当前位置: 首页 > news >正文

pyscenic分析:视频教程

我们之前更新过pyscenic的教程:pySCENIC单细胞转录因子分析更新:数据库、软件更新。我们也说过,我们号是放弃R语言版的SCENIC的分析了,因为它比较耗费计算资源和时间,所以我们的单细胞转录因子分析教程都是基于pyscenic的分析进行的。有很多小伙伴反应,自己在实际操作过程中,总是报错,我猜测大多数是软件的问题。有些说想知道整个运行过程是怎么样的,所以我们出了这个视频教程,演示整个pyscenic的流程。当然,我们还介绍了docker镜像pyscenic分析。

单细胞转录因子的分析是需要利用服务器的:KS推荐:生信分析服务器。我们的这个视频从数据准备、软件安装、步骤分析、镜像分析等等方面,展示了pyscenic分析的过程,最终得到分析结果。

不知道什么原因,视频这里上传不成功,所以可从B站链接观看:

https://www.bilibili.com/video/BV1Yj411r7dE/?spm_id_from=333.999.0.0&vd_source=05b5479545ba945a8f5d7b2e7160ea34

图片

得到分析结果之后,那么后续的内容也就好办了,我们也写了很多的R语言版的分析和可视化,以及python版本的分析可视化。

PySCENIC(二):pyscenic单细胞转录组转录因子分析

PySCENIC(三):pyscenic单细胞转录因子分析可视化

PySCENIC(四):pyscenic结果之差异转录因子分析及其他可视化

pySCENIC单细胞转录因子分析更新:数据库、软件更新

pySCENIC单细胞转录因子分析更新(2):python版分析及可视化

pySCENIC可视化分析更新(3):python版可视化修改

视频制作不易,觉得分享有用的点个赞再走呗!

相关文章:

pyscenic分析:视频教程

我们之前更新过pyscenic的教程:pySCENIC单细胞转录因子分析更新:数据库、软件更新。我们也说过,我们号是放弃R语言版的SCENIC的分析了,因为它比较耗费计算资源和时间,所以我们的单细胞转录因子分析教程都是基于pysceni…...

可视化绘图技巧100篇进阶篇(九)-三维百分比堆积条形图(3D Stacked Percentage Bar Chart)

目录 前言 适用场景 绘图工具及代码实现 帆软 实现思路 方案一:使用计算指标 上传数据 添加组件 生成图表 添加计算字段 生成分区柱形图 生成百分比堆积条形图 美化图表 设置标签 设置颜色 效果查看 PC 端 移动端 方案二:使用自助数…...

js实现将文本转PDF格式并下载到本地

html里面需要引入jspdf.umd.min.js和FileSaver.js jspdf.umd.min.js:https://www.npmjs.com/package/jspdf FileSaver.js:https://download.csdn.net/download/weixin_45791806/87272893?spm1001.2014.3001.5503 同时项目的根部目录也需要引入SimHei.tt…...

Servlet+JDBC实战开发书店项目讲解第四篇:登录实现

ServletJDBC 实战开发书店项目讲解第四篇:登录注册实现 在本篇博客中,我们将继续讲解 ServletJDBC 实战开发书店项目。这次我们将重点讲解如何实现登录和注册功能。 1. 创建数据库表 首先,我们需要在数据库中创建两个表,一个用…...

HarmonyOS NEXT新能力,一站式高效开发HarmonyOS应用

2023年8月6日华为开发者大会2023(HDC.Together)圆满收官,伴随着HarmonyOS 4的发布,华为向开发者发布了汇聚所有最新开发能力的HarmonyOS NEXT开发者预览版,并分享了围绕“一次开发,多端部署” “可分可合&a…...

【Java从0到1学习】09 正则表达式

1. 正则表达式概述 在编写处理字符串的程序或网页时,经常会有查找符合某些复杂规则的字符串的需要。正则表达式就是用于描述这些规则的工具。换句话说,正则表达式就是记录文本规则的代码。 正则表达式,又称正规表示法、常规表示法&#xff…...

log4j:WARN No appenders could be found for logger问题

本文将idea场景下的使用。 IDEA中,将配置文件命名为log4j.properties(该命名才会被自动加载), 并放到某个目录下(通常放到resources目录),并在resources上右键,找到Mark Directory a…...

【Java】批量生成条形码-itextpdf

批量生成条形码 Controller ApiOperation("商品一览批量生成商品条形码")PostMapping("/batchGenerateProdBarCode")public void batchGenerateProdBarCode(RequestBody ProductListCondition productListCondition,HttpServletResponse response){import…...

SpringBoot登录、退出、获取用户信息的session处理

1、登录方法&#xff1a;login PostMapping("/user/login")public ResponseVo<User> login(Valid RequestBody UserLoginForm userLoginForm,HttpSession session) {ResponseVo<User> userResponseVo userService.login(userLoginForm.getUsername(), …...

【软件测试】随笔系统测试报告

博主简介&#xff1a;想进大厂的打工人博主主页&#xff1a;xyk:所属专栏: 软件测试 随笔系统采用 SSM 框架前后端分离的方法实现&#xff0c;本文主要针对功能&#xff1a;登录&#xff0c;注册&#xff0c;注销&#xff0c;写随笔&#xff0c;删除随笔&#xff0c;随笔详情页…...

vue中使用html2canvas+jsPDF实现pdf的导出

导入依赖 html2canvas依赖 npm install html2canvasjspdf依赖 npm install jspdfpdf导出 以导出横向&#xff0c;A4大小的pdf为例 规律&#xff1a;1. html2canvas 中&#xff0c;在保持jsPDF中的宽高不变的情况下&#xff0c;设置html2canvas中的 width 和 height 值越小&a…...

Linux学习之firewallD

systemctl status firewalld.service查看一下firewalld服务的状态&#xff0c;发现状态是inactive (dead)。 systemctl start firewalld.service启动firewalld&#xff0c;systemctl status firewalld.service查看一下firewalld服务的状态&#xff0c;发现状态是active (runni…...

【JS学习】Object.assign 用法介绍

Object.assign 是ES6中的一个方法。该方法能够实现对象的浅复制以及对象合并。Object.assign 并不会修改目标对象本身&#xff0c;而是返回一个新的对象&#xff0c;其中包含了所有源对象的属性。 例1 2个对象合并 const target { a: 1, b: 2 }; const source { b: 3, c: 4…...

【uni-app报错】获取用户收货地址uni.chooseAddress()报错问题

chooseAddress:fail the api need to be declared in …e requiredPrivateInf 原因&#xff1a; 小程序配置 / 全局配置 (qq.com) 解决&#xff1a; 登录小程序后台申请接口 按照流程申请即可 在项目根目录中找到 manifest.json 文件&#xff0c;在左侧导航栏选择源码视图&a…...

机器学习、cv、nlp的一些前置知识

为节省篇幅&#xff0c;不标注文章来源和文章的问题场景。大部分是我的通俗理解。 文章目录 向量关于向量的偏导数&#xff1a;雅可比矩阵二阶导数矩阵&#xff1a;海森矩阵随机变量随机场伽马函数beta分布数学术语坐标上升法协方差训练集&#xff0c;验证集&#xff0c;测试集…...

Steam 灵感的游戏卡悬停效果

先看效果&#xff1a; 再看代码&#xff08;查看更多&#xff09;&#xff1a; <!DOCTYPE html> <html lang"en"> <head><meta charset"UTF-8"><title>Steam 灵感的游戏卡悬停效果</title><style>* {margin: …...

[Openwrt]一步一步搭建MT7981A uboot、atf、openwrt-21.02开发环境操作说明

安装ubuntu-18.04 软件安装包 ubuntu-18.04-desktop-amd64.iso 修改ubuntu管理员密码 sudo passwd [sudo] password for w1804: Enter new UNIX password: Retype new UNIX password: passwd: password updated successfully 更新ubuntu源 备份源 sudo cp /etc/apt/so…...

Unity C# 之 Azure 微软SSML语音合成TTS流式获取音频数据以及表情嘴型 Animation 的简单整理

Unity C# 之 Azure 微软SSML语音合成TTS流式获取音频数据以及表情嘴型 Animation 的简单整理 目录 Unity C# 之 Azure 微软SSML语音合成TTS流式获取音频数据以及表情嘴型 Animation 的简单整理 一、简单介绍 二、实现原理 三、注意事项 四、实现步骤 五、关键代码 一、简…...

安全学习DAY16_信息打点-CDN绕过

信息打点-CDN绕过 文章目录 信息打点-CDN绕过本节思维导图相关链接&工具站&项目工具前置知识&#xff1a;CDN配置&#xff1a;配置1&#xff1a;加速域名-需要启用加速的域名配置2&#xff1a;加速区域-需要启用加速的地区配置3&#xff1a;加速类型-需要启用加速的资源…...

genism word2vec方法

文章目录 概述使用示例模型的保存与使用训练参数详解&#xff08;[原链接](https://blog.csdn.net/weixin_44852067/article/details/130221655)&#xff09;语料库训练 概述 word2vec是按句子来处理的Sentences(句子们) 使用示例 from gensim.models import Word2Vec #sent…...

华为云AI开发平台ModelArts

华为云ModelArts&#xff1a;重塑AI开发流程的“智能引擎”与“创新加速器”&#xff01; 在人工智能浪潮席卷全球的2025年&#xff0c;企业拥抱AI的意愿空前高涨&#xff0c;但技术门槛高、流程复杂、资源投入巨大的现实&#xff0c;却让许多创新构想止步于实验室。数据科学家…...

React 第五十五节 Router 中 useAsyncError的使用详解

前言 useAsyncError 是 React Router v6.4 引入的一个钩子&#xff0c;用于处理异步操作&#xff08;如数据加载&#xff09;中的错误。下面我将详细解释其用途并提供代码示例。 一、useAsyncError 用途 处理异步错误&#xff1a;捕获在 loader 或 action 中发生的异步错误替…...

Java 语言特性(面试系列1)

一、面向对象编程 1. 封装&#xff08;Encapsulation&#xff09; 定义&#xff1a;将数据&#xff08;属性&#xff09;和操作数据的方法绑定在一起&#xff0c;通过访问控制符&#xff08;private、protected、public&#xff09;隐藏内部实现细节。示例&#xff1a; public …...

安宝特方案丨XRSOP人员作业标准化管理平台:AR智慧点检验收套件

在选煤厂、化工厂、钢铁厂等过程生产型企业&#xff0c;其生产设备的运行效率和非计划停机对工业制造效益有较大影响。 随着企业自动化和智能化建设的推进&#xff0c;需提前预防假检、错检、漏检&#xff0c;推动智慧生产运维系统数据的流动和现场赋能应用。同时&#xff0c;…...

FastAPI 教程:从入门到实践

FastAPI 是一个现代、快速&#xff08;高性能&#xff09;的 Web 框架&#xff0c;用于构建 API&#xff0c;支持 Python 3.6。它基于标准 Python 类型提示&#xff0c;易于学习且功能强大。以下是一个完整的 FastAPI 入门教程&#xff0c;涵盖从环境搭建到创建并运行一个简单的…...

DBAPI如何优雅的获取单条数据

API如何优雅的获取单条数据 案例一 对于查询类API&#xff0c;查询的是单条数据&#xff0c;比如根据主键ID查询用户信息&#xff0c;sql如下&#xff1a; select id, name, age from user where id #{id}API默认返回的数据格式是多条的&#xff0c;如下&#xff1a; {&qu…...

IP如何挑?2025年海外专线IP如何购买?

你花了时间和预算买了IP&#xff0c;结果IP质量不佳&#xff0c;项目效率低下不说&#xff0c;还可能带来莫名的网络问题&#xff0c;是不是太闹心了&#xff1f;尤其是在面对海外专线IP时&#xff0c;到底怎么才能买到适合自己的呢&#xff1f;所以&#xff0c;挑IP绝对是个技…...

【从零学习JVM|第三篇】类的生命周期(高频面试题)

前言&#xff1a; 在Java编程中&#xff0c;类的生命周期是指类从被加载到内存中开始&#xff0c;到被卸载出内存为止的整个过程。了解类的生命周期对于理解Java程序的运行机制以及性能优化非常重要。本文会深入探寻类的生命周期&#xff0c;让读者对此有深刻印象。 目录 ​…...

STM32---外部32.768K晶振(LSE)无法起振问题

晶振是否起振主要就检查两个1、晶振与MCU是否兼容&#xff1b;2、晶振的负载电容是否匹配 目录 一、判断晶振与MCU是否兼容 二、判断负载电容是否匹配 1. 晶振负载电容&#xff08;CL&#xff09;与匹配电容&#xff08;CL1、CL2&#xff09;的关系 2. 如何选择 CL1 和 CL…...

淘宝扭蛋机小程序系统开发:打造互动性强的购物平台

淘宝扭蛋机小程序系统的开发&#xff0c;旨在打造一个互动性强的购物平台&#xff0c;让用户在购物的同时&#xff0c;能够享受到更多的乐趣和惊喜。 淘宝扭蛋机小程序系统拥有丰富的互动功能。用户可以通过虚拟摇杆操作扭蛋机&#xff0c;实现旋转、抽拉等动作&#xff0c;增…...