生信名词|MOA|基因敲低与基因敲除|DMSO|MODZ|生信基础
生信名词|MOA|基因敲低与基因敲除|DMSO|MODZ|生信基础
MOA(Mechanisms Of Action,作用机理)
过去,在药物投入到临床使用之前,它的生物学机理往往未被研究透彻。如今,随着技术的发展,一种新药物的研制更多的是基于对疾病的生物学机理的理解。在这种情况下,科学家们希望能够鉴定与疾病相关的靶蛋白,并开发出能够调节该靶蛋白的药物,一种给定分子(药物)的生物学活性,就被称为Mechansim of Action,简称MoA。
药物MoA的测定方法:其中的一种方法是对人体细胞加以药物作用,然后从细胞的反馈与已知MoA的药物可以带来的反馈做相似性比较进行推断。比赛要求建立以细胞反馈(基因表达与细胞活性数据)为特征,MoA为标签的模型,从而对未知药物的MoA进行预测。
基因敲低(gene knockdown)/敲除(gene knockout)
基因敲低
是指在细胞或生物体中通过RNA干扰(RNAi)等方法降低目标基因表达水平,使其功能受到抑制。
基因敲除
则是通过基因组编辑技术等手段,将目标基因的DNA序列从细胞或生物体中彻底删除或失活,阻断其转录和翻译过程,使目标基因完全失去功能,同时还可获得与基因敲低不同的表型。
DMSO
一种溶剂,用于和药物处理的细胞做对照用,相当于对照组。
MODZ,中度Z加权平均算法,moderated-Z weighted averages algorithm
链接:点击这里查看算法
相关文章:
生信名词|MOA|基因敲低与基因敲除|DMSO|MODZ|生信基础
生信名词|MOA|基因敲低与基因敲除|DMSO|MODZ|生信基础 MOA(Mechanisms Of Action,作用机理) 过去,在药物投入到临床使用之前,它的生物学机理往往未被研究透彻。如今,随着技术的发展,一种新药物…...
基础岛第3关:浦语提示词工程实践
模型部署 使用下面脚本测试模型 from huggingface_hub import login, snapshot_download import osos.environ[HF_ENDPOINT] https://hf-mirror.comlogin(token“your_access_token")models ["internlm/internlm2-chat-1_8b"]for model in models:try:snapsh…...
vscode中配置python虚拟环境
python虚拟环境作用 Python虚拟环境允许你为每个独立的项目创建一个隔离的环境,这样每个项目都可以拥有自己的一套Python安装包和依赖,不会互相影响。实际使用中,可以在vscode或pycharm中使用虚拟环境。 1.创建虚拟环境的方法: …...
chatGPT对我学术写作的三种帮助
chatGPT对我学术写作的三种帮助 概述提高学术写作水平大模型选择概述上下文以提供精确的指令 提升同行评审优化编辑反馈 概述 从生成式人工智能中获得的价值并非来自于技术本身盲目地输出文本,而是来自于与工具的互动,并利用自身的专业知识来完善它所生…...
【PostgreSQL 】入门篇——支持的各种数据类型介绍,包括整数、浮点数、字符串、日期、JSON、数组等
1. 整数类型 1.1 SMALLINT 描述:用于存储小范围的整数值。大小:2 字节范围:-32,768 到 32,767使用场景:适合存储小型计数器、状态码等。示例: CREATE TABLE status_codes (id SMALLINT PRIMARY KEY,description TEX…...
野火STM32F103VET6指南者开发板入门笔记:【1】点亮RGB
硬件介绍 提示:本文是基于野火STM32F103指南者开发板所写例程,其他开发板请自行移植到自己的工程项目当中即可。 RGB-LEDPin引脚:低电平-点亮,高电平-熄灭REDPB5GREENPB0BLUEPB1 文章目录 硬件介绍软件介绍:结构体方式…...
数据工程师岗位常见面试问题-3(附回答)
数据工程师已成为科技行业最重要的角色之一,是组织构建数据基础设施的骨干。随着企业越来越依赖数据驱动的决策,对成熟数据工程师的需求会不断上升。如果您正在准备数据工程师面试,那么应该掌握常见的数据工程师面试问题:包括工作…...
强大的JVM监控工具
介绍 在生产环境中,经常会遇到各种各样奇葩的性能问题,所以掌握最基本的JVM命令行监控工具还是很有必要的 名称主要作用jps查看正在运行的Java进程jstack打印线程快照jmap导出堆内存映像文件jstat查看jvm统计信息jinfo实时查看和修改jvm配置参数jhat用…...
python 实现点的多项式算法
点的多项式算法介绍 点的多项式算法通常指的是通过一组点(即数据点,通常包括自变量和因变量的值)来拟合一个多项式函数的方法。这种方法在数值分析、统计学、机器学习等领域中非常常见。下面是一些常见的多项式拟合算法: 1. 最小…...
Pikachu-暴力破解-验证码绕过(on client)
访问页面, 从burpsuite 上看到返回的源代码; 验证码生成时通过 createCode 方法生成,在前端页面生成; 同时也是在前端做的校验; 直接验证;F12 -- 网络,随便输入个账号、密码、验证码࿰…...
【Spring】Bean 的生命周期:从实例化到销毁
实例化阶段: Bean的实例化是通过反射创建的。Spring根据Component、Bean或者XML中的<bean>元素配置,来确定要创建的Bean。 属性赋值阶段: 实例化完成后,Spring会进行依赖注入。包括将属性值注入到Bean的字段中,…...
Ubuntu 安装RUST
官方给的是这样如下脚本 curl --proto https --tlsv1.2 -sSf https://sh.rustup.rs | sh 太慢了 curl --proto https --tlsv1.2 -sSf https://sh.rustup.rs | sh -x 执行这个脚本后会给出对应的下载链接 如下图 我直接给出来 大多数应该都是这个 https://static.rust-…...
Android Compose的基本使用
前言: Compose这个东西呢,好处我没发现,坏处就是学习成本和低版本兼容. 不过,看在官方力推的份儿上,有空就学一下吧. 当初的kotlin,很多人说鸡肋(包括我)!现在不也咔咔用纯kotlin做项目吗?哈哈哈哈. 未来的事情,谁说得清呢? 首先创建一个专用的Compose项目 对没错!看到E…...
计算机网络:计算机网络体系结构 —— 专用术语总结
文章目录 专用术语实体协议服务服务访问点 SAP 服务原语 SP 协议数据单元 PDU服务数据单元 SDU 专用术语 实体 实体是指任何可以发送或接收信息的硬件或软件进程 对等实体是指通信双方处于相同层次中的实体,如通信双方应用层的浏览器进程和 Web 服务器进程。 协…...
Rust的前端Tauri编程-基于JS框架的初步探索
上次的项目做完后,有一项遗憾,没有返回结果,而结果是一个html表格,我想用html直接在窗口显示,这时发现R里面包括slint没有很直接的方法,直接弹出浏览器有点太简单没有挑战。这是就被推送了他的竞争对手&…...
【Flume Kafaka实战】Using Kafka with Flume
一 目标 在Cloudera Manager中创建两个Flume的Agent,Agent1从local file中获取内容,写入到kafka的队列中。Agent2以Agent1的sink作为source,将数据从kafka中读取出来,写入到HDFS中。 二 实战 2.1 Kafka Sink 第一步࿰…...
5G NR物理信号
文章目录 NR 物理信号与LTE的区别上行参考信号DMRS (UL)SRSPT-RS(UL) 下行参考信号DMRS(DL)PT-RS(DL)CSI-RSPSSSSS NR 物理信号与LTE的区别 用SSS、CSI-RS和DMRS 取代了CRS信号。下行业务信道采用TM1波束赋形传输模式。基于SSB 或者CSI-RS进行RSRP和SINR测量。基于DMRS 进行共…...
Pikachu-Cross-Site Scripting-存储型xss
存储型xss ,随便输入点内容,都能保存下来;刷新后也不会丢失;输入特殊字符,也能原样返回; 查看代码,也可以看到输出结果直接原路返回,不做处理 构造payload <script>alert(1)…...
媲美GPT-4o mini的小模型,Meta Llama 3.2模型全面解读!
大家好,我是木易,一个持续关注AI领域的互联网技术产品经理,国内Top2本科,美国Top10 CS研究生,MBA。我坚信AI是普通人变强的“外挂”,专注于分享AI全维度知识,包括但不限于AI科普,AI工…...
【leetcode】 45.跳跃游戏 ||
如果我们「贪心」地进行正向查找,每次找到可到达的最远位置,就可以在线性时间内得到最少的跳跃次数。 例如,对于数组 [2,3,1,2,4,2,3],初始位置是下标 0,从下标 0 出发,最远可到达下标 2。下标 0 可到达的…...
挑战杯推荐项目
“人工智能”创意赛 - 智能艺术创作助手:借助大模型技术,开发能根据用户输入的主题、风格等要求,生成绘画、音乐、文学作品等多种形式艺术创作灵感或初稿的应用,帮助艺术家和创意爱好者激发创意、提高创作效率。 - 个性化梦境…...
web vue 项目 Docker化部署
Web 项目 Docker 化部署详细教程 目录 Web 项目 Docker 化部署概述Dockerfile 详解 构建阶段生产阶段 构建和运行 Docker 镜像 1. Web 项目 Docker 化部署概述 Docker 化部署的主要步骤分为以下几个阶段: 构建阶段(Build Stage):…...
MPNet:旋转机械轻量化故障诊断模型详解python代码复现
目录 一、问题背景与挑战 二、MPNet核心架构 2.1 多分支特征融合模块(MBFM) 2.2 残差注意力金字塔模块(RAPM) 2.2.1 空间金字塔注意力(SPA) 2.2.2 金字塔残差块(PRBlock) 2.3 分类器设计 三、关键技术突破 3.1 多尺度特征融合 3.2 轻量化设计策略 3.3 抗噪声…...
简易版抽奖活动的设计技术方案
1.前言 本技术方案旨在设计一套完整且可靠的抽奖活动逻辑,确保抽奖活动能够公平、公正、公开地进行,同时满足高并发访问、数据安全存储与高效处理等需求,为用户提供流畅的抽奖体验,助力业务顺利开展。本方案将涵盖抽奖活动的整体架构设计、核心流程逻辑、关键功能实现以及…...
Appium+python自动化(十六)- ADB命令
简介 Android 调试桥(adb)是多种用途的工具,该工具可以帮助你你管理设备或模拟器 的状态。 adb ( Android Debug Bridge)是一个通用命令行工具,其允许您与模拟器实例或连接的 Android 设备进行通信。它可为各种设备操作提供便利,如安装和调试…...
OkHttp 中实现断点续传 demo
在 OkHttp 中实现断点续传主要通过以下步骤完成,核心是利用 HTTP 协议的 Range 请求头指定下载范围: 实现原理 Range 请求头:向服务器请求文件的特定字节范围(如 Range: bytes1024-) 本地文件记录:保存已…...
JUC笔记(上)-复习 涉及死锁 volatile synchronized CAS 原子操作
一、上下文切换 即使单核CPU也可以进行多线程执行代码,CPU会给每个线程分配CPU时间片来实现这个机制。时间片非常短,所以CPU会不断地切换线程执行,从而让我们感觉多个线程是同时执行的。时间片一般是十几毫秒(ms)。通过时间片分配算法执行。…...
mysql已经安装,但是通过rpm -q 没有找mysql相关的已安装包
文章目录 现象:mysql已经安装,但是通过rpm -q 没有找mysql相关的已安装包遇到 rpm 命令找不到已经安装的 MySQL 包时,可能是因为以下几个原因:1.MySQL 不是通过 RPM 包安装的2.RPM 数据库损坏3.使用了不同的包名或路径4.使用其他包…...
Yolov8 目标检测蒸馏学习记录
yolov8系列模型蒸馏基本流程,代码下载:这里本人提交了一个demo:djdll/Yolov8_Distillation: Yolov8轻量化_蒸馏代码实现 在轻量化模型设计中,**知识蒸馏(Knowledge Distillation)**被广泛应用,作为提升模型…...
代码随想录刷题day30
1、零钱兑换II 给你一个整数数组 coins 表示不同面额的硬币,另给一个整数 amount 表示总金额。 请你计算并返回可以凑成总金额的硬币组合数。如果任何硬币组合都无法凑出总金额,返回 0 。 假设每一种面额的硬币有无限个。 题目数据保证结果符合 32 位带…...
