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【2022.12.9】Lammps+Python 在计算g6(r)时遇到的问题

目录

  • 写在前面
  • 绘制g6( r )执行步骤【updated】
  • 如何检查图像的正确性:
  • 不是编程问题,而是数学问题的一个小bug
  • 废稿2则:

写在前面

全部log:
【2022.11.16】Lammps+Python+MATLAB在绘制维诺图时遇到的问题

绘制g6( r )执行步骤【updated】

画了个随便看看就不对的图,老板帮忙捋了一遍步骤,发现有点小问题,现更新一下全部的步骤:
1、 导入数据
2、 利用论文中的方法找到最近邻
3、 算出每个粒子的psi6( r )
4、 列出所有粒子与粒子之间的距离【将单位从m改为了mm】。并对距离,即g6 ( r )中的r,进行四舍五入
4、 去除最外圈的粒子,对所有的粒子进行两两之间的距离groupby【也可能是generate】
5、 利用公式算出g6( r )

如何检查图像的正确性:

1、画psi6的图
或者直接根据物理性质,观察psi6的模,如如果这个晶体更像完美的晶体,那大部分粒子的psi6应该是接近1的
2、将任意两个psi6相乘
原理同上

不是编程问题,而是数学问题的一个小bug

enmmm,虽然平时做e指数加上角度的时候默认是弧度制,但是写的时候忘记了

废稿2则:

暂定模拟盒子大小:54mmX54mm
T = 30000K的第一帧的g6(r)与全部颗粒与颗粒间的间隔
T=30000K
在这里插入图片描述

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