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安装Cellpose

Cellpose是目前运用范围最广、效果最好的细胞分割模型,以下是安装方法。

3.1 安装cellpose

   3.1.1 创建cellpose

   打开Anaconda Navigator,如下图所示:

图3.1.1.1  Anaconda Navigator

依次点击 Environments、Create,在弹出的窗中,name输入cellpose, 选中python,点击Create。

图3.1.1.2  创建cellpose

3.1.2 安装cellpose

在应用中找到并打开Anaconda Prompt,如下图2.1.1所示:

图2.1.1  Anaconda Prompt

  1. 依次输入以下的命令行:

conda activate cellpose

python -m pip install cellpose[gui] -i Simple Index

如下图所示:

图2.1.2 输入命令行

  1. 运行Cellpose

输入以下的命令行

python -m cellpose

运行后,如下图所示:

图2.1.3 cellpose

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