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安装bedtools详细步骤和详细介绍bedtools用法

安装bedtools详细步骤和详细介绍bedtools用法

  • 一、安装bedtools详细步骤
    • 下载
    • 解压
    • 安装编译依赖
    • 编译
    • 设置环境变量
    • 激活环境变量
    • 执行命令查看版本
  • 二、详细介绍bedtools用法
    • 使用bedtools
    • 示例用法
      • bedtools intersect
      • bedtools bamtobed
      • bedtools window

一、安装bedtools详细步骤

下载

wget https://github.com/arq5x/bedtools2/releases/download/v2.31.1/bedtools-2.31.1.tar.gz

解压

tar -zxvf bedtools-2.29.1.tar.gz

安装编译依赖

yum install -y gcc
yum install -y glibc-headers
yum install -y libreadline6-dev gfortran
yum install -y readline-devel
yum 

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