LLM生成模型在生物单细胞single cell的应用:scGPT
参考:
https://github.com/bowang-lab/scGPT
https://www.youtube.com/watch?v=XhwYlgEeQAs
相关算法:
主要是把单细胞测序出来的基因表达量的拼接起来构建成的序列,这里不是用的基因的ATCG,是直接用的基因名称
训练数据:scGPT全人模型是在3300万个正常人类细胞的scRNA-seq单细胞测向数据上进行预训练的。
输入文本序列就是单细胞测序出来的基因表达量的拼接;模型还是GPT基本架构
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