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Cytoscape学习教程

news 2026/2/9 21:51:56

写在前面

今天分享的内容是自己遇到问题后，咨询社群里面的同学，帮忙解决的总结。

关于Cytoscape，对于做组学或生物信息学的同学基本是陌生的，可能有的同学用这个软件作图是非常溜的，做出来的网络图也是十分的好看，“可玩性”很高，就像前面分享的aPEAR包一样aPEAR包绘制功能富集网络图。自己在前面写论文的时候也是一直在使用，以前使用的版本是3.3.0的版本。但是，时间一长，很多操作都忘记。今天，在自己的台式机上使用Cytoscape软件，想要安装插件，但是发现3.3.0这个版本安装不了。随后，在社群咨询，各位同学也给出目前各自正常使用的版本。我们也就此机会，记录一下，分享一下。

社群同学给出使用版本

注意：考虑到Cytoscape安装包下载，需要开梯子，我们这里已经下载好了对应的包，大家可以回复关键词获得链接。

后台回复关键词：20231129或Cytoscape即可获得下载链接

一、Cytoscape下载网址

https://cytoscape.org/

  1. 下载最新版本

    由于最新版本，有同学反应无法下载插件，我们在这里就不安装最新的版本。
  2. 下载 Old Version
  3. 下载对应的版本

    我们在这里一共下载了3.8.0-3.9.1的版本.
    4.下载对应的版本

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