当前位置： 首页 > news >正文

pyscenic分析：视频教程

news 文章来源：https://blog.csdn.net/qq_42090739/article/details/132217571 2025/5/24 2:22:20

我们之前更新过pyscenic的教程：pySCENIC单细胞转录因子分析更新：数据库、软件更新。我们也说过，我们号是放弃R语言版的SCENIC的分析了，因为它比较耗费计算资源和时间，所以我们的单细胞转录因子分析教程都是基于pyscenic的分析进行的。有很多小伙伴反应，自己在实际操作过程中，总是报错，我猜测大多数是软件的问题。有些说想知道整个运行过程是怎么样的，所以我们出了这个视频教程，演示整个pyscenic的流程。当然，我们还介绍了docker镜像pyscenic分析。

单细胞转录因子的分析是需要利用服务器的：KS推荐：生信分析服务器。我们的这个视频从数据准备、软件安装、步骤分析、镜像分析等等方面，展示了pyscenic分析的过程，最终得到分析结果。

不知道什么原因，视频这里上传不成功，所以可从B站链接观看：

https://www.bilibili.com/video/BV1Yj411r7dE/?spm_id_from=333.999.0.0&vd_source=05b5479545ba945a8f5d7b2e7160ea34

图片

得到分析结果之后，那么后续的内容也就好办了，我们也写了很多的R语言版的分析和可视化，以及python版本的分析可视化。

PySCENIC（二）：pyscenic单细胞转录组转录因子分析

PySCENIC（三）：pyscenic单细胞转录因子分析可视化

PySCENIC（四）：pyscenic结果之差异转录因子分析及其他可视化

pySCENIC单细胞转录因子分析更新：数据库、软件更新

pySCENIC单细胞转录因子分析更新(2)：python版分析及可视化

pySCENIC可视化分析更新(3)：python版可视化修改

视频制作不易，觉得分享有用的点个赞再走呗！

相关文章：

pyscenic分析：视频教程

我们之前更新过pyscenic的教程：pySCENIC单细胞转录因子分析更新：数据库、软件更新。我们也说过，我们号是放弃R语言版的SCENIC的分析了，因为它比较耗费计算资源和时间，所以我们的单细胞转录因子分析教程都是基于pysceni…...

编程日记 2023/8/17 5:50:45

可视化绘图技巧100篇进阶篇（九）-三维百分比堆积条形图（3D Stacked Percentage Bar Chart）

目录 前言 适用场景 绘图工具及代码实现 帆软 实现思路 方案一：使用计算指标 上传数据 添加组件 生成图表 添加计算字段 生成分区柱形图 生成百分比堆积条形图 美化图表 设置标签 设置颜色 效果查看 PC 端 移动端 方案二：使用自助数…...

编程日记 2023/8/17 5:49:44

js实现将文本转PDF格式并下载到本地

html里面需要引入jspdf.umd.min.js和FileSaver.js jspdf.umd.min.js：https://www.npmjs.com/package/jspdf FileSaver.js：https://download.csdn.net/download/weixin_45791806/87272893?spm1001.2014.3001.5503 同时项目的根部目录也需要引入SimHei.tt…...

编程日记 2023/8/17 5:48:42

Servlet+JDBC实战开发书店项目讲解第四篇：登录实现

ServletJDBC 实战开发书店项目讲解第四篇：登录注册实现 在本篇博客中，我们将继续讲解 ServletJDBC 实战开发书店项目。这次我们将重点讲解如何实现登录和注册功能。 1. 创建数据库表 首先，我们需要在数据库中创建两个表，一个用…...

编程日记 2023/8/17 5:47:41

HarmonyOS NEXT新能力，一站式高效开发HarmonyOS应用

2023年8月6日华为开发者大会2023（HDC.Together）圆满收官，伴随着HarmonyOS 4的发布，华为向开发者发布了汇聚所有最新开发能力的HarmonyOS NEXT开发者预览版，并分享了围绕“一次开发，多端部署” “可分可合&a…...

编程日记 2023/8/17 5:46:39

【Java从0到1学习】09 正则表达式

1. 正则表达式概述 在编写处理字符串的程序或网页时，经常会有查找符合某些复杂规则的字符串的需要。正则表达式就是用于描述这些规则的工具。换句话说，正则表达式就是记录文本规则的代码。 正则表达式，又称正规表示法、常规表示法&#xff…...

编程日记 2023/8/17 5:45:38

log4j:WARN No appenders could be found for logger问题

本文将idea场景下的使用。 IDEA中，将配置文件命名为log4j.properties（该命名才会被自动加载）， 并放到某个目录下（通常放到resources目录），并在resources上右键，找到Mark Directory a…...

编程日记 2023/8/17 5:44:37

【Java】批量生成条形码-itextpdf

批量生成条形码 Controller ApiOperation("商品一览批量生成商品条形码")PostMapping("/batchGenerateProdBarCode")public void batchGenerateProdBarCode(RequestBody ProductListCondition productListCondition,HttpServletResponse response){import…...

编程日记 2023/8/17 5:43:33

SpringBoot登录、退出、获取用户信息的session处理

1、登录方法&#xff1a;login PostMapping("/user/login")public ResponseVo<User> login(Valid RequestBody UserLoginForm userLoginForm,HttpSession session) {ResponseVo<User> userResponseVo userService.login(userLoginForm.getUsername(), …...

编程日记 2023/8/17 5:42:32

【软件测试】随笔系统测试报告

博主简介&#xff1a;想进大厂的打工人博主主页&#xff1a;xyk:所属专栏: 软件测试 随笔系统采用 SSM 框架前后端分离的方法实现&#xff0c;本文主要针对功能&#xff1a;登录&#xff0c;注册&#xff0c;注销&#xff0c;写随笔&#xff0c;删除随笔&#xff0c;随笔详情页…...

编程日记 2023/8/17 5:41:31

vue中使用html2canvas+jsPDF实现pdf的导出

导入依赖 html2canvas依赖 npm install html2canvasjspdf依赖 npm install jspdfpdf导出 以导出横向&#xff0c;A4大小的pdf为例 规律&#xff1a;1. html2canvas 中&#xff0c;在保持jsPDF中的宽高不变的情况下&#xff0c;设置html2canvas中的 width 和 height 值越小&a…...

编程日记 2023/8/17 5:40:29

Linux学习之firewallD

systemctl status firewalld.service查看一下firewalld服务的状态&#xff0c;发现状态是inactive (dead)。 systemctl start firewalld.service启动firewalld&#xff0c;systemctl status firewalld.service查看一下firewalld服务的状态&#xff0c;发现状态是active (runni…...

编程日记 2023/8/17 5:39:28

【JS学习】Object.assign 用法介绍

Object.assign 是ES6中的一个方法。该方法能够实现对象的浅复制以及对象合并。Object.assign 并不会修改目标对象本身&#xff0c;而是返回一个新的对象&#xff0c;其中包含了所有源对象的属性。 例1 2个对象合并 const target { a: 1, b: 2 }; const source { b: 3, c: 4…...

编程日记 2023/8/17 5:38:25

【uni-app报错】获取用户收货地址uni.chooseAddress()报错问题

chooseAddress:fail the api need to be declared in …e requiredPrivateInf 原因&#xff1a; 小程序配置 / 全局配置 (qq.com) 解决&#xff1a; 登录小程序后台申请接口 按照流程申请即可 在项目根目录中找到 manifest.json 文件&#xff0c;在左侧导航栏选择源码视图&a…...

编程日记 2023/8/17 5:37:24

机器学习、cv、nlp的一些前置知识

为节省篇幅&#xff0c;不标注文章来源和文章的问题场景。大部分是我的通俗理解。 文章目录 向量关于向量的偏导数&#xff1a;雅可比矩阵二阶导数矩阵&#xff1a;海森矩阵随机变量随机场伽马函数beta分布数学术语坐标上升法协方差训练集&#xff0c;验证集&#xff0c;测试集…...

编程日记 2023/8/17 5:36:20

Steam 灵感的游戏卡悬停效果

先看效果&#xff1a; 再看代码&#xff08;查看更多&#xff09;&#xff1a; <!DOCTYPE html> <html lang"en"> <head><meta charset"UTF-8"><title>Steam 灵感的游戏卡悬停效果</title><style>* {margin: …...

编程日记 2023/8/17 5:35:19

[Openwrt]一步一步搭建MT7981A uboot、atf、openwrt-21.02开发环境操作说明

安装ubuntu-18.04 软件安装包 ubuntu-18.04-desktop-amd64.iso 修改ubuntu管理员密码 sudo passwd [sudo] password for w1804: Enter new UNIX password: Retype new UNIX password: passwd: password updated successfully 更新ubuntu源 备份源 sudo cp /etc/apt/so…...

编程日记 2023/8/17 5:34:18

Unity C# 之 Azure 微软SSML语音合成TTS流式获取音频数据以及表情嘴型 Animation 的简单整理

Unity C# 之 Azure 微软SSML语音合成TTS流式获取音频数据以及表情嘴型 Animation 的简单整理 目录 Unity C# 之 Azure 微软SSML语音合成TTS流式获取音频数据以及表情嘴型 Animation 的简单整理 一、简单介绍 二、实现原理 三、注意事项 四、实现步骤 五、关键代码 一、简…...

编程日记 2023/8/17 5:33:16

安全学习DAY16_信息打点-CDN绕过

信息打点-CDN绕过 文章目录 信息打点-CDN绕过本节思维导图相关链接&工具站&项目工具前置知识&#xff1a;CDN配置&#xff1a;配置1&#xff1a;加速域名-需要启用加速的域名配置2&#xff1a;加速区域-需要启用加速的地区配置3&#xff1a;加速类型-需要启用加速的资源…...

编程日记 2023/8/17 5:32:15

genism word2vec方法

文章目录 概述使用示例模型的保存与使用训练参数详解&#xff08;[原链接](https://blog.csdn.net/weixin_44852067/article/details/130221655)&#xff09;语料库训练 概述 word2vec是按句子来处理的Sentences(句子们) 使用示例 from gensim.models import Word2Vec #sent…...

编程日记 2023/8/17 5:31:14

vue3自定义样式-路由-axios拦截器

基于vue,vite和elementPlus 基于elementPlus自定义样式 history模式的路由 在根目录配置jsconfig.json&#xff0c;添加json的配置项。输入自动联想到src目录&#xff0c;是根路径的别名拦截器 如果存在多个接口地址&#xff0c;可以配置多个axios实例 数据持久化之后&#x…...

编程日记 2023/8/17 5:30:13

【mysql】事务的四种特性的理解

&#x1f307;个人主页&#xff1a;平凡的小苏 &#x1f4da;学习格言&#xff1a;命运给你一个低的起点&#xff0c;是想看你精彩的翻盘&#xff0c;而不是让你自甘堕落&#xff0c;脚下的路虽然难走&#xff0c;但我还能走&#xff0c;比起向阳而生&#xff0c;我更想尝试逆风…...

编程日记 2023/8/17 5:29:12

C++中List的实现

前言 数据结构中&#xff0c;我们了解到了链表&#xff0c;但是我们使用时需要自己去实现链表才能用&#xff0c;但是C出现了list将这一切皆变为现。list可以看作是一个带头双向循环的链表结构&#xff0c;并且可以在任意的正确范围内进行增删查改数据的容器。list容器一样也是…...

编程日记 2023/8/17 5:28:10

ElementUI 树形表格的使用以及表单嵌套树形表格的校验问题等汇总

目录 一、树形表格如何添加序号体现层级关系 二、树形表格展开收缩图标位置放置&#xff0c;设置指定列 三、表单嵌套树形表格的校验问题以及如何给校验rules传参 普通表格绑定如下&#xff1a;这种方法只能校验表格的第一层&#xff0c;树形需要递归设置子级节点prop。 树…...

编程日记 2023/8/17 5:27:09

解决“Unable to start embedded Tomcat“错误的完整指南

系列文章目录 文章目录 系列文章目录前言一、查看错误信息二、确认端口是否被占用三、检查依赖版本兼容性四、清理临时文件夹五、检查应用程序配置六、检查依赖冲突七、查看异常堆栈信息八、升级或降级Spring Boot版本总结前言 在使用Spring Boot开发应用程序时，有时可能会遇…...

编程日记 2023/8/17 5:26:07

JVS开源基础框架：平台基本信息介绍

JVS是面向软件开发团队可以快速实现应用的基础开发脚手架&#xff0c;主要定位于企业信息化通用底座&#xff0c;采用微服务分布式框架&#xff0c;提供丰富的基础功能&#xff0c;集成众多业务引擎&#xff0c;它灵活性强&#xff0c;界面化配置对开发者友好&#xff0c;底层容…...

编程日记 2023/8/17 5:25:06

C++ - max_element

在C中&#xff0c;要找到一个数组中的最大元素&#xff0c;可以使用 std::max_element 函数。以下是使用步骤&#xff1a; 包含 <algorithm> 头文件&#xff0c;这里定义了 std::max_element 函数。声明一个数组&#xff0c;并初始化它。使用 std::max_element 函数来查找…...

编程日记 2023/8/17 5:24:05

聚隆转债上市价格预测

聚隆转债 基本信息 转债名称&#xff1a;聚隆转债&#xff0c;评级&#xff1a;A&#xff0c;发行规模&#xff1a;2.185亿元。 正股名称&#xff1a;南京聚隆&#xff0c;今日收盘价&#xff1a;16.64元&#xff0c;转股价格&#xff1a;18.27元。 当前转股价值 转债面值 / 转…...

编程日记 2023/8/17 5:23:04

pytest自动生成测试类 demo

一、 pytest自动生成测试类 demo # -*- coding:utf-8 -*- # Author: 喵酱 # time: 2023 - 08 -15 # File: test4.py # desc: import pytest import unittest# 动态生成测试类def create_test_class(class_name:str, test_cases:list) -> type:"""生成测试类…...

编程日记 2023/8/17 5:22:03

服务器卡顿了该如何处理

服务器卡顿了该如何处理 当Windows系统的服务器出现卡顿问题时&#xff0c;以下是一些常见的故障排除步骤&#xff1a; 1.检查网络连接&#xff1a;确保服务器的网络连接正常。检查网络设备、交换机、防火墙等设备&#xff0c;确保它们正常运行。尝试通过其他计算机访问服务器…...

编程日记 2023/8/17 5:21:01