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Python白练-2统计下列5行字符串中字符出现的频数

问题:统计下列5行字符串中字符a、c、g、t出现的频数

数据:data2_2:

1.aggcacggaaaaacgggaataacggaggaggacttggcacggcattacacggagg
2.cggaggacaaacgggatggcggtattggaggtggcggactgttcgggga
3.gggacggatacggattctggccacggacggaaaggaggacacggcggacataca
4.atggataacggaaacaaaccagacaaacttcggtagaaatacagaagctta
5.cggctggcggacaacggactggcggattccaaaaacggaggaggcggacggaggc

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解:


import numpy as np
a=[]
with open('data2_2.txt') as f:for (i, s) in enumerate(f):a.append([s.count('a'), s.count('c'),s.count('g'),s.count('t')])
b=np.array(a); print(b)

 析:

这段Python代码的主要目的是从一个名为data2_2.txt的文件中读取数据,并计算每一行中字符'a'、'c'、'g'和't'出现的次数,然后将这些次数以二维数组的形式存储在NumPy数组中,并打印出来。

下面是代码的逐行解释:

  1. import numpy as np:导入NumPy库,并给它一个别名np。NumPy是Python中用于处理大型多维数组和矩阵的库,它包含了大量的数学函数来操作这些数组。
  2. a=[]:初始化一个空列表a,用来存储每一行中字符'a'、'c'、'g'和't'出现的次数。
  3. with open('data2_2.txt') as f::使用with语句打开名为data2_2.txt的文件,并将文件对象赋值给f。这样做的好处是,当代码块执行完毕后,文件会自动关闭,不需要手动调用f.close()
  4. for (i, s) in enumerate(f)::遍历文件的每一行。enumerate(f)会同时返回行的索引(i)和行的内容(s)。
  5. a.append([s.count('a'), s.count('c'), s.count('g'), s.count('t')]):对于每一行s,使用count方法计算字符'a'、'c'、'g'和't'出现的次数,并将这四个数值作为一个列表添加到a中。
  6. b=np.array(a);:将列表a转换为NumPy数组,并赋值给b
  7. print(b):打印出NumPy数组b

最终,b将是一个二维数组,每一行包含一行文本中字符'a'、'c'、'g'和't'出现的次数。

注意:这段代码假设data2_2.txt文件存在于代码运行的同一目录下,并且每一行都可以被正常读取和计数。如果文件不存在或文件内容不是文本格式,代码可能会出现错误。

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