R语言复现:如何利用logistic逐步回归进行影响因素分析?
Logistic回归在医学科研、特别是观察性研究领域,无论是现况调查、病例对照研究、还是队列研究中都是大家经常用到的统计方法,而在影响因素研究筛选自变量时,大家习惯性用的比较多的还是先单后多,P<0.05纳入多因素研究,很少用逐步回归法,有些同学可能听过但是了解也不多,这里先简单介绍一下。
那么什么时候推荐用逐步回归呢?有以下2种情况,可以考虑使用:
①构建预测模型时候,就放心大胆的用。其他场景,一般不建议用逐步回归法。
②探索性研究、探讨多个影响因素时,候选的影响因素实在太多(单因素分析后P值<0.05者,仍然超过10个),或者样本量不大。
逐步回归法的原理听上去很复杂,但是用R语言几行代码也可以搞定,只是R语言需要一定的代码基础,一时半会儿也无法学会,因此,这里结合实操案例为大家介绍一个智能在线免费统计分析平台——风暴统计。
一、实操数据介绍
这里我们使用的是R语言自带数据集MASS中的birthwt,birthwt是一份与婴儿出生体重低相关的危险因素数据,其中包含的变量见下表,根据研究设计,以“low”作为结局变量。
二、风暴统计智能在线免费平台复现
目前风暴统计平台可以非常快速准确的完成logistic回归,只需2步!
选入回归自变量
选择自变量筛选方式
全部是菜单式操作,完成后,界面直接给出规范三线表结果!还可以随着变量的调整实时更新结果,在数据探索初期,可以节省不少工作量!在撰写报告时,也不用再手工绘制三线表,填写数据了!统计小白也可以轻松上手!
1.logistic回归自变量选择
首先,选入变量,包括因变量、定量自变量、分类自变量。
①因变量
这里因变量建议使用0和1进行表示,0代表阴性结局(如:未患病、二分类变量中值较小的组),1代表阳性结局(如:患病或二分类结局中值较大的组)。
②定量自变量
平台会将分类数大于5的变量自动归为定量自变量,并在选取定量自变量时,优先显示在上方,便于选取。
③分类自变量
同理,分类数小于5类的变量归入分类变量,在选取变量时,优先显示分类变量。
接着,选择自变量的筛选方式,包括先单后多法、逐步回归法。
2.选择自变量筛选方式
根据研究需要,如果需要开展先单后多的自变量筛选方式,那么“是否开展逐步回归分析”选择“否”。P阈值自行选择,如果自变量个数过少,可以适当放宽标准,0.1、0.2也都是可以的。当选择不限制时,选入的全部自变量都将纳入多因素回归分析。
如果需要选择逐步回归法,平台也提供了多种选择:双向逐步回归,向前逐步回归,向后逐步回归以及考虑到有时P值大于0.05的变量在逐步回归时也会留在模型中,新增了根据P<0.05的原则开展逐步回归!
这里我们选择单因素P<0.05的变量进入多因素开展逐步回归。
3.下载结果
平台给出了多种结果展示,仅展示单因素回归结果,仅展示多因素回归结果,单因素+多因素显示在同一个表格中!
然后也可以选择小数位数,默认情况下,P值为3位小数,其他统计量为2位小数。
指定小数位数后,P值与统计量的小数位数将会统一。调整完成后,下载最终的三线表结果,平台支持下载excel或word!
三、R语言软件复现
这里采用autoReg包,autoReg包是一款功能十分强大的R包,不仅可以快捷完成基线表的制作,还可以直接一行代码输出回归分析(支持线性模型、广义线性模型和比例风险模型)的表格。
1.logistic回归模型构建
使用glm() 函数构建回归模型,glm(y~x1+x2+x3+x4+x......,data=数据集名,family="binomial"),指定因变量与自变量,设置数据集名。
logfit<-glm(low ~ age + lwt + race + smoke + ptd + ht + ui + ftv,data=bwt,family = "binomial")
summary(logfit)
此处参数family规定了回归模型的类型:family="binomial"指适用于二元离散因变量(binary)。
2.逐步回归法
autoReg逐步回归法的参数,就是Final=T 还是F,Final=T 提供逐步回归分析结果。另外,还有threshold,设定P值来挑选单因素分析的变量开展多因素回归。
logreg4<-autoReg(logfit,uni=TRUE,threshold=0.05, final=T) #final=T逐步回归
logreg4
logtable4<-myft(logreg4)
四、总结
通过对比,风暴统计与R语言先单后多的分析结果完全一致,风暴统计对于P值还有单独成列,结果更加清晰直观!这也是由于平台的构建依托于R代码进行分析。同时结果输出更加快捷,迅速,大家进行统计分析时不妨试一试!
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