶在脱色摇床上室温摇晃2min左右溶液变浑浊弃掉液体加⼊新的显色液继续显色至⽬的条带清晰拍照。显色液31.5mL去离⼦水中加⼊3.5mL显色液I15μL显色液Ⅱ混匀现⽤现配。4、蛋白回收根据染色结果切取含有蛋白质的胶带用手术刀切碎装入处理过的透析袋中加入适量的缓冲液能维持蛋白活性的通常与Native PAGE电泳液相同最后把透析袋放入普通的核酸电泳槽中并在电泳槽中加入适量的缓冲液和透析袋中的缓冲液相同低温电泳2-3h电泳完毕取出透析袋在重蒸水或者合适的缓冲液中透析透析完毕后浓缩。以上为基础指南具体操作需要根据实验条件和目标蛋白质的特性进行调整。