RDKit|分子输入输出格式解析（如 SMILES、Mol、SDF）

2.3 分子输入输出格式解析（如 SMILES、Mol、SDF）

在化学信息学中，分子的表示方式有很多种，常见的包括 SMILES、Mol 文件、SDF 文件等。RDKit 支持对这些格式的分子数据进行解析和处理，这使得它在化学和药物设计领域得到了广泛应用。本节将介绍如何在 RDKit 中解析和操作这些分子输入输出格式，帮助你了解并掌握分子数据的处理方法。

2.3.1 SMILES 格式

SMILES（Simplified Molecular Input Line Entry System）是一种简洁且广泛使用的分子表示方法。SMILES 用字符串来描述分子的结构，能够简单、直观地表示分子信息。

2.3.1.1 从 SMILES 解析分子

在 RDKit 中，解析 SMILES 格式非常简单，只需调用 Chem.MolFromSmiles 函数即可。

示例：从 SMILES 解析分子

from rdkit import Chem# SMILES 字符串
smiles = 'CCO'