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生信技能55 - WisecondorX分析结果过滤和质控

WisecondorX分析CNV,对每条染色的CNV loss和gain进行分组,对每个组求ratio平均值和zscore平均值,基于该数值对CNV进行质控和过滤,并对连续的CNV进行合并,获得可信的CNV。

WisecondorX基本使用方法以及npz文件转换和reference构建参考文章:

生信技能53 - wiseconrdoX自动化批量npz转换和reference构建

生信技能54 - WisecondorX多线程并行分析CNV

github: https://github.com/CenterForMedicalGeneticsGhent/wisecondorX

在这里插入图片描述

WisecondorX分析结果过滤和质控

import pandas as pd
import os
from pathlib import Path

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