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生信技能47 - Shell程序和R程序并行执行处理方法

news 2025/7/7 4:08:41

Linux shell和R程序并行化执行程序方法。

1. 使用do{…} &;done;wait语句并行执行Shell

并行执行总运行时间不再是task数量*单个任务消耗时间，而是取决于单个耗时最长的任务。

# while循环，遍历test.txt文件每行
cat test.txt|while read i;
dotime_stamp=$(date "+%Y/%m/%d %H-%M-%S"){	# 打印时间戳和当前执行任务编号

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