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AI预测小分子与蛋白的相关特征： MegaMolBART, MoFlow，ESM-1, ESM-2

news 2025/10/14 12:30:20

1、小分子：MegaMolBART, MoFlow

1）MegaMolBART
https://github.com/NVIDIA/MegaMolBART
基于 SMILES 的小分子药物发现与化学信息学深度学习模型。

2）MoFlow
https://github.com/calvin-zcx/moflow
用flow流方式分子生成

2、蛋白质：ESM-1, ESM-2

https://github.com/facebookresearch/esm
两个都是META对蛋白质相关的transformer模型

在这里插入图片描述

pip install fair-esm # latest release, OR:
pip install git+https://github.com/facebookresearch/esm.git # bleeding edge, current repo main branch

安装上面esm包后，可以通过下面esm-extract命令行提取蛋白的特征向量

esm-extract esm2_t33_650M_UR50D examples/data/some_proteins

AI预测小分子与蛋白的相关特征： MegaMolBART, MoFlow，ESM-1, ESM-2

1、小分子：MegaMolBART, MoFlow 1）MegaMolBART https://github.com/NVIDIA/MegaMolBART 基于 SMILES 的小分子药物发现与化学信息学深度学习模型。 2）MoFlow https://github.com/calvin-zcx/moflow 用flow流方式分子生成 2、蛋白质：ESM-1, ESM-2 https://github.com/fa…...

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土地利用/土地覆盖遥感解译与基于CLUE模型未来变化情景预测；从基础到高级，涵盖ArcGIS数据处理、ENVI遥感解译与CLUE模型情景模拟等

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第 86 场周赛：矩阵中的幻方、钥匙和房间、将数组拆分成斐波那契序列、猜猜这个单词

Q1、[中等] 矩阵中的幻方 1、题目描述 3 x 3 的幻方是一个填充有从 1 到 9 的不同数字的 3 x 3 矩阵，其中每行，每列以及两条对角线上的各数之和都相等。给定一个由整数组成的row x col 的 grid，其中有多少个 3 3 的 “幻方” 子矩阵&am…...

编程新知 2025/9/29 19:03:00

【MATLAB代码】基于最大相关熵准则（MCC）的三维鲁棒卡尔曼滤波算法（MCC-KF），附源代码|订阅专栏后可直接查看

文章所述的代码实现了基于最大相关熵准则（MCC）的三维鲁棒卡尔曼滤波算法（MCC-KF），针对传感器观测数据中存在的脉冲型异常噪声问题，通过非线性加权机制提升滤波器的抗干扰能力。代码通过对比传统KF与MCC-KF在含异常值场景下的表现，验证了后者在状态估计鲁棒性方面的显著优…...

编程新知 2025/10/6 17:54:26

MySQL 部分重点知识篇

一、数据库对象 1. 主键定义 ：主键是用于唯一标识表中每一行记录的字段或字段组合。它具有唯一性和非空性特点。作用 ：确保数据的完整性，便于数据的查询和管理。示例 ：在学生信息表中，学号可以作为主键&#xff…...

编程新知 2025/8/19 22:24:50

1、小分子：MegaMolBART, MoFlow

2、蛋白质：ESM-1, ESM-2

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