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R语言实现GWAS meta分析（1）

news 2026/1/30 1:36:33

1、基于数据集的Meta分析

datafilename=c("data1.txt","data2.txt"),
setwd(workdir)
library(Metalgwas)
a=1
name1=c()
for(i in datafilename){  assign(paste("file",a,sep=""),data.table::fread(paste(getwd(),"/","data",a,".txt",sep="")))name1=c(name1,paste(workdir,"//","data",a,".txt",sep=""))a=a+1}
METAL_gwas(GWASfile =name1, Metal_path = "XXXX",#/metal.exe : 放入下载好的软件save_path = "./", GWAS_name = “dat1”, type = "outcome",Analysis_Scheme = "SE", heterogeneity = TRUE, Average_FREQ = TRUE, MinMax_FREQ = TRUE, Filter_N = FALSE, Filter_MAF = 0.01, Genomic_Control_Correction = FALSE, Sample_Overlap_Correction = FALSE)

需要下载metal：Metal - Meta Analysis Helper for SNP data

得出来结果在文件夹中dat1.txt

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「二叉树进阶题解：构建、遍历与结构转化全解析」

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1. 代理IP的质量和稳定性直接影响爬虫的效果。因此&#xff0c;我们需要定期更新代理IP列表&#xff0c;并筛选出可用的代理IP。 2. 有些代理IP可能存在被目标网站封禁的风险。因此&#xff0c;我们需要合理使用代理IP&#xff0c;避免过度频繁地访问目标网站。 3. 在使用代…...

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