使用GSEA读‘gmt文件‘时最后一行未遂问题解决
最近工作中,使用GSEA网站自定义库下载的gmt文件用函数读取的时候报错:
这种问题在文本文件读取中经常出现,往往因为最后一行未留出/n,也就是最后一行没有换行留出空行。
可以使用notepad++打开gmt文件:
发现果然最后一行确实没有空行。
我们加上空行后,再重新运行:
这样就运行成功了。
等轮转结束会发一篇文章详细讲述各种富集分析方法及GSEA的详细用法,有什么问题可以评论区问,我看到会回复!
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