VTK知识学习(26)- 图像基本操作(一)
1、前言
图像处理离不开一些基本的图像数据操作,例如获取和修改图像的基本信息、访问和修改图像像素值、图像显示、图像类型转换等。熟练掌握这些基本操作有助于使用 VTK进行图像处理应用程序的快速开发。
2、图像信息的访问与修改
1)利用vtkIamgeData方法
vtkImageData中提供了多个函数用于访问或者获取图像的基本信息,这些函数通常以 Set或者 Get加上相应的信息名的形式进行命名,例如获取图像维数的方法定义为 GetDimensions()。
private void TestGetImageInfo()
{vtkBMPReader reader = vtkBMPReader.New();reader.SetFileName("F:\\code\\VTK\\TestActiViz\\bin\\Debug\\data\\lena.bmp");reader.Update();int[] dims = reader.GetOutput().GetDimensions();Console.WriteLine($"图像维数:{dims[0]} {dims[1]} {dims[2]}");double[] orgin = reader.GetOutput().GetOrigin();Console.WriteLine($"图像原点:{orgin[0]} {orgin[1]} {orgin[2]}");double[] spaceing = reader.GetOutput().GetSpacing();Console.WriteLine($"像素间隔:{spaceing[0]} {spaceing[1]} {spaceing[2]}");vtkImageActor actor = vtkImageActor.New();actor.SetInputData(reader.GetOutput());vtkRenderer renderer = vtkRenderer.New();renderer.AddActor(actor);renderer.ResetCamera();renderer.SetBackground(1, 1, 1);vtkRenderWindow renderWindow = renderWindowControl.RenderWindow;renderWindow.AddRenderer(renderer);renderWindow.Render();
}
示例主要获取了图像的三个信息,即图像维数、图像原点和像素间隔。
VTK 中无论是二维图像还是三维图像,都用 vtkImageData表示,因此程序中定义图像维数为 dims[3],然后利用 GetDimensions()函数获取图像的维数;图像的原点和像素间隔都是物理空间数值,其数值类型为 double。从显示结果中可以看到,图像维数为512x512x1,其中Z方向的维数为1,说明该图像为二维图像:而图像的原点为(0,0,0)点,像素间隔为(1,1,1)。
2)利用类vtkChangeImageInformation
vtkImageData 中提供了多个 Set 函数用于设置图像的基本信息。在对一个图像 Filter的输出图像信息进行修改后,如果 Filter 重新 Update,图像信息又会恢复回原来的值。而vtkChangeImageInformation 类可以作为管线中的一个 Filter 来修改图像信息。利用这个Filter 可以修改图像的原点、像素间隔以及范围,另外还可以实现图像平移缩放等操作。
private void TestChangeImageInfo()
{vtkBMPReader reader = vtkBMPReader.New();reader.SetFileName("F:\\code\\VTK\\TestActiViz\\bin\\Debug\\data\\lena.bmp");reader.Update();int[] dims = reader.GetOutput().GetDimensions();Console.WriteLine($"原图像维数:{dims[0]} {dims[1]} {dims[2]}");double[] orgin = reader.GetOutput().GetOrigin();Console.WriteLine($"原图像原点:{orgin[0]} {orgin[1]} {orgin[2]}");double[] spaceing = reader.GetOutput().GetSpacing();Console.WriteLine($"原像素间隔:{spaceing[0]} {spaceing[1]} {spaceing[2]}");vtkImageChangeInformation changer = vtkImageChangeInformation.New();changer.SetInputData(reader.GetOutput());changer.SetOutputOrigin(100, 100, 0);changer.SetOutputSpacing(5, 5, 1);changer.SetCenterImage(1);changer.Update();dims = changer.GetOutput().GetDimensions();Console.WriteLine($"修改后图像维数:{dims[0]} {dims[1]} {dims[2]}");orgin = changer.GetOutput().GetOrigin();Console.WriteLine($"修改后图像原点:{orgin[0]} {orgin[1]} {orgin[2]}");spaceing = changer.GetOutput().GetSpacing();Console.WriteLine($"修改后像素间隔:{spaceing[0]} {spaceing[1]} {spaceing[2]}");vtkImageActor actor = vtkImageActor.New();actor.SetInputData(changer.GetOutput());vtkRenderer renderer = vtkRenderer.New();renderer.AddActor(actor);renderer.ResetCamera();renderer.SetBackground(1, 1, 1);vtkRenderWindow renderWindow = renderWindowControl.RenderWindow;renderWindow.AddRenderer(renderer);renderWindow.Render();
}
示例先读入图像,由 vtklmageData提供的函数接口获取图像的维数、图像原点和像素间隔。然后定义 vtkImageChangeInformation 对象,并设置输出图像原点为(100,100,0),输出图像像素间隔为(5,5,1),然后调用 CenterImage()函数将图像的原点置于图像的中心。
操作后的结果使得图像的原点位于(-1277.5,-1275.5,0)。
SetOutputOrigin(100,100,0)并没有起作用。查看 CenterImage()函数的注释,可以发现该函数的作用是将(0,0,0)点置于图像的中心。当Centerlmage()函数执行时会重新调用 SetOutputOrigin(),所以开始的 SetOutputOrigin()函数设置的原点将会被覆盖。
(-1277.5,-1275.5,0)是如何计算出来的呢?
根据图像的维数和像素间隔计算得到新的图像的宽度和高度为(512-1)x5,初始图像的原点位于(0,0,0),现在将图像的中心平移至原点,平移量为(-(512-1)x5/2,(512-1)x5/2,0)=(-1277.5,-1275.5,0)。
3、图像像素值的访问与修改
图像像素值的访问与修改是最常用的一种操作。VTK 中提供了两种访问图像像素值的方法第一种方法是直接访问 vtkImageData 的数据数组,这种方法最直接。前面创建图像赋值时也是采用这种方法。vtkImageData中提供了GetScalarPointer()函数获取数据数组指针,该函数有三种形式:
virtual void *GetScalarPointer(int coordinates[3]);
virtual void *GetScalarPointer(int x, int y, int z);
virtual void *GetScalarPointer();
前两种形式根据给定的像素索引得到指定的像素值,注意返回的是第(x,y,z)个像素值的地址。而第三种形式是返回图像数据数组的头指针,然后根据头指针可以依次访问索引像素。
1)数据数组
一个遍历图像像素的示例:
private void TestVisitPixel()
{vtkBMPReader reader = vtkBMPReader.New();reader.SetFileName("F:\\code\\VTK\\TestActiViz\\bin\\Debug\\data\\lena.bmp");reader.Update();//获取图像的大小int[] dims = reader.GetOutput().GetDimensions();//将图像的100*100大小的区域设置为黑色for (int k = 0; k < dims[2]; k++){for (int j = 0; j < dims[1]; j++){for (int i = 0; i < dims[0]; i++){if (i < 100 && j < 100){//VTK彩色及矢量图像的像素存储格式示意: …R G B R G B…byte[] infos = new byte[] { 0, 0, 0 };var pixel = reader.GetOutput().GetScalarPointer(i, j, k);Marshal.Copy(infos, 0, pixel, 3);}}}}vtkImageActor actor = vtkImageActor.New();actor.SetInputData(reader.GetOutput());vtkRenderer renderer = vtkRenderer.New();renderer.AddActor(actor);renderer.ResetCamera();renderer.SetBackground(1, 1, 1);vtkRenderWindow renderWindow = renderWindowControl.RenderWindow;renderWindow.AddRenderer(renderer);renderWindow.Render();
}
实现了将图像的 100x100大小的区域设置为黑色。先定义一个 reader 读取一幅 BMP 图像,通过 vtkImageData的 GetDimensionsO)函数获取图像的大小。然后建立三重循环,通过 GetScalarPointer(i,j,k)函数获取访问图像像素值。
需要注意的是,GetScalarPointer0函数返回的是 void*类型,因此需要根据图像的实际类型进行强制转换。如上面代码中将像素值数组的头指针类型转换为unsignedchar*。如果对数据类型不确定,还可以将图像数据类型强制转换为特定的数据类型,再进行遍历。
当然这个使用是指在c++中,在我们c#中你也看到是使用Marshal对指针进行复制操作了。
VTK 彩色以及矢量图像采用的是类似图 所示的像素存储格式。
因此在修改 RGB 图像以及矢量图像像素时,需要根据像素的元组的组分数目来访问。例中,需要修改每个像素的 RGB 值时,先获得第(i,i,k)个像素的地址也就是R值的地址,然后将地址加1来访问后续G值以及B值。如果对于像素的元组组分不确定,可以通过函数GetNumberOfScalarComponents()来获取,代码如下所示:
int nbOfComp = reader->GetOutput()->GetNumberOfScalarComponents();
2)迭代器方法访问图像像素
用 vtkImagelterator 类实现迭代器方法访问图像像素。该类是一个模板类使用时,需要提供迭代的图像像素类型以及迭代的区域大小。
这个是c++的方式,c#没有找到对应的实现。
void TestVisitImagePixelIteratively(){vtkSmartPointer<vtkBMPReader> reader =vtkSmartPointer<vtkBMPReader>::New();reader->SetFileName("F:\\code\\VTK\\TestActiViz\\bin\\Debug\\data\\lena.bmp");reader->Update();int numComponents = reader->GetOutput()->GetNumberOfScalarComponents();int subRegion[6] = { 0,300, 0, 300, 0, 0 };vtkImageIterator<unsigned char> it(reader->GetOutput(), subRegion);while (!it.IsAtEnd()){unsigned char* inSI = it.BeginSpan();unsigned char* inSIEnd = it.EndSpan();while (inSI!=inSIEnd){*inSI = 255 - *inSI;++inSI;}it.NextSpan();}vtkSmartPointer<vtkImageViewer2> imageViewer =vtkSmartPointer<vtkImageViewer2>::New();imageViewer->SetInputConnection(reader->GetOutputPort());vtkSmartPointer<vtkRenderWindowInteractor> renderWindowInteractor =vtkSmartPointer<vtkRenderWindowInteractor>::New();imageViewer->SetupInteractor(renderWindowInteractor);imageViewer->Render();imageViewer->GetRenderer()->ResetCamera();imageViewer->Render();imageViewer->GetRenderer()->SetBackground(1.0, 1.0, 1.0);imageViewer->SetSize(640, 480);imageViewer->GetRenderWindow()->SetWindowName("VisitImagePixelIterativelyExample");renderWindowInteractor->Start();}
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