当前位置: 首页 > news >正文

pyscenic分析:视频教程

我们之前更新过pyscenic的教程:pySCENIC单细胞转录因子分析更新:数据库、软件更新。我们也说过,我们号是放弃R语言版的SCENIC的分析了,因为它比较耗费计算资源和时间,所以我们的单细胞转录因子分析教程都是基于pyscenic的分析进行的。有很多小伙伴反应,自己在实际操作过程中,总是报错,我猜测大多数是软件的问题。有些说想知道整个运行过程是怎么样的,所以我们出了这个视频教程,演示整个pyscenic的流程。当然,我们还介绍了docker镜像pyscenic分析。

单细胞转录因子的分析是需要利用服务器的:KS推荐:生信分析服务器。我们的这个视频从数据准备、软件安装、步骤分析、镜像分析等等方面,展示了pyscenic分析的过程,最终得到分析结果。

不知道什么原因,视频这里上传不成功,所以可从B站链接观看:

https://www.bilibili.com/video/BV1Yj411r7dE/?spm_id_from=333.999.0.0&vd_source=05b5479545ba945a8f5d7b2e7160ea34

图片

得到分析结果之后,那么后续的内容也就好办了,我们也写了很多的R语言版的分析和可视化,以及python版本的分析可视化。

PySCENIC(二):pyscenic单细胞转录组转录因子分析

PySCENIC(三):pyscenic单细胞转录因子分析可视化

PySCENIC(四):pyscenic结果之差异转录因子分析及其他可视化

pySCENIC单细胞转录因子分析更新:数据库、软件更新

pySCENIC单细胞转录因子分析更新(2):python版分析及可视化

pySCENIC可视化分析更新(3):python版可视化修改

视频制作不易,觉得分享有用的点个赞再走呗!

相关文章:

pyscenic分析:视频教程

我们之前更新过pyscenic的教程:pySCENIC单细胞转录因子分析更新:数据库、软件更新。我们也说过,我们号是放弃R语言版的SCENIC的分析了,因为它比较耗费计算资源和时间,所以我们的单细胞转录因子分析教程都是基于pysceni…...

可视化绘图技巧100篇进阶篇(九)-三维百分比堆积条形图(3D Stacked Percentage Bar Chart)

目录 前言 适用场景 绘图工具及代码实现 帆软 实现思路 方案一:使用计算指标 上传数据 添加组件 生成图表 添加计算字段 生成分区柱形图 生成百分比堆积条形图 美化图表 设置标签 设置颜色 效果查看 PC 端 移动端 方案二:使用自助数…...

js实现将文本转PDF格式并下载到本地

html里面需要引入jspdf.umd.min.js和FileSaver.js jspdf.umd.min.js:https://www.npmjs.com/package/jspdf FileSaver.js:https://download.csdn.net/download/weixin_45791806/87272893?spm1001.2014.3001.5503 同时项目的根部目录也需要引入SimHei.tt…...

Servlet+JDBC实战开发书店项目讲解第四篇:登录实现

ServletJDBC 实战开发书店项目讲解第四篇:登录注册实现 在本篇博客中,我们将继续讲解 ServletJDBC 实战开发书店项目。这次我们将重点讲解如何实现登录和注册功能。 1. 创建数据库表 首先,我们需要在数据库中创建两个表,一个用…...

HarmonyOS NEXT新能力,一站式高效开发HarmonyOS应用

2023年8月6日华为开发者大会2023(HDC.Together)圆满收官,伴随着HarmonyOS 4的发布,华为向开发者发布了汇聚所有最新开发能力的HarmonyOS NEXT开发者预览版,并分享了围绕“一次开发,多端部署” “可分可合&a…...

【Java从0到1学习】09 正则表达式

1. 正则表达式概述 在编写处理字符串的程序或网页时,经常会有查找符合某些复杂规则的字符串的需要。正则表达式就是用于描述这些规则的工具。换句话说,正则表达式就是记录文本规则的代码。 正则表达式,又称正规表示法、常规表示法&#xff…...

log4j:WARN No appenders could be found for logger问题

本文将idea场景下的使用。 IDEA中,将配置文件命名为log4j.properties(该命名才会被自动加载), 并放到某个目录下(通常放到resources目录),并在resources上右键,找到Mark Directory a…...

【Java】批量生成条形码-itextpdf

批量生成条形码 Controller ApiOperation("商品一览批量生成商品条形码")PostMapping("/batchGenerateProdBarCode")public void batchGenerateProdBarCode(RequestBody ProductListCondition productListCondition,HttpServletResponse response){import…...

SpringBoot登录、退出、获取用户信息的session处理

1、登录方法&#xff1a;login PostMapping("/user/login")public ResponseVo<User> login(Valid RequestBody UserLoginForm userLoginForm,HttpSession session) {ResponseVo<User> userResponseVo userService.login(userLoginForm.getUsername(), …...

【软件测试】随笔系统测试报告

博主简介&#xff1a;想进大厂的打工人博主主页&#xff1a;xyk:所属专栏: 软件测试 随笔系统采用 SSM 框架前后端分离的方法实现&#xff0c;本文主要针对功能&#xff1a;登录&#xff0c;注册&#xff0c;注销&#xff0c;写随笔&#xff0c;删除随笔&#xff0c;随笔详情页…...

vue中使用html2canvas+jsPDF实现pdf的导出

导入依赖 html2canvas依赖 npm install html2canvasjspdf依赖 npm install jspdfpdf导出 以导出横向&#xff0c;A4大小的pdf为例 规律&#xff1a;1. html2canvas 中&#xff0c;在保持jsPDF中的宽高不变的情况下&#xff0c;设置html2canvas中的 width 和 height 值越小&a…...

Linux学习之firewallD

systemctl status firewalld.service查看一下firewalld服务的状态&#xff0c;发现状态是inactive (dead)。 systemctl start firewalld.service启动firewalld&#xff0c;systemctl status firewalld.service查看一下firewalld服务的状态&#xff0c;发现状态是active (runni…...

【JS学习】Object.assign 用法介绍

Object.assign 是ES6中的一个方法。该方法能够实现对象的浅复制以及对象合并。Object.assign 并不会修改目标对象本身&#xff0c;而是返回一个新的对象&#xff0c;其中包含了所有源对象的属性。 例1 2个对象合并 const target { a: 1, b: 2 }; const source { b: 3, c: 4…...

【uni-app报错】获取用户收货地址uni.chooseAddress()报错问题

chooseAddress:fail the api need to be declared in …e requiredPrivateInf 原因&#xff1a; 小程序配置 / 全局配置 (qq.com) 解决&#xff1a; 登录小程序后台申请接口 按照流程申请即可 在项目根目录中找到 manifest.json 文件&#xff0c;在左侧导航栏选择源码视图&a…...

机器学习、cv、nlp的一些前置知识

为节省篇幅&#xff0c;不标注文章来源和文章的问题场景。大部分是我的通俗理解。 文章目录 向量关于向量的偏导数&#xff1a;雅可比矩阵二阶导数矩阵&#xff1a;海森矩阵随机变量随机场伽马函数beta分布数学术语坐标上升法协方差训练集&#xff0c;验证集&#xff0c;测试集…...

Steam 灵感的游戏卡悬停效果

先看效果&#xff1a; 再看代码&#xff08;查看更多&#xff09;&#xff1a; <!DOCTYPE html> <html lang"en"> <head><meta charset"UTF-8"><title>Steam 灵感的游戏卡悬停效果</title><style>* {margin: …...

[Openwrt]一步一步搭建MT7981A uboot、atf、openwrt-21.02开发环境操作说明

安装ubuntu-18.04 软件安装包 ubuntu-18.04-desktop-amd64.iso 修改ubuntu管理员密码 sudo passwd [sudo] password for w1804: Enter new UNIX password: Retype new UNIX password: passwd: password updated successfully 更新ubuntu源 备份源 sudo cp /etc/apt/so…...

Unity C# 之 Azure 微软SSML语音合成TTS流式获取音频数据以及表情嘴型 Animation 的简单整理

Unity C# 之 Azure 微软SSML语音合成TTS流式获取音频数据以及表情嘴型 Animation 的简单整理 目录 Unity C# 之 Azure 微软SSML语音合成TTS流式获取音频数据以及表情嘴型 Animation 的简单整理 一、简单介绍 二、实现原理 三、注意事项 四、实现步骤 五、关键代码 一、简…...

安全学习DAY16_信息打点-CDN绕过

信息打点-CDN绕过 文章目录 信息打点-CDN绕过本节思维导图相关链接&工具站&项目工具前置知识&#xff1a;CDN配置&#xff1a;配置1&#xff1a;加速域名-需要启用加速的域名配置2&#xff1a;加速区域-需要启用加速的地区配置3&#xff1a;加速类型-需要启用加速的资源…...

genism word2vec方法

文章目录 概述使用示例模型的保存与使用训练参数详解&#xff08;[原链接](https://blog.csdn.net/weixin_44852067/article/details/130221655)&#xff09;语料库训练 概述 word2vec是按句子来处理的Sentences(句子们) 使用示例 from gensim.models import Word2Vec #sent…...

多云管理“拦路虎”:深入解析网络互联、身份同步与成本可视化的技术复杂度​

一、引言&#xff1a;多云环境的技术复杂性本质​​ 企业采用多云策略已从技术选型升维至生存刚需。当业务系统分散部署在多个云平台时&#xff0c;​​基础设施的技术债呈现指数级积累​​。网络连接、身份认证、成本管理这三大核心挑战相互嵌套&#xff1a;跨云网络构建数据…...

Ubuntu系统下交叉编译openssl

一、参考资料 OpenSSL&&libcurl库的交叉编译 - hesetone - 博客园 二、准备工作 1. 编译环境 宿主机&#xff1a;Ubuntu 20.04.6 LTSHost&#xff1a;ARM32位交叉编译器&#xff1a;arm-linux-gnueabihf-gcc-11.1.0 2. 设置交叉编译工具链 在交叉编译之前&#x…...

设计模式和设计原则回顾

设计模式和设计原则回顾 23种设计模式是设计原则的完美体现,设计原则设计原则是设计模式的理论基石, 设计模式 在经典的设计模式分类中(如《设计模式:可复用面向对象软件的基础》一书中),总共有23种设计模式,分为三大类: 一、创建型模式(5种) 1. 单例模式(Sing…...

golang循环变量捕获问题​​

在 Go 语言中&#xff0c;当在循环中启动协程&#xff08;goroutine&#xff09;时&#xff0c;如果在协程闭包中直接引用循环变量&#xff0c;可能会遇到一个常见的陷阱 - ​​循环变量捕获问题​​。让我详细解释一下&#xff1a; 问题背景 看这个代码片段&#xff1a; fo…...

React hook之useRef

React useRef 详解 useRef 是 React 提供的一个 Hook&#xff0c;用于在函数组件中创建可变的引用对象。它在 React 开发中有多种重要用途&#xff0c;下面我将全面详细地介绍它的特性和用法。 基本概念 1. 创建 ref const refContainer useRef(initialValue);initialValu…...

postgresql|数据库|只读用户的创建和删除(备忘)

CREATE USER read_only WITH PASSWORD 密码 -- 连接到xxx数据库 \c xxx -- 授予对xxx数据库的只读权限 GRANT CONNECT ON DATABASE xxx TO read_only; GRANT USAGE ON SCHEMA public TO read_only; GRANT SELECT ON ALL TABLES IN SCHEMA public TO read_only; GRANT EXECUTE O…...

生成 Git SSH 证书

&#x1f511; 1. ​​生成 SSH 密钥对​​ 在终端&#xff08;Windows 使用 Git Bash&#xff0c;Mac/Linux 使用 Terminal&#xff09;执行命令&#xff1a; ssh-keygen -t rsa -b 4096 -C "your_emailexample.com" ​​参数说明​​&#xff1a; -t rsa&#x…...

MySQL用户和授权

开放MySQL白名单 可以通过iptables-save命令确认对应客户端ip是否可以访问MySQL服务&#xff1a; test: # iptables-save | grep 3306 -A mp_srv_whitelist -s 172.16.14.102/32 -p tcp -m tcp --dport 3306 -j ACCEPT -A mp_srv_whitelist -s 172.16.4.16/32 -p tcp -m tcp -…...

DeepSeek 技术赋能无人农场协同作业:用 AI 重构农田管理 “神经网”

目录 一、引言二、DeepSeek 技术大揭秘2.1 核心架构解析2.2 关键技术剖析 三、智能农业无人农场协同作业现状3.1 发展现状概述3.2 协同作业模式介绍 四、DeepSeek 的 “农场奇妙游”4.1 数据处理与分析4.2 作物生长监测与预测4.3 病虫害防治4.4 农机协同作业调度 五、实际案例大…...

dify打造数据可视化图表

一、概述 在日常工作和学习中&#xff0c;我们经常需要和数据打交道。无论是分析报告、项目展示&#xff0c;还是简单的数据洞察&#xff0c;一个清晰直观的图表&#xff0c;往往能胜过千言万语。 一款能让数据可视化变得超级简单的 MCP Server&#xff0c;由蚂蚁集团 AntV 团队…...