算法笔记：KD树

1 引入原因

• K近邻算法需要在整个数据集中搜索和测试数据x最近的k个点，如果一一计算，然后再排序，开销过大
  • 引入KD树的作用就是对KNN搜索和排序的耗时进行改进

2 KD树

2.1 主体思路

• 以空间换时间，利用训练样本集中的样本点，沿各维度依次对k维空间进行划分，建立二叉树
• 利用分治思想提高算法搜索效率
• 二分查找的算法复杂度是O(logN)，KD树的搜索效率与之接近（取决于所构造kd-tree是否接近平衡树）

•  上图为为训练样本对空间的划分以及对应的kd树
• 绿色实心五角星为测试样本，通过kd-tree的搜索算法，快速找到与其最近邻的3个训练样本点（空心五角星标注的点）

2.2 KD树的建立

2.2.1 以一个例子引入

• 比如我有6个点：(2,3),(4,7),(5,4),(7,2),(8,1),(9,6)
• 1) 数据有两个维度，分别计算x，y方向上数据的方差
  • x方向上的方差最大
  • ——>先沿着X轴方向进行split
  • 注：这一步也可以不要，因为KD树适用的问题大多是维度小于20的，所以按照维度顺序一个一个来也没有问题
• 2）根据x轴方向的值2,5,9,4,8,7排序选出中位数为7
  • x≤7的和x ＞7的被分开了
    • 
• 3) 被分开的左半区和右半区分别选出y轴方向的中位数（偶数选小的那个）
  • 
• 4）左上方三个点再根据x轴分一刀（其他三个区域已经各只剩一个点了）
  • 
• 最终得到的KD树
  • 

2.2.2 伪代码

def kd_tree_construct:input: x: 训练样本集dim: 当前节点的分割维度（子节点的分割维度=(dim+1)%样本的维度）output: node: 构造好的kd tree的根节点if 只有一个数据点:创建一个叶子结点node包含这一单一的点node.point = x[0]node.son1 = Nonenode.son2 = Nonereturn nodeelse:记dim维度上的中位点为x（对x中的数据按dim维排序，取中位点，偶数个则取较小的那个）记xl为左集合(dim维小于p点的所有点)记xr为右集合(dim维大于p点的所有点)创建带有两个孩子的node：node.point = pnode.son1  = fit_kd_tree(xl)node.son2  = fit_kd_tree(xr)return node

2.3 KD树上的最近邻查找

2.3.1 伪代码

def kd_tree_search：global:Q, 缓存k个最近邻点（初始时包含一个无穷远点）q, 与Q对应，保存Q中各点与测试点的距离input: k, 寻找k个最近邻t, 测试点node, 当前节点（一开始时根节点）dim, 当前节点的分割维度（子节点的分割维度=(dim+1)%数据点的维度）output: 无if distance(t, node.point) < max(q)：将node.point添加到Q，并同步更新q若Q内超过k个近邻点，则移出与测试点距离最远的那个点，并同步更新qif t[dim]-max(q) < node.point[dim]:kd_tree_search(k,t,node.son1)if t[dim]+max(q) > node.point[dim]:kd_tree_search(k,t,node.son2)

2.3.1 以一个例子开始

2.3.1.1 例子1 

搜索(2.1,3.1)

记k=1

• 第1步：将(7,2)加入Q中，maxq=5.02，更新Q
  • 2.1-5.02≤7
    • 搜索左儿子
    • 第2步：将（5.4)加入Q中，maxq=3.04，更新Q
      • 3.1-3.04≤4
        • 搜索下儿子
        • 第3步：将（2，3）加入Q中，maxq=0.1414，更新Q
          • 已经是叶子节点了，结束
      • 3.1-3.04≥4
        • 搜索上儿子
        • 第4步：将（4，7）加入Q中，maxq=4.338>0.1414,不更新Q，仍为0.1414
          • 已经是叶子节点了，结束
  • 2.1-5.02≥7
    • 搜索右儿子
    • 第5步，将（9，6）加入Q中，maxq=7.484>0.1414,不更新Q，仍为0.1414
    • 3.1+7.484>6
      • 搜索上儿子
      • 没有上儿子，结束
• 算法结束，最近的点是(2,3),q=0.1414

2.3.1.2 例子2 回溯时改变最近邻点

假设我们要查询的点是2，4.5

同样记k=1

• 第1步：将(7,2)加入Q中，maxq=5.59，更新Q
  • 2-5.59≤7
    • 搜索左儿子
    • 第2步：将（5.4)加入Q中，maxq=3.04，更新Q
      • 4.5-3.04≤4
        • 搜索下儿子
        • 第3步：将（2，3）加入Q中，maxq=1.5，更新Q
      • 4.5+3.04≥4
        • 搜索上儿子
        • 第4步：将（4，7）加入Q中，maxq=3.20>1.5,不更新Q，仍为1.5
  • 2+5.59 ＞7
    • 搜索右儿子
    • 第5步，将(9,6)加入Q中，maxq=7.16>1.5,不更新Q，仍为1.5
      • 4.5+7.16>6
        • 搜索上儿子
        • 没有上儿子，结束
• 算法结束，最近的点是(2,3)，距离为1.5

参考内容：KNN的核心算法kd-tree和ball-tree - 简书 (jianshu.com)

k-d tree算法 - J_Outsider - 博客园 (cnblogs.com)