BioTech - 将蛋白质的 PDB 格式文件 转换成 mmCIF 格式文件 (Python)

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蛋白质的三维结构信息通常可以通过两种格式的文件来获取：PDB (Protein Data Bank) 和 mmCIF (Macromolecular Crystallographic Information File，大分子晶体学信息文件) 。以下是关于这两种文件格式之间差别的简要介绍：

PDB 文件

• 格式: PDB是一种较为基础的文件格式，通常用于存储蛋白质、核酸、复杂组装体以及小分子的三维结构信息。
• 结构: PDB文件以纯文本形式存储，每行都包含特定的信息，如原子名称、坐标、温度因子等。
• 可读性: 由于是文本格式，PDB文件易于阅读和编辑，适合快速查看和手动处理。
• 兼容性: 许多生物信息学软件和数据库都支持PDB格式，因此它在生物化学领域非常通用。

mmCIF 文件

• 格式: mmCIF是一种较新的文件格式，旨在提