关于RiboSeq分析流程的总结
最近关注了一下RiboSeq的分析方法,方法挺多的,但是无论哪种软件,都会存在或多或少的问题,一点问题不存在的软件不存在,问题的原因出在,1.有的脚本是用python2编写的,目前python2已经不能用了 2.有的没有安装权限 3.有的package过于老旧已经和python3不兼容了
1.RiboTaper
按照官方流程分析
1.1 直接运行:create_annotations_files.bash
1.2 直接运行:create_metaplots.bash
1.3 直接运行:Ribotaper.sh
这一步脚本的步骤比较多,并且中途会报错,接下来就需要自己调整脚本运行了:
3.1
nohup /datapool/life-zhanghk/liji/01software/miniconda3/envs/py3.8/libexec/tracks_analysis_multiprocessing.R nonccds 10 /datapool/life-zhanghk/liji/01software/miniconda3/envs/py3.8/libexec &
nohup /datapool/life-zhanghk/liji/01software/miniconda3/envs/py3.8/libexec/annotate_exons.R ../annotation/ 10 &
相关文章:
关于RiboSeq分析流程的总结
最近关注了一下RiboSeq的分析方法,方法挺多的,但是无论哪种软件,都会存在或多或少的问题,一点问题不存在的软件不存在,问题的原因出在,1.有的脚本是用python2编写的,目前python2已经不能用了 2.…...
NLP任务:情感分析、看图说话
我可不向其他博主那样拖泥带水,我有代码就直接贴在文章里,或者放到gitee供你们参考下载,虽然写的不咋滴,废话少说,上代码。 gitee码云地址: 卢东艺/pytorch_cv_nlp - 码云 - 开源中国 (gitee.com)https:/…...
Linux桌面溯源
X窗口系统(X Window System) Linux起源于X窗口系统(X Window System),亦即常说的X11,因其版本止于11之故。 X窗口系统(X Window System,也常称为X11或X)是一种以位图方式显示的软件窗口系统。…...
深入Linux:权限管理与常用命令详解
文章目录 ❤️Linux常用指令🩷zip/unzip指令🩷tar指令🩷bc指令🩷uname指令🩷shutdown指令 ❤️shell命令以及原理❤️什么是 Shell 命令❤️Linux权限管理的概念❤️Linux权限管理🩷文件访问者的分类&#…...
Mojo 编程语言:AI开发者的新宠儿
Mojo(Meta Object Oriented programming for Java Objects)是一种面向对象的编程语言,旨在简化和加速Java应用程序的开发过程。作为近年来新兴的编程语言,Mojo因其与Java的紧密集成以及AI开发领域的应用潜力而逐渐成为AI开发者的新…...
ARM/Linux嵌入式面经(十):极氪
开篇强调两个事情: pdf文件都在百度网盘群:911289806一定要把超链接里面的文章看了,那都是为了你们写的。老板!!!现在多学点,涨个2k工资,真的很值得。要不吃学习的苦,要不吃生活的苦。 1. 自我介绍 专开新篇,等我! 2. 项目介绍,提问 专开新篇,等我! 3. SPI通信和…...
【PVE】新增2.5G网卡作为主网卡暨iperf测速流程
【PVE】新增2.5G网卡作为主网卡暨iperf测速流程 新增网卡 新增网卡的首先当然需要关闭PVE母机,把新网卡插上,我用淘宝遥现金搞了个红包,花了26元买了块SSU的2.5G网卡。说实话这个价位连散热片都没有,确实挺丐的。稍后测下速度看…...
数学建模美赛入门
数学建模需要的学科知识 高等数学线性代数 有很多算法的掌握是需要高等数学和线代的相关知识 如:灰色预测模型需要微积分知识;神经网络需要用到导数知识;图论和层次分析法等都需要用到矩阵计算的相关知识等; 概率论与数理统计&am…...
两段序列帧动画播放,在ios机型上出现闪屏
使用场景:两段序列帧动画连接播放,先播放第一段播一次,再播放第二段,第二段循环播放,在ios机型上出现动画闪动,播放不正常。 错误的写法:把每一段序列帧动画单独写在了定义的动画里 .gacha-bg…...
【C++深度探索】全面解析多态性机制(二)
🔥 个人主页:大耳朵土土垚 🔥 所属专栏:C从入门至进阶 这里将会不定期更新有关C/C的内容,欢迎大家点赞,收藏,评论🥳🥳🎉🎉🎉 前言 我…...
MySQL配置数据库的连接命令
MySQL配置数据库连接命令 在MySQL中,配置数据库连接的命令涉及创建用户、授予权限、配置主从复制等多个方面。以下是常用的命令及其用途: 创建用户 创建一个新的数据库用户并为其设置密码: CREATE USER usernamehost IDENTIFIED BY passwo…...
[PaddlePaddle飞桨] PaddleSpeech-自动语音识别-小模型部署
PaddleSpeech的GitHub项目地址 环境要求: gcc > 4.8.5 paddlepaddle < 2.5.1 python > 3.8 OS support: Linux(recommend), Windows, Mac OSXpip下载指令: python -m pip install paddlepaddle-gpu2.5.1 -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.c…...
redis查询慢,你们是如何排查优化的?(总结篇)
1,先进行基准测试,查看redis是否存在查询过慢情况,根据自己的情况而定 2、检查网络连接是否出现延迟,数据丢包问题(可能性小 3、开启慢查询日志,通过日志可以清楚知道哪些命令比较耗时,同时避…...
Docker 容器出现 IP 冲突
Docker 容器出现 IP 冲突的情况可能由以下几个原因导致: 静态 IP 分配:如果你在 docker-compose.yml 文件中为多个容器手动设置了相同的静态 IP 地址,那么这些容器在启动时就会出现 IP 冲突。确保每个容器分配的静态 IP 地址是唯一的。桥接网…...
paddlepaddle2.6,paddleorc2.8,cuda12,cudnn,nccl,python10环境
1.安装英伟达显卡驱动 首先需要到NAVIDIA官网去查自己的电脑是不是支持GPU运算。 网址是:CUDA GPUs | NVIDIA Developer。打开后的界面大致如下,只要里边有对应的型号就可以用GPU运算,并且每一款设备都列出来相关的计算能力(Compu…...
【D3.js in Action 3 精译】1.3 D3 视角下的数据可视化最佳实践(上)
当前内容所在位置 第一部分 D3.js 基础知识 第一章 D3.js 简介 1.1 何为 D3.js?1.2 D3 生态系统——入门须知 1.2.1 HTML 与 DOM1.2.2 SVG - 可缩放矢量图形1.2.3 Canvas 与 WebGL1.2.4 CSS1.2.5 JavaScript1.2.6 Node 与 JavaScript 框架1.2.7 Observable 记事本 1…...
如何在Linux上如何配置虚拟主机
在Linux上配置虚拟主机可以通过使用Apache HTTP服务器来实现。Apache是一个开源的跨平台的Web服务器软件,可以在多种操作系统上运行并支持虚拟主机的配置。 以下是在Linux上配置虚拟主机的步骤: 安装Apache HTTP服务器 在终端中运行以下命令来安装Apache…...
c语言alpha-beta剪枝六子棋
c语言Alpha-Beta剪枝算法六子棋[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-2i5w8kc1-1720756528545)(https://i-blog.csdnimg.cn/direct/464b9db7d6384a63ab8c3213efff0e99.png)] 1.介绍 Alpha-Beta剪枝算法是一种用于优化博弈树搜索的算法&…...
基于PyTorch深度学习实践技术应用
近年来,Python语言由于其开源、简单等特点,受到了广大程序开发者的偏爱,丰富的函数库使得其在各行各业中得到了广泛的应用。伴随着新一轮人工智能(尤其是深度学习)的快速发展,许多深度学习框架应运而生&…...
数据湖仓一体(五)安装spark
上传安装包到/opt/software目录并解压 [bigdatanode106 software]$ tar -zxvf spark-3.3.1-bin-hadoop3.tgz -C /opt/services/ 重命名文件 [bigdatanode106 services]$ mv spark-3.3.1-bin-hadoop3 spark-3.3.1 配置环境变量 [bigdatanode106 ~]$ sudo vim /etc/profile…...
claude code用户如何迁移到taotoken解决封号与token不足问题
🚀 告别海外账号与网络限制!稳定直连全球优质大模型,限时半价接入中。 👉 点击领取海量免费额度 Claude Code 用户如何迁移到 Taotoken 解决封号与 Token 不足问题 应用场景类,针对 Claude Code 用户常遇封号与 Token…...
招行+工行:ReAct(Reasoning + Acting) 讲清楚,并结合 金融场景(含自进化智能体) 给出可直接用的案例
下面我把 ReAct(Reasoning Acting) 讲清楚,并结合 ** 金融场景(含自进化智能体)** 给出可直接用的案例与话术,适合分享 / 汇报。一、ReAct 是什么(一句话)ReAct 推理(T…...
实战解锁:在Blender中掌握专业级MMD动画制作全流程
实战解锁:在Blender中掌握专业级MMD动画制作全流程 【免费下载链接】blender_mmd_tools MMD Tools is a blender addon for importing/exporting Models and Motions of MikuMikuDance. 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/bl/blender_mmd_tools MMD …...
C语言预处理指令全解析
第六章 预处理命令在c语言中,所有# 开头的指令,被称为预处理指令。gcc 编译预处理 所有的预处理指令,都要在这步处理完汇编编译连接#include包含头文件。 全局变量的声明,函数的声明, 自定义构造类型声明, …...
Claude Mythos Preview首月揪万余漏洞、拦截150万美元电诈,网络安全格局将变?
玻璃翼计划首战告捷A厂的玻璃翼计划首战告捷,Mythos 30天内就挖出1万个致命漏洞,甚至拦截了150万美元电诈。面对雪片式的报告,人类程序员崩溃求饶:「求别挖了,根本修不完啊!」就在刚刚,Anthropi…...
模拟调音台数字化改造:基于STM32与MOTU音频接口的智能控制方案
1. 项目概述:为老旧模拟调音台注入数字灵魂在不少社区广播电台、校园电台或是小型制作室里,你依然能看到那些服役了十几年甚至几十年的模拟调音台。它们皮实耐用,推子手感扎实,旋钮的阻尼感让人安心,但面对如今以数字文…...
Infineon/Cypress设备上Keil C51评估编译器4K版本使用指南
1. C51评估编译器在Infineon/Cypress设备上的使用指南作为一名长期从事嵌入式开发的工程师,我经常需要处理各种编译器的授权和版本问题。最近在Infineon/Cypress平台上使用Keil C51编译器时,遇到了评估版2K代码限制的问题。经过一番探索,我发…...
将 Claude Code 的 API 请求无缝迁移至 Taotoken 平台
🚀 告别海外账号与网络限制!稳定直连全球优质大模型,限时半价接入中。 👉 点击领取海量免费额度 将 Claude Code 的 API 请求无缝迁移至 Taotoken 平台 如果你正在使用 Claude Code 作为编程助手,并且希望将其后端 AP…...
展锐RM500U 5G CPE固件升级避坑指南:为什么你的QFlash总卡在‘开始下载’?
展锐RM500U 5G CPE固件升级疑难解析:从QFlash卡顿到完美升级的实战手册 当你的展锐RM500U 5G CPE设备需要固件升级时,QFlash工具本应是简单高效的解决方案。然而,许多用户在点击"Start"按钮后,却遭遇了进度条停滞不前的…...
终极魔兽争霸III优化指南:如何使用WarcraftHelper提升游戏体验
终极魔兽争霸III优化指南:如何使用WarcraftHelper提升游戏体验 【免费下载链接】WarcraftHelper Warcraft III Helper , support 1.20e, 1.24e, 1.26a, 1.27a, 1.27b 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/wa/WarcraftHelper WarcraftHelper是一款专门为…...
