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pyrosetta MoveMap介绍

在 PyRosetta 中,MoveMap 是一个非常重要的类,用来控制蛋白质分子中哪些部分可以在某些操作(如折叠、旋转、优化等)中被移动。MoveMap 允许你精确地指定哪些残基、键角或原子可以进行特定的运动,从而帮助你在蛋白质结构预测、优化和设计中进行灵活的控制。

MoveMap 的功能

MoveMap 的主要功能是通过设置允许移动的区域,配合 Rosetta 的 Mover 和 Minimizer,实现特定区域的优化或变动。MoveMap 可以控制:

  • 主链的移动(backbone torsions,phi、psi 角)
  • 侧链的移动(sidechain torsions,chi 角)
  • 特定的原子或残基的移动
  • 整个片段的移动(比如 rigid-body 运动)

你可以使用 MoveMap 来定义特定区域的主链二面角、侧链二面角,甚至是相对位置(刚体运动)是否能够被移动和优化。

MoveMap 的主要方法

  • set_bb(True or False): 设置所有主链(backbone)是否可以移动。
  • set_chi(True or False): 设置所有侧链是否可以移动。
  • set_jump(True or False): 设置所有跳跃(rigid-body

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