当前位置: 首页 > news >正文

pyscenic分析:视频教程

我们之前更新过pyscenic的教程:pySCENIC单细胞转录因子分析更新:数据库、软件更新。我们也说过,我们号是放弃R语言版的SCENIC的分析了,因为它比较耗费计算资源和时间,所以我们的单细胞转录因子分析教程都是基于pyscenic的分析进行的。有很多小伙伴反应,自己在实际操作过程中,总是报错,我猜测大多数是软件的问题。有些说想知道整个运行过程是怎么样的,所以我们出了这个视频教程,演示整个pyscenic的流程。当然,我们还介绍了docker镜像pyscenic分析。

单细胞转录因子的分析是需要利用服务器的:KS推荐:生信分析服务器。我们的这个视频从数据准备、软件安装、步骤分析、镜像分析等等方面,展示了pyscenic分析的过程,最终得到分析结果。

不知道什么原因,视频这里上传不成功,所以可从B站链接观看:

https://www.bilibili.com/video/BV1Yj411r7dE/?spm_id_from=333.999.0.0&vd_source=05b5479545ba945a8f5d7b2e7160ea34

图片

得到分析结果之后,那么后续的内容也就好办了,我们也写了很多的R语言版的分析和可视化,以及python版本的分析可视化。

PySCENIC(二):pyscenic单细胞转录组转录因子分析

PySCENIC(三):pyscenic单细胞转录因子分析可视化

PySCENIC(四):pyscenic结果之差异转录因子分析及其他可视化

pySCENIC单细胞转录因子分析更新:数据库、软件更新

pySCENIC单细胞转录因子分析更新(2):python版分析及可视化

pySCENIC可视化分析更新(3):python版可视化修改

视频制作不易,觉得分享有用的点个赞再走呗!

相关文章:

pyscenic分析:视频教程

我们之前更新过pyscenic的教程:pySCENIC单细胞转录因子分析更新:数据库、软件更新。我们也说过,我们号是放弃R语言版的SCENIC的分析了,因为它比较耗费计算资源和时间,所以我们的单细胞转录因子分析教程都是基于pysceni…...

可视化绘图技巧100篇进阶篇(九)-三维百分比堆积条形图(3D Stacked Percentage Bar Chart)

目录 前言 适用场景 绘图工具及代码实现 帆软 实现思路 方案一:使用计算指标 上传数据 添加组件 生成图表 添加计算字段 生成分区柱形图 生成百分比堆积条形图 美化图表 设置标签 设置颜色 效果查看 PC 端 移动端 方案二:使用自助数…...

js实现将文本转PDF格式并下载到本地

html里面需要引入jspdf.umd.min.js和FileSaver.js jspdf.umd.min.js:https://www.npmjs.com/package/jspdf FileSaver.js:https://download.csdn.net/download/weixin_45791806/87272893?spm1001.2014.3001.5503 同时项目的根部目录也需要引入SimHei.tt…...

Servlet+JDBC实战开发书店项目讲解第四篇:登录实现

ServletJDBC 实战开发书店项目讲解第四篇:登录注册实现 在本篇博客中,我们将继续讲解 ServletJDBC 实战开发书店项目。这次我们将重点讲解如何实现登录和注册功能。 1. 创建数据库表 首先,我们需要在数据库中创建两个表,一个用…...

HarmonyOS NEXT新能力,一站式高效开发HarmonyOS应用

2023年8月6日华为开发者大会2023(HDC.Together)圆满收官,伴随着HarmonyOS 4的发布,华为向开发者发布了汇聚所有最新开发能力的HarmonyOS NEXT开发者预览版,并分享了围绕“一次开发,多端部署” “可分可合&a…...

【Java从0到1学习】09 正则表达式

1. 正则表达式概述 在编写处理字符串的程序或网页时,经常会有查找符合某些复杂规则的字符串的需要。正则表达式就是用于描述这些规则的工具。换句话说,正则表达式就是记录文本规则的代码。 正则表达式,又称正规表示法、常规表示法&#xff…...

log4j:WARN No appenders could be found for logger问题

本文将idea场景下的使用。 IDEA中,将配置文件命名为log4j.properties(该命名才会被自动加载), 并放到某个目录下(通常放到resources目录),并在resources上右键,找到Mark Directory a…...

【Java】批量生成条形码-itextpdf

批量生成条形码 Controller ApiOperation("商品一览批量生成商品条形码")PostMapping("/batchGenerateProdBarCode")public void batchGenerateProdBarCode(RequestBody ProductListCondition productListCondition,HttpServletResponse response){import…...

SpringBoot登录、退出、获取用户信息的session处理

1、登录方法&#xff1a;login PostMapping("/user/login")public ResponseVo<User> login(Valid RequestBody UserLoginForm userLoginForm,HttpSession session) {ResponseVo<User> userResponseVo userService.login(userLoginForm.getUsername(), …...

【软件测试】随笔系统测试报告

博主简介&#xff1a;想进大厂的打工人博主主页&#xff1a;xyk:所属专栏: 软件测试 随笔系统采用 SSM 框架前后端分离的方法实现&#xff0c;本文主要针对功能&#xff1a;登录&#xff0c;注册&#xff0c;注销&#xff0c;写随笔&#xff0c;删除随笔&#xff0c;随笔详情页…...

vue中使用html2canvas+jsPDF实现pdf的导出

导入依赖 html2canvas依赖 npm install html2canvasjspdf依赖 npm install jspdfpdf导出 以导出横向&#xff0c;A4大小的pdf为例 规律&#xff1a;1. html2canvas 中&#xff0c;在保持jsPDF中的宽高不变的情况下&#xff0c;设置html2canvas中的 width 和 height 值越小&a…...

Linux学习之firewallD

systemctl status firewalld.service查看一下firewalld服务的状态&#xff0c;发现状态是inactive (dead)。 systemctl start firewalld.service启动firewalld&#xff0c;systemctl status firewalld.service查看一下firewalld服务的状态&#xff0c;发现状态是active (runni…...

【JS学习】Object.assign 用法介绍

Object.assign 是ES6中的一个方法。该方法能够实现对象的浅复制以及对象合并。Object.assign 并不会修改目标对象本身&#xff0c;而是返回一个新的对象&#xff0c;其中包含了所有源对象的属性。 例1 2个对象合并 const target { a: 1, b: 2 }; const source { b: 3, c: 4…...

【uni-app报错】获取用户收货地址uni.chooseAddress()报错问题

chooseAddress:fail the api need to be declared in …e requiredPrivateInf 原因&#xff1a; 小程序配置 / 全局配置 (qq.com) 解决&#xff1a; 登录小程序后台申请接口 按照流程申请即可 在项目根目录中找到 manifest.json 文件&#xff0c;在左侧导航栏选择源码视图&a…...

机器学习、cv、nlp的一些前置知识

为节省篇幅&#xff0c;不标注文章来源和文章的问题场景。大部分是我的通俗理解。 文章目录 向量关于向量的偏导数&#xff1a;雅可比矩阵二阶导数矩阵&#xff1a;海森矩阵随机变量随机场伽马函数beta分布数学术语坐标上升法协方差训练集&#xff0c;验证集&#xff0c;测试集…...

Steam 灵感的游戏卡悬停效果

先看效果&#xff1a; 再看代码&#xff08;查看更多&#xff09;&#xff1a; <!DOCTYPE html> <html lang"en"> <head><meta charset"UTF-8"><title>Steam 灵感的游戏卡悬停效果</title><style>* {margin: …...

[Openwrt]一步一步搭建MT7981A uboot、atf、openwrt-21.02开发环境操作说明

安装ubuntu-18.04 软件安装包 ubuntu-18.04-desktop-amd64.iso 修改ubuntu管理员密码 sudo passwd [sudo] password for w1804: Enter new UNIX password: Retype new UNIX password: passwd: password updated successfully 更新ubuntu源 备份源 sudo cp /etc/apt/so…...

Unity C# 之 Azure 微软SSML语音合成TTS流式获取音频数据以及表情嘴型 Animation 的简单整理

Unity C# 之 Azure 微软SSML语音合成TTS流式获取音频数据以及表情嘴型 Animation 的简单整理 目录 Unity C# 之 Azure 微软SSML语音合成TTS流式获取音频数据以及表情嘴型 Animation 的简单整理 一、简单介绍 二、实现原理 三、注意事项 四、实现步骤 五、关键代码 一、简…...

安全学习DAY16_信息打点-CDN绕过

信息打点-CDN绕过 文章目录 信息打点-CDN绕过本节思维导图相关链接&工具站&项目工具前置知识&#xff1a;CDN配置&#xff1a;配置1&#xff1a;加速域名-需要启用加速的域名配置2&#xff1a;加速区域-需要启用加速的地区配置3&#xff1a;加速类型-需要启用加速的资源…...

genism word2vec方法

文章目录 概述使用示例模型的保存与使用训练参数详解&#xff08;[原链接](https://blog.csdn.net/weixin_44852067/article/details/130221655)&#xff09;语料库训练 概述 word2vec是按句子来处理的Sentences(句子们) 使用示例 from gensim.models import Word2Vec #sent…...

PHP和Node.js哪个更爽?

先说结论&#xff0c;rust完胜。 php&#xff1a;laravel&#xff0c;swoole&#xff0c;webman&#xff0c;最开始在苏宁的时候写了几年php&#xff0c;当时觉得php真的是世界上最好的语言&#xff0c;因为当初活在舒适圈里&#xff0c;不愿意跳出来&#xff0c;就好比当初活在…...

visual studio 2022更改主题为深色

visual studio 2022更改主题为深色 点击visual studio 上方的 工具-> 选项 在选项窗口中&#xff0c;选择 环境 -> 常规 &#xff0c;将其中的颜色主题改成深色 点击确定&#xff0c;更改完成...

Frozen-Flask :将 Flask 应用“冻结”为静态文件

Frozen-Flask 是一个用于将 Flask 应用“冻结”为静态文件的 Python 扩展。它的核心用途是&#xff1a;将一个 Flask Web 应用生成成纯静态 HTML 文件&#xff0c;从而可以部署到静态网站托管服务上&#xff0c;如 GitHub Pages、Netlify 或任何支持静态文件的网站服务器。 &am…...

OkHttp 中实现断点续传 demo

在 OkHttp 中实现断点续传主要通过以下步骤完成&#xff0c;核心是利用 HTTP 协议的 Range 请求头指定下载范围&#xff1a; 实现原理 Range 请求头&#xff1a;向服务器请求文件的特定字节范围&#xff08;如 Range: bytes1024-&#xff09; 本地文件记录&#xff1a;保存已…...

BCS 2025|百度副总裁陈洋:智能体在安全领域的应用实践

6月5日&#xff0c;2025全球数字经济大会数字安全主论坛暨北京网络安全大会在国家会议中心隆重开幕。百度副总裁陈洋受邀出席&#xff0c;并作《智能体在安全领域的应用实践》主题演讲&#xff0c;分享了在智能体在安全领域的突破性实践。他指出&#xff0c;百度通过将安全能力…...

select、poll、epoll 与 Reactor 模式

在高并发网络编程领域&#xff0c;高效处理大量连接和 I/O 事件是系统性能的关键。select、poll、epoll 作为 I/O 多路复用技术的代表&#xff0c;以及基于它们实现的 Reactor 模式&#xff0c;为开发者提供了强大的工具。本文将深入探讨这些技术的底层原理、优缺点。​ 一、I…...

视频行为标注工具BehaviLabel(源码+使用介绍+Windows.Exe版本)

前言&#xff1a; 最近在做行为检测相关的模型&#xff0c;用的是时空图卷积网络&#xff08;STGCN&#xff09;&#xff0c;但原有kinetic-400数据集数据质量较低&#xff0c;需要进行细粒度的标注&#xff0c;同时粗略搜了下已有开源工具基本都集中于图像分割这块&#xff0c…...

PAN/FPN

import torch import torch.nn as nn import torch.nn.functional as F import mathclass LowResQueryHighResKVAttention(nn.Module):"""方案 1: 低分辨率特征 (Query) 查询高分辨率特征 (Key, Value).输出分辨率与低分辨率输入相同。"""def __…...

springboot整合VUE之在线教育管理系统简介

可以学习到的技能 学会常用技术栈的使用 独立开发项目 学会前端的开发流程 学会后端的开发流程 学会数据库的设计 学会前后端接口调用方式 学会多模块之间的关联 学会数据的处理 适用人群 在校学生&#xff0c;小白用户&#xff0c;想学习知识的 有点基础&#xff0c;想要通过项…...

【MATLAB代码】基于最大相关熵准则(MCC)的三维鲁棒卡尔曼滤波算法(MCC-KF),附源代码|订阅专栏后可直接查看

文章所述的代码实现了基于最大相关熵准则(MCC)的三维鲁棒卡尔曼滤波算法(MCC-KF),针对传感器观测数据中存在的脉冲型异常噪声问题,通过非线性加权机制提升滤波器的抗干扰能力。代码通过对比传统KF与MCC-KF在含异常值场景下的表现,验证了后者在状态估计鲁棒性方面的显著优…...