mamba的安装及下载速度慢问题解决

同事反馈mamba的安装时网络慢

mamba是conda的加速工具，相比于conda 对包和环境的管理，mamba可以实现并行运算。相比于 conda，mamba 是用C++重写了 conda 的部分功能，运行效率显著提高，可以进行并行的下载，使用管理工具中的 libsolv，可以更快的解决环境依赖问题。mamba 的使用也比较简单，首先使用 conda 安装 mamba，后面所有用到 conda 的地方，都可以使用 mamba 替换即可。

下载安装miniconda

wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
chmod +x Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh #给下载下来的安装文件添加执行权限
sudo bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

配置环境，vi ~/.bashrc 在最后添加下面内容

# >>> conda initialize >>>
# !! Contents within this block are managed by 'conda init' !!
__conda_setup="$('/root/miniconda3/bin/conda' 'shell.bash' 'hook' 2> /dev/null)"
if [ $? -eq 0 ]; theneval "$__conda_setup"
elseif [ -f "/root/miniconda3/etc/profile.d/conda.sh" ]; then. "/root/miniconda3/etc/profile.d/conda.sh"elseexport PATH="/root/miniconda3/bin:$PATH"fi
fi
unset __conda_setup
# <<< conda initialize <<<

运行source ~/.bashrc  使配置生效

更新conda

conda update -n base conda

安装并设置新的求解器（好像不用装也行）

conda install -n base conda-libmamba-solver
conda config --set solver libmamba

 

安装mamba

conda install mamba -n base -c conda-forge

看到确实下载比较慢，使用命令查看网络连接

netstat -antlp | grep python

在防火墙配置把相关ip调整到其它互联网出口，看到下载速度上来了，可能5-10MB/s 

 也可通过修改conda源来提供下载速度。 cat .condarc

channels:- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/r/show_channel_urls: truedefault_channels:- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/r- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2custom_channels:conda-forge: https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloudmsys2: https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloudbioconda: https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloudmenpo: https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloudpytorch: https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloudsimpleitk: https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud