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Linux中多线程压缩软件 | Mingz

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本期教程

软件网址:

https://github.com/hewm2008/MingZ

安装:

git clone https://github.com/hewm2008/MingZ.git
cd MingZ
make
cd bin
./mingz -h

使用源码安装:

若是你的git无法使用安装,也可以只用源码安装。

https://github.com/hewm2008/MingZ/releases/tag/v1.12

安装成功:

添加路径:

vim ~/.bashrc
# 添加路径
PATH=$PATH:~/software/MingZ/bin# 刷新一下~/.bashrc
source ~/.bashrc

使用:

	Usage: mingz  big1.fq *.fqOptions:-i   <str>   input of text file or pipe-o   <str>   output of text file-t           number of threads [4]-c           write on standard output-d           decompress(no threads)-h           show help hewm2008[v1.10]

例子:压缩

	mingz  InA.fq  InB.fq  -o NewOutA.fq.gz   -o NewOutB.fq.gz mingz *.fq   # will remove raw file out InA.fq.gz InB.fq.gzmingz  InA.fq  -t  10  # muti threadscat  InA.fq  | mingz  > NewOutA.fq.gz  ##    cat  InA.fq  | mingz  -o  NewOutA.fq.gz

解压:

	mingz In.fq.gz -c -d  > new.Fqmingz -i In.Fa.gz -o  OutNew.fq  mingz *.gz -d   # will remove raw file

速度比拼:

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小杜的生信筆記 ,主要发表或收录生物信息学教程,以及基于R分析和可视化(包括数据分析,图形绘制等);分享感兴趣的文献和学习资料!!

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