Pymol开源版安装 新版 3.0 / 3.1 Windows安装Pymol开源版
PyMOL 简介
PyMOL 是一个开源的分子可视化系统,被广泛应用于结构生物学中。它允许用户可视化分子结构,并创建高质量的蛋白质、核酸和其他大分子的3D图像。多年来,PyMOL不断发展,新版本引入了更多的功能和改进。
PyMOL 3.0 / 3.1 的安装
安装 PyMOL 3.0 或 3.1 非常简单,可以在 Windows、macOS 和 Linux 等各种操作系统上进行。以下是最新版本 PyMOL 的安装步骤。
在 Windows 上安装 PyMOL 3.0 / 3.1
- 下载安装程序: 访问 PyMOL 网站 并下载 Windows 安装程序。
- 运行安装程序: 双击下载的文件,按照安装向导进行操作。
- 完成安装: 安装完成后,可以从开始菜单或桌面快捷方式启动 PyMOL。
这种版本是需要安装许可证的,因此不算开源版。
在 macOS 上安装 PyMOL 3.0 / 3.1
- 下载安装程序: 访问 PyMOL 网站 并下载 macOS 安装程序。
- 打开安装程序: 双击下载的 .dmg 文件,将 PyMOL 拖动到应用程序文件夹。
- 启动 PyMOL: 打开应用程序文件夹,双击 PyMOL 启动应用程序。
这种版本是需要安装许可证的,因此不算开源版。
解法:通过其他方式去安装开源的版本,windows安装开源的版本可以通过Minconda来进行,但是mac并不适用。
PyMOL 2.6 与 PyMOL 3.1 的对比
1. 用户界面和可用性:
- PyMOL 2.6: 界面功能强大,但设计较旧,对于新用户可能不太直观。
- PyMOL 3.1: 这一版本引入了更为精致和用户友好的界面,提升了可用性,使用户更容易导航和执行任务。
2. 性能提升:
- PyMOL 2.6: 性能稳定,能够满足大多数分子可视化任务的需求。
- PyMOL 3.1: 在渲染速度和整体性能方面有显著提升,特别是在处理大型分子结构时。
3. 新功能:
- PyMOL 2.6: 基本的分子可视化功能,支持插件和脚本。
- PyMOL 3.1: 引入了新的可视化技术,更好地支持现代图形硬件,增强了脚本功能。
4. 支持和更新:
- PyMOL 2.6: 作为旧版本,支持和更新有限。
- PyMOL 3.1: 活跃的支持和频繁的更新,确保与最新的操作系统和硬件兼容。
结论
安装好后如下:


从 PyMOL 2.6 升级到 PyMOL 3.1 带来了许多改进,包括更好的性能、更直观的界面和新功能,提升了分子可视化体验。PyMOL 3.0 / 3.1 的安装过程在不同操作系统上都很简单,使其在科学社区中得到广泛应用。如果您仍在使用旧版本,强烈建议升级以利用这些增强功能。
相关文章:
Pymol开源版安装 新版 3.0 / 3.1 Windows安装Pymol开源版
PyMOL 简介 PyMOL 是一个开源的分子可视化系统,被广泛应用于结构生物学中。它允许用户可视化分子结构,并创建高质量的蛋白质、核酸和其他大分子的3D图像。多年来,PyMOL不断发展,新版本引入了更多的功能和改进。 PyMOL 3.0 / 3.1…...
记录一次环境的安装
目录 新添加的代码 代码解释 为啥ubuntu用debian软件源 为啥修改sources.list.d S权限意思 php缺少和数据库连接的模块 使用root登陆数据库1698错误 字段解释 auth_socket解释 使用root登陆数据库方法 详细解释 首先在安装的时候,有一个dockerfile文件&a…...
浏览器用户文件夹详解 - WebData(八)
1.WebData简介 1.1 什么是WebData文件? WebData文件是Chromium浏览器中用于存储用户表单数据、自动填充信息和支付信息的一个重要文件。每当用户在浏览器中填写表单或保存支付信息时,这些数据都会被记录在WebData文件中。通过这些记录,浏览…...
ijkplayer 自定义协议播放加密内容 Android
想对播放的音视频进行加密,防止资源被盗用,该怎么办呢? 这篇文章从自定义协议的角度来提供一中实现思路。在 ijkplayer 的基础上,通过实现自定义协议对文件进行解密。边解边播,以此为基础,还可以实现在线资…...
【kill】Centos/Linux 如何杀死那该死的进程?
简介 系统版本:Centos7.6 kill 命令发送指定的信号到指定的进程或者进程组。如果该信号没有指定,则发送SIGTERM信号(15),即终止信号。如果SIGTERM信号(15)无法终止,可使用SIGKILL&am…...
Cadence23学习笔记(十七)
吴老师的网站里面有很多cadence的开源项目,可以用来学习: 全志 H3 SOC 官方参考设计 DD3 16bitX2 原理图及PCB – 吴川斌的博客 (mr-wu.cn) cadence设置显示实时的走线长度: 在allegro进行布线时可以实时显示当先布线的实际长度有助于pcb的…...
WinFrom调用webapi接口方法及其应用实例
1.WinFrom调用webapi接口方法 最近项目要在winfrom项目中调用webAPI,故在网上查找资料,找到了一个WinFrom调用webapi接口的通用方法,关键代码: #region WinFrom调用webapi接口通用方法private async Task<string> InvokeWe…...
智能巡检企业级域名 SSL 证书
一、概述 SSL 证书是一种数字证书,用于在用户和服务器之间建立加密链接,确保数据传输的安全性,防止数据在传输过程中被截获或篡改。SSL 证书不仅保护了数据传输过程中的隐私和完整性,还可以帮助验证网站的身份,防止钓…...
海思35XX系列(三)sensor(传感器)
刚开始接触这个概念的时候感觉比较模糊,简单记录一下吧 Sensor(传感器)是一种可以感知外部环境并将感知到的信息转化为可用的电信号或其他形式的工具。传感器广泛应用于电子设备、工业自动化、汽车、医疗器械等领域,用于测量、监…...
dfs(续做)
1.混境之地5 #include<bits/stdc.h> using namespace std; typedef long long ll; const int dx[4] {0,1,0,-1}; const int dy[4] {1,0,-1,0}; int n,m,k,a,b,c,d,sign0; int h[1010][1010],visit[1010][1010]; void dfs(int x,int y,bool used) {if(xc&&yd){si…...
OpenStack;异构算力网络架构;算力服务与交易技术;服务编排与调度技术
目录 OpenStack 一、OpenStack概述 二、OpenStack的主要组件及功能 三、OpenStack的架构 四、OpenStack的应用场景 异构算力网络架构 算力服务与交易技术 服务编排与调度技术 OpenStack 是一个开源的云计算管理平台项目,由NASA(美国国家航空航天局)和Rackspace合作…...
PLC-Recorder对于数据采集时间戳偏差的修正功能
目录 一、修正原理 二、使用步骤 1、初始状态,计算修正系数 2、启动和使用 3、修正系数的手动修改 三、修正前后的效果对比 1、修正前的时间偏差曲线 2、修正后的效果曲线 四、注意事项 1、控制器可能的时钟波动 2、平移参数评估 3、参数保存 五、关于…...
自定义监控
代码说明: 导入必要的库 import time import psutil import GPUtil from prometheus_client import start_http_server, Summary, Counter, Gaugepsutil:用于获取系统的CPU、内存、磁盘和网络信息。GPUtil:用于获取GPU信息。prometheus_cli…...
关于使用php的mpdf插件遇到的一些问题
一.插件版本 "mpdf/mpdf": "^8.0", 二.报错:Undefined index: list_style_type 这个是插件无法识别 li 标签导致,生成pdf是加入下面代码 <style> li { list-style-type: none; list-style-image: none; list-style-positi…...
电脑截图,颜色变淡的问题解决
解决 Windows 11 在 HDR 模式下截图 Edge 浏览器界面时画面过曝的问题-腾讯云开发者社区-腾讯云 (tencent.com) 主要是浏览器用错了东西,调一下就好,详情看链接 联想拯救者y9000p为例,选择sRGB,就好啦,拜拜喽&#x…...
uniApp跳转外链
创建一个新的页面,在该页面中使用web-view组件加载外部URL:pages/web-view/web-view <template><view><uni-list><uni-list-itemtitle"打开外部链接"click"openExternalLink"></uni-list-item></…...
科技云报道:大模型引领技术浪潮,AI安全治理面临“大考”
科技云报道原创。 从文生文到文生图,再到文生视频,近年来,以ChatGPT、Sora等为代表的大模型引领了全球人工智能技术与产业的新一轮浪潮。2024年更是被业内称为大模型应用爆发元年。 年初,Sora横空出世验证了Scalling Law在视频生…...
SpringSecurity+Mysql数据库实现用户安全登录认证
Spring Security 是一个提供身份认证、授权和防范常见攻击的安全权限框架。无论是对命令式,还是响应式web应用程序都完美支持,现在主要用作保护基于 Spring 框架的应用程序的事实标准。相对于shiro来说,SpringSecurity功能更加复杂而且更加强…...
虚拟网卡添加ip
1.虚拟机网卡添加 1.进入虚拟机设置添加网卡即网络适配器 2.配置文件修改 1.查看网卡是否添加成功 ip ad ifconfig 其中ens161就是我们新添加的设备同时这个ens161也是我们硬件名字 2.进入系统配置文件 cd /etc/sysconfig/network-scripts/#配置文件目录[rootlocalhost ne…...
Unity向量线性插值Lerp
inline glm::vec3 Lerp(glm::vec3 start, glm::vec3 end, float t){t glm::clamp(t, 0.0f, 1.0f);return (start*(1-t)end*t); }...
深度学习在微纳光子学中的应用
深度学习在微纳光子学中的主要应用方向 深度学习与微纳光子学的结合主要集中在以下几个方向: 逆向设计 通过神经网络快速预测微纳结构的光学响应,替代传统耗时的数值模拟方法。例如设计超表面、光子晶体等结构。 特征提取与优化 从复杂的光学数据中自…...
19c补丁后oracle属主变化,导致不能识别磁盘组
补丁后服务器重启,数据库再次无法启动 ORA01017: invalid username/password; logon denied Oracle 19c 在打上 19.23 或以上补丁版本后,存在与用户组权限相关的问题。具体表现为,Oracle 实例的运行用户(oracle)和集…...
日语AI面试高效通关秘籍:专业解读与青柚面试智能助攻
在如今就业市场竞争日益激烈的背景下,越来越多的求职者将目光投向了日本及中日双语岗位。但是,一场日语面试往往让许多人感到步履维艰。你是否也曾因为面试官抛出的“刁钻问题”而心生畏惧?面对生疏的日语交流环境,即便提前恶补了…...
调用支付宝接口响应40004 SYSTEM_ERROR问题排查
在对接支付宝API的时候,遇到了一些问题,记录一下排查过程。 Body:{"datadigital_fincloud_generalsaas_face_certify_initialize_response":{"msg":"Business Failed","code":"40004","sub_msg…...
RocketMQ延迟消息机制
两种延迟消息 RocketMQ中提供了两种延迟消息机制 指定固定的延迟级别 通过在Message中设定一个MessageDelayLevel参数,对应18个预设的延迟级别指定时间点的延迟级别 通过在Message中设定一个DeliverTimeMS指定一个Long类型表示的具体时间点。到了时间点后…...
SCAU期末笔记 - 数据分析与数据挖掘题库解析
这门怎么题库答案不全啊日 来简单学一下子来 一、选择题(可多选) 将原始数据进行集成、变换、维度规约、数值规约是在以下哪个步骤的任务?(C) A. 频繁模式挖掘 B.分类和预测 C.数据预处理 D.数据流挖掘 A. 频繁模式挖掘:专注于发现数据中…...
pam_env.so模块配置解析
在PAM(Pluggable Authentication Modules)配置中, /etc/pam.d/su 文件相关配置含义如下: 配置解析 auth required pam_env.so1. 字段分解 字段值说明模块类型auth认证类模块,负责验证用户身份&am…...
1.3 VSCode安装与环境配置
进入网址Visual Studio Code - Code Editing. Redefined下载.deb文件,然后打开终端,进入下载文件夹,键入命令 sudo dpkg -i code_1.100.3-1748872405_amd64.deb 在终端键入命令code即启动vscode 需要安装插件列表 1.Chinese简化 2.ros …...
汇编常见指令
汇编常见指令 一、数据传送指令 指令功能示例说明MOV数据传送MOV EAX, 10将立即数 10 送入 EAXMOV [EBX], EAX将 EAX 值存入 EBX 指向的内存LEA加载有效地址LEA EAX, [EBX4]将 EBX4 的地址存入 EAX(不访问内存)XCHG交换数据XCHG EAX, EBX交换 EAX 和 EB…...
uniapp中使用aixos 报错
问题: 在uniapp中使用aixos,运行后报如下错误: AxiosError: There is no suitable adapter to dispatch the request since : - adapter xhr is not supported by the environment - adapter http is not available in the build 解决方案&…...
