当前位置： 首页 > article >正文

【科研绘图系列】R语言绘制GO term 富集分析图（enrichment barplot）

article 2025/6/4 14:40:10

禁止商业或二改转载，仅供自学使用，侵权必究，如需截取部分内容请后台联系作者!

文章目录

    • 介绍
    • 加载R包
    • 数据下载
    • 导入数据
    • 数据预处理
    • 画图
    • code 2
    • code 3
    • 系统信息

在这里插入图片描述

介绍

本文介绍了使用R语言绘制GO富集分析条形图的方法。通过加载ggplot2等R包，对GO term数据进行预处理，包括p值转换、文本截断和排序筛选。文章提供了两个代码示例，分别针对不同数据集（dataC.xlsx和dataD.xlsx）进行分析，均采用分组（BP/CC/MF）展示前10个显著GO term。通过自定义绘图函数调整柱状图高度、坐标轴刻度和颜色方案，并使用patchwork包将三个子图合并为整体可视化结果。最终生成的图像清晰展示了不同GO类别中富集项的显著性水平，为生物信息学分析提供了直观的图形呈现。

加载R包

library(readxl)
library(stringr

相关文章：

【科研绘图系列】R语言绘制GO term 富集分析图（enrichment barplot）

禁止商业或二改转载，仅供自学使用，侵权必究，如需截取部分内容请后台联系作者! 文章目录 介绍加载R包数据下载导入数据数据预处理画图code 2code 3系统信息介绍 本文介绍了使用R语言绘制GO富集分析条形图的方法。通过加载ggplot2等R包，对GO term数据进行预处理，包括p值转换…...

编程日记 2025/6/4 14:40:10

JavaScript 性能优化实战指南

JavaScript 性能优化实战指南 一、引言 JavaScript 是一种广泛使用的编程语言，尤其在前端开发中占据重要地位。随着 Web 应用的复杂度不断增加，性能优化成为开发过程中不可或缺的一部分。性能优化不仅可以提升用户体验，还能减少服务器负载，提高应用的响应速度。本文将从多…...

编程日记 2025/6/4 9:35:46

达梦数据库：同1台服务器如何启动不同版本的DMAP服务

需求背景： 用户使用资源比较高的服务器，作为测试环境提供服务器，因为在这台服务器，运行了很多个数据库版本实例的情况，但是当dmap版本和数据库版本不一致时，通过dmap备份会报错。 解决办法： 1…...

编程日记 2025/6/4 8:30:32

Laravel单元测试使用示例

Date: 2025-05-28 17:35:46 author: lijianzhan 在 Laravel 框架中，单元测试是一种常用的测试方法，它是允许你测试应用程序中的最小可测试单元，通常是方法或函数。Laravel 提供了内置的测试工具PHPUnit，实践中进行单元测试是保障代…...

编程日记 2025/6/4 9:05:19

Kotlin委托机制使用方式和原理

目录 类委托属性委托简单的实现属性委托Kotlin标准库中提供的几个委托延迟属性LazyLazy委托参数可观察属性Observable委托vetoable委托属性储存在Map中 实践方式双击back退出Fragment/Activity传参ViewBinding和委托 类委托 类委托有点类似于Java中的代理模式 interface Base…...

编程日记 2025/6/4 16:43:48

鸿蒙OSUniApp集成WebAssembly实现高性能计算：从入门到实践#三方框架 #Uniapp

UniApp集成WebAssembly实现高性能计算：从入门到实践 引言 在移动应用开发领域，性能始终是一个永恒的话题。随着计算需求的不断增加，特别是在图像处理、数据分析等领域，如何在跨平台应用中实现高性能计算成为了一个重要课题。本文…...

编程日记 2025/6/4 16:31:05

基于 HT for Web 轻量化 3D 数字孪生数据中心解决方案

一、技术架构：HT for Web 的核心能力 图扑软件自主研发的 HT for Web 是基于 HTML5 的 2D/3D 可视化引擎，核心技术特性包括： 跨平台渲染：采用 WebGL 技术，支持 PC、移动端浏览器直接访问，兼容主流操作系统…...

编程日记 2025/6/4 8:39:54

精英-探索双群协同优化（Elite-Exploration Dual Swarm Cooperative Optimization, EEDSCO）

一种多群体智能优化算法，其核心思想是通过两个分工明确的群体——精英群和探索群——协同工作，平衡算法的全局探索与局部开发能力，从而提高收敛精度并避免早熟收敛。 一 核心概念 在传统优化算法（如粒子群优化、遗传算法&#xf…...

编程日记 2025/6/4 16:57:04

解决Ubuntu20.04上Qt串口通信 QSerialPort 打开失败的问题

运行Qt串口通信 open(QIODevice::ReadWrite) 时，总是失败。 1、打印失败原因 QString QSerialHelper::openSerail() {if(this->open(QIODevice::ReadWrite) true){return this->portName();}else{return "打开失败";//return this->errorStri…...

编程日记 2025/6/4 16:40:52

深入浅出：使用DeepSeek开发小程序的完整指南

深入浅出：使用DeepSeek开发小程序的完整指南 1. 《从零开始：DeepSeek小程序开发环境搭建》 ​​引言：​​ "工欲善其事，必先利其器"，在开始DeepSeek小程序开发之旅前，搭建一个高效的开发环境是至关重要的第一步。本文将手把手带你完成从软件安装到第一个&quo…...

编程日记 2025/6/4 15:25:38

设计模式——观察者设计模式（行为型）

摘要 本文详细介绍了观察者设计模式，包括其定义、结构、实现方式、适用场景以及实战示例。通过代码示例展示了如何在Spring框架下实现观察者模式，以及如何通过该模式实现状态变化通知。同时，对比了观察者模式与消息中间件在设计理念、耦合程…...

编程日记 2025/6/4 16:10:41

【前端】Vue中使用CKeditor作为富文本编辑器

官网https://ckeditor.com/ 此处记录一下我在使用的时候具体初始化的代码。 <template><div><textarea :id"id"></textarea></div> </template><script> export default {name: CkEditor,data: function () {return {id:…...

编程日记 2025/6/4 9:58:58

CSS篇-6

1. 如果将<html>元素的font-size设置为10rem&#xff0c;那么当用户调整或拖曳浏览器窗口时&#xff0c;其文本大小会受到影响吗&#xff1f; 不会受到影响。rem单位是相对于根元素&#xff08;即<html>元素&#xff09;的font-size计算的。一旦<html>的fon…...

编程日记 2025/6/4 9:32:22

【计算机系统结构】习题2

目录 1.有一条静态多功能流水线由5段组成&#xff0c;加法用1、2、4、5段&#xff0c;乘法用1、3、5段&#xff0c;第3段时间为&#xff0c;其余各段为&#xff0c;且流水线的输出可直接返回输入端或暂存器&#xff0c;若计算&#xff0c;试计算吞吐量、加速比、效率 2.有一动…...

编程日记 2025/6/4 0:47:51

用户资产化视角下开源AI智能名片链动2+1模式S2B2C商城小程序的应用研究

摘要&#xff1a;在数字化时代&#xff0c;平台流量用户尚未完全转化为企业的数字资产&#xff0c;唯有将其沉淀至私域流量池并实现可控、随时触达&#xff0c;方能成为企业重要的数字资产。本文从用户资产化视角出发&#xff0c;探讨开源AI智能名片链动21模式S2B2C商城小程序在…...

编程日记 2025/6/4 10:58:15

day023-面试题总结

文章目录 1. 运维基础面试题1.1 物理机没有正常启动&#xff0c;进入紧急模式&#xff0c;你的排查思路是什么1.2 系统优化什么1.3 印象比较深刻的故障1.4 在现场环境网络方面有遇到什么问题吗1.5 kylin操作系统部署服务遇到过哪些问题&#xff1f;1.6 单独做项目一般几台服务器…...

编程日记 2025/6/4 10:39:47

机器学习实验七--SVM垃圾邮件分类器

SVM垃圾邮件分类器 一、什么是SVM二、实例&#xff1a;垃圾邮件分类器1.实验要求2.原理解释2.1 数据预处理流程2.2 特征提取方法2.3 SVM分类器 3.代码实现4.实验结果5.实验总结 一、什么是SVM 支持向量机(Support Vector Machine, SVM)是一种监督学习算法&#xff0c;主要用于…...

编程日记 2025/6/4 15:57:15

C++23 std::fstreams基础回顾

文章目录 引言1.1 std::fstreams概述1.2 std::fstreams的主要功能和常用操作 2. 独占模式 (P2467R1) 的详细介绍2.1 独占模式的定义和背景2.2 独占模式的作用和优势 3. C23 std::fstreams支持独占模式 (P2467R1) 的具体实现方式3.1 代码示例3.2 实现步骤解释 4. 使用该特性可能…...

编程日记 2025/6/4 15:56:27

Git初识Git安装

目录 1. Git初识 1.1 提出问题 1.2 如何解决--版本控制器 1.3 注意事项 2 Git安装 2.1 Centos 2.2 Ubuntu 2.3 Windows 1. Git初识 1.1 提出问题 不知道你工作或学习时&#xff0c;有没有遇到这样的情况&#xff1a;我们在编写各种文档时&#xff0c;为了防止文档丢失…...

编程日记 2025/6/4 11:57:11

使用Redisson实现分布式锁发现的【订阅超时】Subscribe timeout: (7500ms)

背景 使用 redisson 实现分布式锁&#xff0c;出现的异常&#xff1a; org.redisson.client.RedisTimeoutException: Subscribe timeout: (7500ms). Increase ‘subscriptionsPerConnection’ and/or ‘subscriptionConnectionPoolSize’ parameters 从异常信息读的出来一些东…...

编程日记 2025/6/4 15:15:11

数据分析的方法总结

数据分析的方法总结 一.通用性方法总结 16种常用的数据分析方法汇总-CSDN博客 人人都应该掌握的9种数据分析方法_五 九种数据类型-CSDN博客 9种最常用数据分析方法&#xff0c;解决90%分析难题_数据分析经典算法与案例-CSDN博客 二.行业特殊性方法总结 数据分析20大基本分…...

编程日记 2025/6/4 15:45:22

如何使用 poetry 创建虚拟环境，VSCode 如何激活使用 Poetry 虚拟环境（VSCode如何配置 Poetry 虚拟环境）

文章目录 📖 介绍 📖🏡 演示环境 🏡📒 使用 Poetry 创建和激活虚拟环境 📒🧪 创建项目并初始化 Poetry🔧 配置虚拟环境创建位置✅ 指定Python版本📦 安装依赖并创建虚拟环境🚀 激活虚拟环境📒 在 VSCode 中配置 Poetry 虚拟环境 📒🧭 方法一：使用 V…...

编程日记 2025/6/4 15:46:59

每天掌握一个Linux命令 - ps

Linux 命令工具 ps 与 pstree 详解 一、ps 工具概述 ps&#xff08;Process Status&#xff09;是 Linux 系统中用于查看当前进程状态的核心工具&#xff0c;可显示进程的 PID、用户、CPU 占用率、内存使用量、启动时间、命令行参数等信息。 应用场景&#xff1a;监控系统性…...

编程日记 2025/6/4 16:34:52

牛客小白月赛117

前言&#xff1a;solveABCF相对简单&#xff0c;D题思路简单但是实现麻烦&#xff0c;F题郭老师神力b(&#xffe3;▽&#xffe3;)。 A. 好字符串 题目大意&#xff1a;给定字符串s&#xff0c;里面的字母必须大小写同时出现。 【解题】&#xff1a;没什么好说的&#xff0…...

编程日记 2025/6/4 16:09:50

浅谈 Linux 文件覆盖机制

引言&#xff1a;文件覆盖的本质 文件覆盖是 Linux 文件系统中常见的操作&#xff0c;指将源文件内容写入目标路径&#xff0c;导致目标文件原有内容被替换或新文件被创建。覆盖操作通常通过命令行工具&#xff08;如 mv、cp&#xff09;或系统调用&#xff08;如 open() 以写…...

编程日记 2025/6/4 16:12:10

美化显示GDB调试的数据结构

笔者在前面的博文记一次pdf转Word的技术经历中有使用到mupdf库&#xff0c;该库是使用C语言写的一个操作PDF文件的库&#xff0c;同时提供了Python接口&#xff0c;Java接口和JavaScript接口。 在使用该库时&#xff0c;如果想要更高的性能&#xff0c;使用C语言接口是不二的选…...

编程日记 2025/6/4 8:36:27

一篇学习CSS的笔记

一、简介 Cascading Style Sheets简称CSS&#xff0c;中文翻译为层叠样式表。当HTML被发明出来初期&#xff0c;不同的浏览器提供了各种各样的样式语言给用户控制网页的效果&#xff0c;HTML包含的显示属性并不是很多。但是随着各种使用者对HTML的需求&#xff0c;HTML添加了大…...

编程日记 2025/6/4 9:21:42

Rust 学习笔记：自定义构建和发布配置

Rust 学习笔记&#xff1a;自定义构建和发布配置 Rust 学习笔记&#xff1a;自定义构建和发布配置发布配置文件自定义 profile 的选项 Rust 学习笔记&#xff1a;自定义构建和发布配置 发布配置文件 在 Rust 中&#xff0c;发布配置文件是预定义的和可定制的概要文件&#xf…...

编程日记 2025/6/4 10:28:06

StarRocks x Iceberg：云原生湖仓分析技术揭秘与最佳实践

导读&#xff1a; 本文将深入探讨基于 StarRocks 和 Iceberg 构建的云原生湖仓分析技术&#xff0c;详细解析两者结合如何实现高效的查询性能优化。内容涵盖 StarRocks Lakehouse 架构、与 Iceberg 的性能协同、最佳实践应用以及未来的发展规划&#xff0c;为您提供全面的技术解…...

编程日记 2025/6/4 0:50:39

笔试笔记（运维）

&#xff08;数据库&#xff0c;SQL&#xff09; limit1 随机返回其中一个聚合函数不可以嵌套使用 【^】这个里面的数据任何形式组合都没有 sql常用语句顺序&#xff1a;from-->where-->group by-->having-->select-->order by-->limit 只要其中一个表存在匹…...

编程日记 2025/6/4 9:18:42