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多组学数据如何发表高分SCI论文，以RNA-Seq数据为例

news 2025/7/2 11:25:33

随着高通量测序以及生物信息学的发展，R语言在生物大数据分析以及数据挖掘中发挥着越来越重要的作用。想要成为一名优秀的生物数据分析者与科研团队不可或缺的人才，除了掌握对生物大数据挖掘与分析技能之外，还要具备一定的统计分析能力与SCI论文质量绘图能力。因此，为辅助提高生命科学研究工作者的生物数据可视化与深度挖掘技能，我们举办了本次R语言与生物信息学培训班，本次会议我们精选大量生物数据分析案例，包括利用R语言绘制SCI高质量图片、利用R语言分析生物学数据的案例。通过本次培训，使学员能够掌握利用R科学文献图的绘制技巧、完整的利用R分析生物数据，提高学员数据分析技能、领会高水平SCI论文撰写思路。

主讲人：来自重点高校及科研院所一线科研人员，长期从事生物数据分析与挖掘，基因测序等领域工作研究工作，以第一作者或通讯作者发表过多篇生物学一区、二区SCI高水平论文（如：Plant Cell、Plos genetics; New Phytologist; Journal of Experimental Botany等）。精通R语言、python语言等分析工具，具有丰富的科研及高通量测序数据分析与挖掘经验。

专题一 R语言基础介绍和环境搭建

1.编程语言学习经历分享

2.R语言数据操作技巧

3.R语言与windows系统、Linux服务器及使用方法

4.R 语言与生物信息数据的联系

5.多组学数据的分析方法

6、R语言在生物信息学中的应用

专题二 R语言介绍及基本语法

R语言发展脉络

R与工作目录

R的数据类型及结构 (数值型、逻辑型、字符型、向量、列表、数据框、矩阵)

R中各数据类型的赋值与操作

(针对不同数据类型进行赋值、批量读取数据、通过循环对数据进行计算、差异分析)

各种数据格式的读写及操作 (Excel、TXT、CSV、TSV)

经典生信数据R脚本编写与详解

专题三 R基本绘图语法

生物信息多组学大数据分析技巧与提升

R语言基本绘图命令概述

R语言高级绘图命令概述

R语言经典生信数据R脚本解析

专题四 R语言数据绘图基本方法

R语言高级绘图命令概述

基因组大小与基因含量的散点图

绘制基因长度分布直方图

绘制基因长度分布的频率分布密度曲线

向图中添加数学公式

热图绘制及参数详解

专题五 R语言与各种图形绘制

韦恩图、小提琴图、火山图、折线图、网络图、趋势图、箱线图

多组学数据如何发表高分SCI论文，以RNA-Seq数据为例

随着高通量测序以及生物信息学的发展，R语言在生物大数据分析以及数据挖掘中发挥着越来越重要的作用。想要成为一名优秀的生物数据分析者与科研团队不可或缺的人才，除了掌握对生物大数据挖掘与分析技能之外，还要具备一定的统计分析能力与SCI论…...

编程日记 2024/12/8 23:59:00

Qt Designer Ui设计功能增加

效果展示输入密码，密码错误，弹出提示密码正确，弹出提示并且关闭原窗口代码（只提供重要关键主代码）lxh_log.py代码： import sysfrom PySide6.QtWidgets import QApplication, QWidget, QPushButtonfrom …...

编程日记 2024/12/8 23:49:50

【Android学习】2024最新版Android Studio安装与配置

准备工作 Windows系统的要求一、下载 Android Studio官网：https://developer.android.google.cn/studio?hlen 今天是2024年9月27日，Android Studio已经更新到了Koala版本直接下载二、安装笔者当前环境变量中配置的JDK版本为1.8 双击.exe文件运行…...

编程日记 2024/12/8 23:48:49

RabbitMQ延时队列

RabbitMQ延时队列什么是延时队列延时队列顾名思义，即放置在该队列里面的消息是不需要立即消费的，而是等待一段时间之后取出消费。应用场景场景一：在订单系统中，一个用户下单之后通常有30分钟的时间进行支付，如…...

编程日记 2024/12/8 23:47:47

a8204 基于微信小程序的音乐播放器微信小程序的研究与实现服务器端Java+Mysql+Servlet 文档源码

音乐播放微信小程序 1.项目描述2. 绪论3.项目功能4.界面展示5.源码获取 1.项目描述随着科技的发展，手机在我们生活中起到了重要的作用。软件作为手机重要的一部分，用户体验显得尤为重要。微信小程序一起操作便捷、用户基数大、分享便利、既用即走等特点…...

编程日记 2024/12/8 23:46:46

游戏新纪元：用栈记录数据，轻松实现悔棋功能

游戏介绍嘿，各位游戏爱好者们！今天我要给大家介绍一款颠覆传统、创新十足的游戏项目。这款游戏不仅让你沉浸在紧张刺激的游戏世界中，还引入了前所未有的两大特色功能：记录游戏数据和轻松实现悔棋。首先，让我们来聊…...

编程日记 2024/12/8 23:44:44

C/C++基础知识复习（36）

函数重载是指在同一作用域内，定义多个同名但参数列表不同的函数。通过函数重载，程序员可以使用相同的函数名称处理不同类型或数量的参数，而不需要为每种情况创建不同的函数名称。编译器根据函数调用时传递的参数类型和数量来决定调用哪个版本…...

编程日记 2024/12/8 23:38:37

JAVA ｜日常开发中连接Sqlite数据库详解

JAVA ｜日常开发中连接Sqlite数据库详解前言一、SQLite 数据库概述1.1 定义与特点1.2 适用场景二、Java 连接 SQLite 数据库的准备工作2.1 添加 SQLite JDBC 驱动依赖2.2 了解 JDBC 基础概念三、建立数据库连接3.1 代码示例3.2 步骤解析四、执行 SQL 语句4.1 创建…...

编程日记 2024/12/8 23:29:26

Java项目实战II基于微信小程序的消防隐患在线举报系统（开发文档+数据库+源码）

目录一、前言二、技术介绍三、系统实现四、核心代码五、源码获取全栈码农以及毕业设计实战开发，CSDN平台Java领域新星创作者，专注于大学生项目实战开发、讲解和毕业答疑辅导。获取源码联系方式请查看文末一、前言随着城市化进程的加快&…...

编程日记 2024/12/8 23:28:25

python编程Day12-属性和方法的分类

私有和公有在python中定义类的时候，可以给属性和方法设置访问权限，即规定在什么地方可以使用。权限一般分为两种：公有权限、私有权限公有权限定义：直接定义的属性和方法就是公有的特点： 可以在任何地方访问和使…...

编程日记 2024/12/8 23:24:21

【unity小技巧】在 Unity 中，Application获取各种文件路径或访问不同类型的存储路径

文章目录前言1. **Application.persistentDataPath**2. **Application.dataPath**3. **Application.streamingAssetsPath**4. **Application.temporaryCachePath**5. **Application.consoleLogPath**6. **Application.userDataPath**7. **Application.streamingAssetsPath 与 …...

编程日记 2024/12/8 23:22:18

c++：timer

1.设置休眠时间sleep_for 添加头文件 #include <thread> #include <iostream> #include <chrono> #include <thread>int main(int argc, char const *argv[]) {// 休眠2秒std::this_thread::sleep_for(std::chrono::seconds(2));// 休眠500毫秒std:…...

编程日记 2024/12/8 23:19:14

VSCode（四）CMake调试

1. 工具准备 1.1 C环境插件 1.2 CMake插件 2. Cmake工程 2.1 创建项目文件夹 ex:CMAKE_TEST 2.2 创建CMake工程 （shift ctl P), 选择"CMAKE: Quick Start": 2.3 填写project name: (ex: test_cmake) 2.4 选择”Executable“ 项目文件内会自动…...

编程日记 2024/12/8 23:16:11

安装Docker并使用WSL

引言 Windows Subsystem for Linux (WSL) 是一个在Windows上运行Linux二进制可执行文件（ELF格式）的兼容层。它允许开发者直接在Windows上运行Linux环境，而无需使用虚拟机。Docker是一个开源的应用容器引擎，它允许开发者打包应用以…...

编程日记 2024/12/8 23:09:03

HCIA-openGauss_2_2连接与认证

设置客户端认证策略设置配置文件参数 gssql客户端连接-确定连接信息客户端工具通过数据库主节点连接数据库，因此连接前，需要获取数据库主节点的在服务器的IP地址及数据库主节点的端口号信息。步骤1：以操作系统用户omm登录数据库主节点。…...

编程日记 2024/12/8 23:02:55

安装 pytorch lighting

1 搜寻配对版本进入lighting官网，查看配对版本比如我就选择Python3.11、torch2.4、lightning2.4.0 2 搜寻pytorch安装命令进入pytorch官网，查看以前版本的下载命令注意要选择是 gpu版本的pytorch查看自己显卡驱动命令：nvidia-smi查看…...

编程日记 2024/12/8 23:01:54

2024年12月7日历史上的今天大事件早读

1732年12月07日英国皇家大剧院在伦敦开幕 1798年12月07日清代诗人袁枚逝世 1889年12月07日第一个充气轮胎受专利保护 1916年12月07日劳合-乔治出任英国首相 1926年12月07日第一台电冰箱受美国专利保护 1937年12月07日南京保卫战正式打响 1941年12月07日日本偷袭珍珠港 1…...

编程日记 2024/12/8 22:59:52

ORB-SLAM2 ---- 非线性优化在SLAM中的应用（一）

文章目录一、为什么要讲非线性优化二、运动模型和观测模型三、最大似然估计四、SLAM中最小二乘的应用五、总结一、为什么要讲非线性优化相信大家在学习一段时间SLAM后，会发现两个问题。第一个是代码能看懂，但是不知道为什么这样做（特别是优…...

编程日记 2024/12/8 22:53:45

FastAPI中创建一个多App架构

1. 创建项目结构首先，设计一个合理的项目结构。这里以三个Apps为例：users、items 和 orders。2. 项目结构 my_fastapi_project/ ├── main.py ├── app/ │ ├── __init__.py │ ├── users/ │ │ ├── __init__.py │ │ ├─…...

编程日记 2024/12/8 22:52:44

计算机网络原理之HTTP与HTTPS

一、前言为了理解HTTP，我们有必要事先了解一下TCP/IP协议簇。通常我们使用的网络（包括互联网）是在TCP/IP协议簇的基础上运作的。而HTTP属于它内部的一个子集。计算机与网络设备要相互通信，双方必须基于相同的方法。比如&#…...

编程日记 2024/12/8 22:50:41

【网络】每天掌握一个Linux命令 - iftop

在Linux系统中，iftop是网络管理的得力助手，能实时监控网络流量、连接情况等，帮助排查网络异常。接下来从多方面详细介绍它。目录【网络】每天掌握一个Linux命令 - iftop工具概述安装方式核心功能基础用法进阶操作实战案例面试题场景生产场景…...

编程新知 2025/6/17 9:25:03

大话软工笔记—需求分析概述

需求分析，就是要对需求调研收集到的资料信息逐个地进行拆分、研究，从大量的不确定“需求”中确定出哪些需求最终要转换为确定的“功能需求”。需求分析的作用非常重要，后续设计的依据主要来自于需求分析的成果，包括: 项目的目的…...

编程新知 2025/6/28 13:47:19

渲染学进阶内容——模型

最近在写模组的时候发现渲染器里面离不开模型的定义，在渲染的第二篇文章中简单的讲解了一下关于模型部分的内容，其实不管是方块还是方块实体，都离不开模型的内容 🧱 一、CubeListBuilder 功能解析 CubeListBuilder 是 Minecraft Java 版模型系统的核心构建器，用于动态创…...

编程新知 2025/6/21 3:27:34

vue3+vite项目中使用.env文件环境变量方法

vue3vite项目中使用.env文件环境变量方法 .env文件作用命名规则常用的配置项示例使用方法注意事项在vite.config.js文件中读取环境变量方法 .env文件作用 .env 文件用于定义环境变量，这些变量可以在项目中通过 import.meta.env 进行访问。Vite 会自动加载这些环境变…...

编程新知 2025/6/30 16:30:03