当前位置： 首页 > news >正文

R可视化：微生物相对丰度或富集热图可视化

news 2025/10/31 4:41:26

欢迎大家关注全网生信学习者系列：

  • WX公zhong号：生信学习者
  • Xiao hong书：生信学习者
  • 知hu：生信学习者
  • CDSN：生信学习者2

在这里插入图片描述

介绍

热图（Heatmap）是一种数据可视化方法，它通过颜色的深浅或色调的变化来展示数据的分布和密度。在微生物学领域，热图常用于表示微生物在不同分组（如不同的环境、时间点、处理条件等）中的表达水平或出现率状态。这种可视化方式能够直观地揭示微生物群落在不同条件下的分布规律和变化趋势。以已发表文章的热图代码为例，通过运行这些代码，研究者可以将微生物测序数据或丰度数据转换为热图，从而更好地理解和解释微生物群落的变化。在热图中，不同的颜色通常代表不同的数值大小，比如颜色越深可能代表某种微生物的表达水平或出现率越高。通过比较不同分组间的颜色变化，研究者可以快速地识别出哪些微生物在特定条件下更为活跃或更为丰富。在制作热图时，研究者还需要注意一些技术细节，比如颜色的选择、颜色的梯度设置、数据的归一化处理等，以确保最终的热图能够准确地反映数据的特点和规律。

加载R包

library(tidyverse)
library(ComplexHeatmap)
library(viridis)
libr

相关文章：

R可视化：微生物相对丰度或富集热图可视化

欢迎大家关注全网生信学习者系列： WX公zhong号：生信学习者Xiao hong书：生信学习者知hu：生信学习者CDSN：生信学习者2介绍 热图（Heatmap）是一种数据可视化方法，它通过颜色的深浅或色调的变化来展示数据的分布和密度。在微生物学领域，热图常用于表示微生物在不同分组（如…...

编程日记 2024/6/17 22:25:34

Unity Maximum Allowed Timestep的说明

Maximum Allowed Timestep的说明 关于Maximum Allowed Timestep这个配置的说明，Unity有一份官方的说明。 Time-maximumDeltaTime - Unity 脚本 API 结合Unity的函数执行顺序，我们可以简单理解为： FixedUpdate在1次Update可能会执行N次&am…...

编程日记 2024/6/17 22:24:33

长短期记忆神经网络（LSTM）的回归预测（免费完整源代码）【MATLAB】

LSTM（Long Short-Term Memory，长短期记忆网络）是一种特殊类型的递归神经网络（RNN），专门用于处理和预测基于时间序列的数据。与传统RNN相比，LSTM在处理长期依赖问题时具有显著优势。 LSTM的基本…...

编程日记 2024/6/17 22:23:31

关于 python request 的 response 返回 b‘\xa3\xff\xff\x11E .....‘ 类型的数据的解决方案

最近写开发一个爬虫， 程序在本地好好的，返回的是正常的 html， 但是到了生产环境，不知道为什么返回的是一堆乱码 长这样： 查了好几天都没有进展， 对其进行各种转码均无效 今天终于找到解决办法了&#xff…...

编程日记 2024/6/17 22:22:30

后端高频面试题分享-用Java判断一个列表是否是另一个列表的顺序子集

问题描述 编写一个函数，该函数接受两个列表作为参数，判断第一个列表是否是第二个列表的顺序子集，返回True或False。 要求 判断一个列表是否是另一个列表的顺序子集，即第一个列表的所有元素在第二个列表需要顺序出现。列表中的元…...

编程日记 2024/6/17 22:20:28

【数据初步变现】论自助BI在数字化转型中如何赋能业务

引言：数字化转型要求企业更加依赖数据来指导业务决策。自助BI作为数据分析的重要工具，能够迅速、准确地从海量数据中提取有价值的信息，为企业的战略规划和业务执行提供有力支持。在数字化时代，企业需要快速响应市场变化并优化业务…...

编程日记 2024/6/17 22:18:26

Python 学习 第二册 第14章 网络编程

----用教授的方式学习 目录 14.1 几个网络模块 14.1.1 模块 socket 14.1.2 模块 urllib 和 urllib2 14.1.3 其他模块 14.2 SocketServer 及相关的类 14.3.1 使用 SocketServer 实现分叉和线程化 14.3.2 使用 select 和 poll 实现异步 I/O 14.4 Twisted 14.4.1 下载…...

编程日记 2024/6/17 22:16:24

微信 小程序应用，页面，组件的生命周期

组件生命周期 组件的生命周期：指的是组件自身的一些钩子函数，这些函数在特定的时间节点时被自动触发 组件的生命周期函数需要在 lifetimes 字段内进行声明 最重要的生命周期是 created attached detached 包含一个组件生命周期流程的最主要时间点 定…...

编程日记 2024/6/17 22:13:21

代码随想录算法训练营Day41|背包问题、分割等和子集

背包问题 二维 46. 携带研究材料（第六期模拟笔试） (kamacoder.com) dp数组有两维，横轴表示背包重量j（0-j），纵轴表示不同物品（0-i），dp[i][j]即表示从下标为[0-i]的物品…...

编程日记 2024/6/17 22:12:20

oracle SCHEDULER

从Oracle 10g开始，推荐使用DBMS_SCHEDULER包，因为它提供了更强大的功能和灵活性，包括更复杂的调度规则、依赖管理和事件驱动等 1. 用法 DBMS_SCHEDULER.CREATE_JOB (job_name IN VARCHAR2,job_type IN VARCHAR2,job_action IN VARCHAR2,…...

编程日记 2024/6/17 22:11:18

实现虚拟机的难点

一、背景 目前的虚拟机有很多，例如VMWare、VitrualBox、QEMU、JVM、Python虚拟机等等。 二、虚拟机的作用 在一台已有的计算机中，忽略实际操作系统种类和硬件的型号，用一些接口库来搭建一台用户想要的，虚拟的程序运行环境。 例如…...

编程日记 2024/6/17 22:09:15

JAVA-线程

先上图，有点长，比较碎，有xmind文件......，详细内容均在图片里介绍了，提供了PDF文件 1.线程简介 进程是操作系统中正在执行的不同的应用程序，例如：我们可以同时打开Word和记事本 线程是一个应用…...

编程日记 2024/6/17 22:07:12

代码随想录——电话号码的字母组合（Leetcode17）

题目链接 回溯 class Solution {List<String> res new ArrayList<String>();StringBuilder str new StringBuilder();HashMap<String, String> Sites new HashMap<String, String>();public List<String> letterCombinations(String digit…...

编程日记 2024/6/17 22:05:10

多款可观测产品全面升级丨阿里云云原生 5 月产品月报

云原生月度动态 云原生是企业数字创新的最短路径。 《阿里云云原生每月动态》&#xff0c;从趋势热点、产品新功能、服务客户、开源与开发者动态等方面&#xff0c;为企业提供数字化的路径与指南。 趋势热点 &#x1f947; 阿里云云原生产品负责人李国强&#xff1a;推进可…...

编程日记 2024/6/17 22:03:07

python实践笔记(三): 异常处理和文件操作

1. 写在前面 最近在重构之前的后端代码&#xff0c;借着这个机会又重新补充了关于python的一些知识&#xff0c; 学习到了一些高效编写代码的方法和心得&#xff0c;比如构建大项目来讲&#xff0c;要明确捕捉异常机制的重要性&#xff0c; 学会使用try...except..finally&…...

编程日记 2024/6/17 22:02:06

Excel VLOOKUP 使用记录

Excel VLOOKUP 使用记录 VLOOKUP简单使用 VLOOKUP(lookup_value,table_array,col_index_num,[range-lookup]) 下面是excel对VLOOKUP 的解释 lookup_value&#xff08;查找值&#xff09;&#xff1a;要匹配查找的值 table_array&#xff08;数据表&#xff09;&#xff1…...

编程日记 2024/6/17 21:56:59

Spring Cloud Stream 消息驱动基础入门与实践总结

Spring Cloud Stream是用于构建与共享消息传递系统连接的高度可伸缩的事件驱动微服务框架&#xff0c;该框架提供了一个灵活的编程模型&#xff0c;它建立在已经建立和熟悉的Spring熟语和最佳实践上&#xff0c;包括支持持久化的发布/订阅、消费组以及消息分区这三个核心概念。…...

编程日记 2024/6/17 21:54:57

你好rust

第一次安装rust&#xff0c;记录一下笔记。 几年前就听说过rust&#xff0c;自己一直是个c爱好者&#xff0c;所以比较抵触rust&#xff0c;早年还有什么rust向上突破群。一直比较抵触&#xff0c;直到这几年rust已经渐渐深入到linux内核、云原生可观测以及zend社区当中&#x…...

编程日记 2024/6/17 21:52:54

STM32 printf 重定向到CAN

最近在调试一款电机驱动板 使用的是CAN总线而且板子上只有一个CAN 想移植Easylogger到上面试试easylogger的效果&#xff0c;先实现pritnf的重定向功能来打印输出 只需要添加以下代码即可实现 代码 #include <stdarg.h> uint8_t FDCAN_UserTxBuffer[512]; void FDCAN_p…...

编程日记 2024/6/17 21:51:53

jmeter性能优化之mysql监控sql慢查询语句分析

接上次博客&#xff1a;基础配置 多用户登录并退出jmx文件&#xff1a;百度网盘 提取码&#xff1a;0000 一、练习jmeter脚本检测mysql慢查询 随意找一个脚本(多用户登录并退出)&#xff0c;并发数设置300、500后分别查看mysql监控平台 启动后查看&#xff0c;主要查看mysql…...

编程日记 2024/6/17 21:50:51

UDP(Echoserver)

网络命令 Ping 命令 检测网络是否连通 使用方法: ping -c 次数 网址ping -c 3 www.baidu.comnetstat 命令 netstat 是一个用来查看网络状态的重要工具. 语法&#xff1a;netstat [选项] 功能&#xff1a;查看网络状态 常用选项&#xff1a; n 拒绝显示别名&#…...

编程新知 2025/10/27 9:35:00

Robots.txt 文件

什么是robots.txt&#xff1f; robots.txt 是一个位于网站根目录下的文本文件&#xff08;如&#xff1a;https://example.com/robots.txt&#xff09;&#xff0c;它用于指导网络爬虫&#xff08;如搜索引擎的蜘蛛程序&#xff09;如何抓取该网站的内容。这个文件遵循 Robots…...

编程新知 2025/9/9 5:38:23

什么是EULA和DPA

文章目录 EULA&#xff08;End User License Agreement&#xff09;DPA&#xff08;Data Protection Agreement&#xff09;一、定义与背景二、核心内容三、法律效力与责任四、实际应用与意义 EULA&#xff08;End User License Agreement&#xff09; 定义&#xff1a; EULA即…...

编程新知 2025/10/18 7:13:10

Rust 异步编程

Rust 异步编程 引言 Rust 是一种系统编程语言，以其高性能、安全性以及零成本抽象而著称。在多核处理器成为主流的今天，异步编程成为了一种提高应用性能、优化资源利用的有效手段。本文将深入探讨 Rust 异步编程的核心概念、常用库以及最佳实践。 异步编程基础 什么是异步…...

编程新知 2025/10/20 1:24:05

NFT模式：数字资产确权与链游经济系统构建

NFT模式&#xff1a;数字资产确权与链游经济系统构建 ——从技术架构到可持续生态的范式革命 一、确权技术革新&#xff1a;构建可信数字资产基石 1. 区块链底层架构的进化 跨链互操作协议&#xff1a;基于LayerZero协议实现以太坊、Solana等公链资产互通&#xff0c;通过零知…...

编程新知 2025/10/30 3:39:37

Redis数据倾斜问题解决

Redis 数据倾斜问题解析与解决方案 什么是 Redis 数据倾斜 Redis 数据倾斜指的是在 Redis 集群中&#xff0c;部分节点存储的数据量或访问量远高于其他节点&#xff0c;导致这些节点负载过高&#xff0c;影响整体性能。 数据倾斜的主要表现 部分节点内存使用率远高于其他节…...

编程新知 2025/10/30 22:39:53

C/C++ 中附加包含目录、附加库目录与附加依赖项详解

在 C/C 编程的编译和链接过程中&#xff0c;附加包含目录、附加库目录和附加依赖项是三个至关重要的设置&#xff0c;它们相互配合&#xff0c;确保程序能够正确引用外部资源并顺利构建。虽然在学习过程中&#xff0c;这些概念容易让人混淆&#xff0c;但深入理解它们的作用和联…...

编程新知 2025/10/28 1:33:47

Kafka主题运维全指南：从基础配置到故障处理

#作者&#xff1a;张桐瑞 文章目录 主题日常管理1. 修改主题分区。2. 修改主题级别参数。3. 变更副本数。4. 修改主题限速。5.主题分区迁移。6. 常见主题错误处理常见错误1&#xff1a;主题删除失败。常见错误2&#xff1a;__consumer_offsets占用太多的磁盘。 主题日常管理 …...

编程新知 2025/6/10 21:14:43

WebRTC调研

WebRTC是什么&#xff0c;为什么&#xff0c;如何使用 WebRTC有什么优势 WebRTC Architecture Amazon KVS WebRTC 其它厂商WebRTC 海康门禁WebRTC 海康门禁其他界面整理 威视通WebRTC 局域网 Google浏览器 Microsoft Edge 公网 RTSP RTMP NVR ONVIF SIP SRT WebRTC协…...

编程新知 2025/10/29 14:32:45

Python的__call__ 方法

在 Python 中&#xff0c;__call__ 是一个特殊的魔术方法&#xff08;magic method&#xff09;&#xff0c;它允许一个类的实例像函数一样被调用。当你在一个对象后面加上 () 并执行时&#xff08;例如 obj()&#xff09;&#xff0c;Python 会自动调用该对象的 __call__ 方法…...

编程新知 2025/9/23 14:53:10