新版Mamba体验超快的软件安装
在一文掌握Conda软件安装:虚拟环境、软件通道、加速solving、跨服务器迁移中详细介绍的conda的基本使用和遇到问题的解决方式,也提到了mamba作为一个替代工具,可以很好的加速conda的solving environemnt过程。但有时也会遇到一个很尴尬的问题想用mamba就得先装mamba, 之前通过conda install mamba -n base -c conda-forge有时也会卡在solving environemnt这一步。想用mamba解决solving environemnt,就得先解决安装mamba的solving environemnt。
现在新版的mamba支持开箱即用了,下载、初始化就可以使用。
# curl micro.mamba.pm/install.sh | bash
curl -Ls https://micro.mamba.pm/api/micromamba/linux-64/latest | tar -xvj bin/micromamba./bin/micromamba shell init -s bash -p /mambaforge/source ~/.bashrc# mamba操作
micromamba activate # this activates the base environment
micromamba install python=3.10 jupyter -c conda-forge
# or
micromamba create -n env_name xtensor -c conda-forge
micromamba activate env_name 重用之前conda的环境
# 重用之前conda的环境
mkdir -p /mambaforge/envs/
ln -s /root/anaconda3/envs/* /mambaforge/envs/# 如果还是习惯之前的使用mamba或conda的习惯,可以建个软链接,换药不换汤
mkdir /mambaforge/bin
mv ./bin/micromamba /mambaforge/bin
ln -s /mambaforge/bin/micromamba /mambaforge/bin/mamba
ln -s /mambaforge/bin/micromamba /mambaforge/bin/conda 更多内容见一文掌握Conda软件安装:虚拟环境、软件通道、加速solving、跨服务器迁移
节选自 - 这个为生信学习打造的开源Bash教程真香!!!
2.4 Conda安装配置生物信息软件
2.4.1 Conda安装和配置
2.4.2 Conda基本使用
2.4.3 Conda的channel
2.4.4 创建不同的软件运行环境
2.4.5 移除某个conda环境
2.4.6 Conda配置R
2.4.7 Conda环境简化运行
2.4.8 Conda环境备份
2.4.9 Conda环境导出和导入
2.4.10 Conda软件安装 core dump error/Segment fault/段错误 怎么办
2.4.11 Conda为什么越来越慢?
2.4.12 Conda是如何工作的
2.4.13 Conda哪一步慢?
2.4.14 如何提速Conda solving environment
2.4.15 从了通道外还能怎么下载提速
2.4.16 使用conda-pack直接从已经安装好的地方拷贝一份 (同一操作系统)
往期精品(点击图片直达文字对应教程)
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