R语言与作物模型（以DSSAT模型为例）融合应用

    随着基于过程的作物生长模型（Process-based Crop Growth Simulation Model）的发展，R语言在作物生长模型和数据分析、挖掘和可视化中发挥着越来越重要的作用。想要成为一名优秀的作物模型使用者与科研团队不可或缺的人才，除了掌握对作物模型相关知识之外，还要掌握模型的快速模拟和高效数据分析能力。Decision Support Systems for Agrotechnology Transfer (简称DSSAT)模型是世界知名的作物生长模拟模型之一。现有版本V4.7能模拟27种主要农作物的生长发育和产量形成过程，被广泛应用于精细农业、水肥管理、气候变化、粮食安全、土碳循环、环境影响、农业可持续性、农业生态等诸多与农业生产和科研有关的领域。R语言在DSSAT模型的气候、土壤、管理措施等数据准备，自动化模拟和结果分析上都发挥着重要的作用。因此，为辅助提高作物模型工作者的使用DSSAT模型的技术，我们举办了本次R语言与作物模型高级应用实战技术培训班，让大家不需要使用界面操作就可以快速批量运行DSSAT模型，方便各个领域可以更好地交叉融合、扩展应用。本次培训我们精选大量作物模型应用案例，九大专题（独孤九剑），全程干货，让参训学员熟悉R语言编程技术和DSSAT这一综合型农业生态系统模型，提高学员模型应用能力、数据分析和图表制作技能。如果你是资深模型爱好者，这次培训可以进一步了解各个模块的相关算法；如果你是个模型入门者，这次培训将让你体验一键模拟的乐趣。

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专题一 DSSAT模型的高级应用
1.作物模型的概念
2.DSSAT模型发展现状
3.DSSAT与R语言的安装与介绍
4.DSSAT模型的高级应用案例
5.R语言在作物模型参数优化中的应用
6.R语言在作物模型全球栅格模拟中的应用
7.R语言在作物模型结果分析和数据可视化中的应用

专题二 R语言与数据科学
1 R语言与数据科学
1)R语言发展脉络
2)R语言数据操作技巧
3)R语言在作物模型中的应用
2 R语言编程技巧数据操作
1)R与工作目录
2)R的数据类型及结构
3)R中各数据类型的赋值与操作
4)各种数据格式的读写及操作

专题三 DSSAT模型高级应用技巧
1 DSSAT模型操作
1)DSSAT的安装
2)DSSAT模型操作界面讲解
2 DSSAT模型源码操作与编译
1）DSSAT模型源码安装
2）DSSAT源码的介绍与修改
3）DSSAT源码的编译

专题四 R语言准备DSSAT气象文件
1 DSSAT自带的气象数据的准备
2 R语言操作和准备气象文件
1）DSSAT气象文件的介绍
2）日照转辐射算法的编写
3）DSSAT气象文件的编写

专题五 R语言准备DSSAT土壤文件
1 DSSAT模型的土壤模块及土壤输入参数
2 DSSAT模型土壤水分-氮素-有机碳模块的主要算法
3 DSSAT模型土壤参数在数据缺失情况下的近似估算
4 使用R语言操作和准备土壤输入文件
5 DSSAT模型全球土壤数据库的使用

专题六 R语言准备DSSAT管理文件
1 DSSAT模型的农田管理措施（播期、密度、施肥、灌溉、有机肥、秸秆还田等）的介绍
2 使用R语言进行管理文件批量准备（只需要填写excel，就能批量模拟）

专题七 R语言准备DSSAT参数文件及批量模拟文件
1 DSSAT模型的主要遗传参数，包括物种参数、生态型参数、品种参数
2 主要的参数优化方法
3 使用R语言进行参数文件准备
4 使用R语言对批量模拟文件的编写

专题八 R语言对模拟结果进行数据清洗和整理
1 使用R语言读取DSSAT文件的模拟结果
2 对模拟结果进行数据清洗、分类和整理

专题九 R语言对模拟结果进行数据分析及绘图
1 使用R语言对模拟结果进行分析
2 使用R语言计算模拟结果的MSE、RMSE、MAE、d-value、EF值
3 使用R语言对模拟结果进行可视化（模拟结果的动态图和1：1图等）

附加课程
学员根据科研或生产实际，提供数据，集体讨论DSSAT的高级应用方案
提供若干附加材料，包括典型论文、其它软件以及学习材料
实例回顾、训练、巩固
答疑与讨论