脑影像分析软件推荐 | JuSpace

目录

1. 软件界面

2.工具包功能简介

3.软件安装注意事项

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参考文献：

Dukart J, Holiga S, Rullmann M, Lanzenberger R, Hawkins PCT, Mehta MA, Hesse S, Barthel H, Sabri O, Jech R, Eickhoff SB. JuSpace: A tool for spatial correlation analyses of magnetic resonance imaging data with nuclear imaging derived neurotransmitter maps. Hum Brain Mapp. 2021 Feb 15;42(3):555-566. doi: 10.1002/hbm.25244. Epub 2020 Oct 20.

1. 软件界面

2.工具包功能简介

JuSpace是一种允许基于 MRI 测量与核成像衍生估计的跨模态关联的工具包，它涵盖各种神经递质系统，包括多巴胺能、血清素能、去甲肾上腺素能和 GABA（γ-氨基丁酸） 神经传递。JuSpace 由一组 Matlab 功能以及涵盖各种受体系统的 PET 受体图谱组成。

1.数据选择：用户需要选择MRI数据，能够与提供的PET和SPECT图相关联

a）单一模式的数据(“files 1” only)

b）用于在不同条件间对比的数据 (“files 1” and “files 2”, i.e., patients vs. healthy controls or pre- vs. posttreatment data)

2.计算computing：

a）组之间的效应大小（计算列表 1 和列表 2 中所选文件之间每个图集区域的 Cohen's d）

b）成对差异的效应大小（计算列表 1 中文件相对于列表 2 之间的成对差异的 Cohen d）

c）列表 1 中的平均值（计算列表 1 中所有文件的每个图集区域的平均值）

d）每个图像列出 1（从列表 1 中提取每个文件的每个图集区域的平均值）

e）计算列表 1 中每个文件相对于列表 2 的单个 z score映射

f）计算列表 1 和列表 2 之间的成对差值

g）计算列表 1 中每个文件相对于列表 1 中其他文件的留一法 z score映射

h）从列表 1 中提取每个文件的每个图集区域的平均值，并将所有图像的相关系数与零分布进行比较

2.选择分析类型（Pearson 相关、Spearman 相关或多元线性回归）

3.软件安装注意事项

JuSpace是Matlab环境下运行的软件包（2017b之后的版本），使用时需要安装 SPM12。它还可以在安装了 Matlab 包和 Stats 工具箱的任何其他操作系统上使用，如 Unix 或 Linux。

1、下载并安装SPM12

2、确保已将SPM12添加到Matlab路径

3、下载最新版本的 JuSpace，将解压的文件夹添加到目录中；

4、将当前目录转到JuSpace文件夹

5、键入“JuSpace”显示用户界面