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Cornerstone完整的基于 Web 的医学成像平台(一)

1.简介

Cornerstone是一个开源的基于Web的医学成像平台,它提供了一个易于使用的界面,可以用于加载、显示和处理医学图像。Cornerstone可以用于许多医学图像处理应用程序,例如计算机断层扫描(CT)、磁共振成像(MRI)和超声成像(US)等。

Cornerstone的主要特点包括:

跨平台性: Cornerstone基于Web技术开发,可以在不同的操作系统和设备上运行,例如Windows、Linux、macOS和移动设备等。
灵活性: Cornerstone提供了一组灵活的API,可以让开发人员自定义和扩展功能。
高性能: Cornerstone使用WebGL和Canvas技术来加速图像渲染,可以处理大量的图像数据。
开源: Cornerstone是一个开源项目,使用MIT许可证发布,可以自由使用和分发。
在本文中,我们将介绍如何在Ubuntu操作系统上安装和部署Cornerstone。以下是安装和部署Cornerstone的步骤:

2. 安装Node.js和NPM

Cornerstone是一个基于Node.js和NPM的Web应用程序,因此需要先安装Node.js和NPM。

使用以下命令在Ubuntu上安装Node.js和NPM:

sudo apt update
sudo apt install nodejs npm

安装完成后,可以使用以下命令验证Node.js和NPM的版本:

node -v
npm -v

3. 下载Cornerstone

使用以下命令从Cornerstone的GitHub仓库下载源代码:

git clone https://github.com/cornerstonejs/cornerstone.git

4. 构建和启动Cornerstone

在下载源代码后,使用以下命令安装依赖项:

cd cornerstone
npm install

安装完成后,可以使用以下命令启动Cornerstone:

npm start

该命令将启动Cornerstone服务器,并在本地端口3000上提供服务。可以使用Web浏览器访问http://localhost:3000来查看Cornerstone的示例应用程序。

5. 使用Cornerstone

Cornerstone提供了一组丰富的API和插件,可以让开发人员轻松地加载、显示和处理医学图像。例如,以下代码片段演示了如何在Web页面中加载和显示DICOM格式的图像:

// 加载Cornerstone核心模块
import cornerstone from 'cornerstone-core';// 加载DICOM格式解码器
import dicomParser from 'dicom-parser';// 加载Cornerstone DICOM模块
import cornerstoneWADOImageLoader from 'cornerstone-wado-image-loader';
import cornerstoneDICOM from 'cornerstone-dicom-loader';// 设置DICOM格式解码器
cornerstoneWADOImageLoader.external.cornerstone = cornerstone;
cornerstoneWADOImageLoader.external.dicomParser = dicomParser;// 加载DICOM文件
const file = 'https://example.com/path/to/dicom/file.dcm';
const imageId = cornerstoneWADOImageLoader.wadouri.fileManager.add(file);// 显示图像
const element = document.getElementById('image-container');
cornerstone.enable(element);
cornerstone.loadImage(imageId).then(image => {
cornerstone.displayImage(element, image);
});

6. 实列代码Cornerstone

以下是一个完整的基于Web的医学成像平台Cornerstone的示例代码,包括加载DICOM格式的图像和测量工具的使用。代码中的注释提供了更详细的解释和说明。

<!DOCTYPE html>
<html>
<head><title>Cornerstone Example</title><!-- 引入Cornerstone库的CSS和JS文件 --><link rel="stylesheet" href="https://unpkg.com/cornerstone-core/dist/cornerstone.min.css" /><script src="https://unpkg.com/cornerstone-core/dist/cornerstone.min.js"></script><!-- 引入DICOM格式的解码器和加载器 --><script src="https://unpkg.com/cornerstone-wado-image-loader/dist/cornerstoneWADOImageLoader.min.js"></script><script src="https://unpkg.com/cornerstone-dicom-loader/dist/cornerstoneDICOMLoader.min.js"></script>
</head>
<body><div id="image-container"></div><!-- 加载和显示DICOM格式的图像 --><script>// 加载DICOM文件const file = 'https://example.com/path/to/dicom/file.dcm';const imageId = cornerstoneWADOImageLoader.wadouri.fileManager.add(file);// 显示图像const element = document.getElementById('image-container');cornerstone.enable(element);cornerstone.loadImage(imageId).then(image => {cornerstone.displayImage(element, image);});</script><!-- 添加测量工具 --><script>const mouseTool = cornerstoneTools.MouseButtonTool({// 工具名称name: 'Mouse',// 鼠标点击事件mouseDownCallback: function (e) {console.log('mouse down');},// 鼠标移动事件mouseMoveCallback: function (e) {console.log('mouse move');},// 鼠标松开事件mouseUpCallback: function (e) {console.log('mouse up');}});// 将测量工具添加到工具栏cornerstoneTools.addTool(mouseTool);cornerstoneTools.setToolActive('Mouse');</script>
</body>
</html>

在上面的代码中,我们引入了Cornerstone库的CSS和JS文件,以及DICOM格式的解码器和加载器。然后,我们使用cornerstoneWADOImageLoader.wadouri.fileManager.add方法加载DICOM文件,并使用cornerstone.enable方法启用Cornerstone在指定的DOM元素上显示图像。我们使用cornerstone.loadImage方法加载图像,并使用cornerstone.displayImage方法显示图像。

接下来,我们使用cornerstoneTools.MouseButtonTool方法创建一个测量工具,并将其添加到工具栏中。最后,我们使用cornerstoneTools.setToolActive方法激活该工具。

当用户使用该工具时,测量工具的回调函数将会被触发,例如当用户按下鼠标时,mouseDownCallback函数将会被调用。

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